Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,672,424 | T→C | L163P (CTC→CCC) | b1601 → | putative transport protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,672,424 | 0 | T | C | 98.7% | 797.0 / ‑0.5 | 226 | L163P (CTC→CCC) | b1601 | putative transport protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base C (125/98); total (127/99) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.15e-01 |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
GATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTG > NC_000913/1672335‑1672513 | aTGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGaa < 2:846823/93‑1 (MQ=255) aTGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGaa > 1:5088824/1‑93 (MQ=255) aTGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGaa > 2:39855/1‑93 (MQ=255) aTGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGaa < 1:2258789/93‑1 (MQ=255) aTGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTAGCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGaa < 2:5938957/93‑1 (MQ=255) tGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAg > 2:1836776/1‑93 (MQ=255) gTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGcc > 1:2986618/1‑93 (MQ=255) tGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCcac < 1:3187658/93‑1 (MQ=255) gCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCcaca > 2:1453882/1‑93 (MQ=255) cTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACaa < 1:3438051/93‑1 (MQ=255) tCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAAt > 1:2345763/1‑93 (MQ=255) cAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGcc > 2:1974486/1‑93 (MQ=255) aaCTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGccc > 1:2855917/1‑93 (MQ=255) tATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGaa > 2:111850/1‑93 (MQ=255) tATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACAGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGaa > 1:2385714/1‑93 (MQ=255) ttGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGaaaa > 1:5841923/1‑93 (MQ=255) ttGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGaaaa < 1:2318666/93‑1 (MQ=255) tGACGCAGTTATCTAATTCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAAt > 2:4647190/1‑93 (MQ=255) tGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAAt < 1:5144815/93‑1 (MQ=255) tGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAAt < 2:244871/93‑1 (MQ=255) tGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAAt < 1:1557783/93‑1 (MQ=255) cGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTc < 2:3151773/93‑1 (MQ=255) gCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCa > 1:6090253/1‑93 (MQ=255) gCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCa < 2:4916234/93‑1 (MQ=255) gCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCa > 2:5298011/1‑93 (MQ=255) gCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCa > 2:1497345/1‑93 (MQ=255) cAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAg < 2:5820017/93‑1 (MQ=255) aGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGc > 2:3122573/1‑93 (MQ=255) gTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCa > 1:416129/1‑93 (MQ=255) gTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCa > 2:501257/1‑93 (MQ=255) gTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCa > 1:1443950/1‑93 (MQ=255) ttATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACTATTGCCCGGAAAATTTCAGCaa > 1:3756502/1‑93 (MQ=255) tATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCaaa < 1:4361846/93‑1 (MQ=255) atttAATGCCATGTCATCCATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAACTTCAGCcaaa > 1:4558549/4‑92 (MQ=255) aTCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAat < 1:6110368/93‑1 (MQ=255) aTCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAat > 2:6102406/1‑93 (MQ=255) tCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatg > 1:1122142/1‑93 (MQ=255) tCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatg > 1:2894075/1‑93 (MQ=255) cTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatga < 2:1718379/93‑1 (MQ=255) cTAATGCCACGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatga > 1:3870492/1‑93 (MQ=255) aaTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatgatg < 1:2193635/93‑1 (MQ=255) aaTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatgatg < 2:2391135/93‑1 (MQ=255) aaTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAatgatg < 2:715296/93‑1 (MQ=255) aTGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATgg < 1:637456/93‑1 (MQ=255) aTGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGACACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGt > 1:838317/1‑93 (MQ=255) tGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTc < 2:2282589/93‑1 (MQ=255) gTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTcc < 1:4666428/93‑1 (MQ=255) gTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTcc < 2:4069993/93‑1 (MQ=255) tcatcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCg > 2:3333655/1‑93 (MQ=255) tcatcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCg > 1:1650486/1‑93 (MQ=255) tcatcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCGGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCg < 1:5815715/93‑1 (MQ=255) atcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGt < 1:5404475/93‑1 (MQ=255) tcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGtt < 2:1347698/93‑1 (MQ=255) tcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGtt > 1:4023114/1‑93 (MQ=255) tcaATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGtt < 2:5873340/93‑1 (MQ=255) caATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTg > 1:4448933/1‑93 (MQ=255) caATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCAGGTTg > 2:3271539/1‑93 (MQ=255) atatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGaa > 1:1215043/1‑93 (MQ=255) atatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGaa < 2:440465/93‑1 (MQ=255) atatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGaa < 1:1855844/93‑1 (MQ=255) atatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGaa < 1:5243014/93‑1 (MQ=255) tatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAg > 2:925599/1‑93 (MQ=255) tatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAg > 2:4195072/1‑93 (MQ=255) tatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAg > 2:2805718/1‑93 (MQ=255) tatTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAg > 2:4673685/1‑93 (MQ=255) atTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAgg > 1:3331710/1‑93 (MQ=255) tttttATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCGGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAggg > 2:455774/1‑93 (MQ=255) tttttATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAggg > 1:4820034/1‑93 (MQ=255) ttttATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGa > 2:2977676/1‑93 (MQ=255) ttttATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGa > 1:678144/1‑93 (MQ=255) ttATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATg < 1:3635906/93‑1 (MQ=255) tATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATgg > 2:4409010/1‑93 (MQ=255) tATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATgg < 1:92324/93‑1 (MQ=255) aTTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATggc > 1:4862287/1‑93 (MQ=255) ttGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATggcg > 1:1314967/1‑93 (MQ=255) gctgctGACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATggcggc > 2:1265416/1‑93 (MQ=255) tgctgACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGa > 2:2198502/1‑93 (MQ=255) tgctgACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGa > 2:3474099/1‑93 (MQ=255) tgctgACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGa > 2:1151608/1‑93 (MQ=255) tgctgACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGa > 1:3724736/1‑93 (MQ=255) ctgACGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGAtt < 1:4247384/93‑1 (MQ=255) aCGGTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCaa < 1:1456653/93‑1 (MQ=255) ggTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACg < 2:6149442/93‑1 (MQ=255) gTGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGt > 2:3622036/1‑93 (MQ=255) tGCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTg > 1:4992629/1‑93 (MQ=255) gCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGc < 1:1042513/93‑1 (MQ=255) gCTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGc < 1:3467371/93‑1 (MQ=255) cTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCg < 1:3053612/93‑1 (MQ=255) cTGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGAGGGCGGCGATTCAACGTGCg > 2:3439582/1‑93 (MQ=255) tGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGa > 1:5879197/1‑93 (MQ=255) tGTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGa > 2:5163074/1‑93 (MQ=255) gTTTATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGAt > 2:5376341/1‑93 (MQ=255) tttATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGGGCGAtt > 2:1396044/1‑93 (MQ=255) ttATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTg > 1:5646014/1‑93 (MQ=255) ttATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTg < 1:3494893/93‑1 (MQ=255) tATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGa < 1:2059041/93‑1 (MQ=255) tATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGa > 1:5691950/1‑93 (MQ=255) tATGCTGCCCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGa < 2:2528714/93‑1 (MQ=255) gctgccCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAg < 1:2665571/93‑1 (MQ=255) tgccCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAgtg > 1:5304928/1‑93 (MQ=255) | GATGACGTTGCTCACCAACTTATTGACGCAGTTATCTAATGCCATGTCATCAATATTTTTATTGCTGCTGACGGTGCTGTTTATGCTGCTCGAAGTGCCACAATTGCCCGGAAAATTTCAGCAAATGATGGCGCGTCCGGTTGAAGGGATGGCGGCGATTCAACGTGCGATTGACAGTG > NC_000913/1672335‑1672513 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |