Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,678,790 | T→C | S404P (TCT→CCT) | b1605 → | putative arginine/ornithine antiporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,678,790 | 0 | T | C | 98.5% | 684.4 / ‑2.5 | 197 | S404P (TCT→CCT) | b1605 | putative arginine/ornithine antiporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/1); new base C (95/98); total (97/100) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.19e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
GGCGCGTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCATGAT > NC_000913/1678700‑1678879 | ggCGCGTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCccct < 2:1477446/93‑1 (MQ=255) gcgcGTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTg < 1:3049970/93‑1 (MQ=255) cgcgTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTgg > 2:4826172/1‑93 (MQ=255) gcgTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGt < 2:5399183/93‑1 (MQ=255) gcgTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGt < 2:4227978/93‑1 (MQ=255) cgTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTc > 1:4396891/1‑93 (MQ=255) cgTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTc < 2:3081978/93‑1 (MQ=255) ttCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCa > 2:2466371/1‑93 (MQ=255) ttCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCa > 1:5506774/1‑93 (MQ=255) ttCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCa > 2:5788948/1‑93 (MQ=255) ttCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCa > 1:2475492/1‑93 (MQ=255) ttCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCa > 1:2814927/1‑93 (MQ=255) tCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCaa > 2:2280564/1‑93 (MQ=255) tCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCaa > 1:4989353/1‑93 (MQ=255) tCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCaa < 1:4582045/93‑1 (MQ=255) tCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCaa < 2:2775352/93‑1 (MQ=255) tCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCaa < 1:1150241/93‑1 (MQ=255) cTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAAt < 2:4882517/93‑1 (MQ=255) cTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAAt > 2:3037259/1‑93 (MQ=255) ttGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATg > 1:1709371/1‑93 (MQ=255) tGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGCCCAATGc > 2:4417082/1‑93 (MQ=255) gCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGcc > 2:2378095/1‑92 (MQ=255) aaaTCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGc < 1:2070058/93‑1 (MQ=255) aaTCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCt < 2:767753/93‑1 (MQ=255) aaTCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCt < 1:5602386/93‑1 (MQ=255) tCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGt < 1:2555179/93‑1 (MQ=255) gCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTa < 1:3423197/93‑1 (MQ=255) gCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTGATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTa < 2:2699606/93‑1 (MQ=255) aaCCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATc < 2:3679263/93‑1 (MQ=255) aCCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATcc > 2:2200290/1‑93 (MQ=255) cccGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCg > 1:5221324/1‑93 (MQ=255) cccGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCg > 1:4050689/1‑93 (MQ=255) ccGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCgt > 1:2634876/1‑93 (MQ=255) ccGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCgt < 2:3587230/93‑1 (MQ=255) cGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCgtt < 1:4411950/93‑1 (MQ=255) cGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCgtt < 2:2952664/93‑1 (MQ=255) cGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCgtt > 1:3788966/1‑93 (MQ=255) gTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCgttg < 1:5592453/93‑1 (MQ=255) tCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCgttgt < 2:1304226/93‑1 (MQ=255) tCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCgttgt > 2:1925335/1‑93 (MQ=255) ccACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCgttgtt > 2:5169986/1‑93 (MQ=255) cACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTc < 1:1262506/93‑1 (MQ=255) cACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTc < 1:952985/93‑1 (MQ=255) aCTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCt > 1:490711/1‑93 (MQ=255) aCTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCt > 1:5778678/1‑93 (MQ=255) cTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTg < 1:1590748/93‑1 (MQ=255) gCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTa < 1:2124494/93‑1 (MQ=255) cATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTAt < 1:4665296/93‑1 (MQ=255) aTAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATg > 2:2881966/1‑93 (MQ=255) tAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGc < 2:478058/93‑1 (MQ=255) aaaGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCa < 1:2585547/93‑1 (MQ=255) ggTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCggg < 1:5678231/93‑1 (MQ=255) tAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGgc < 2:4696922/93‑1 (MQ=255) aGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGgct < 1:2380949/93‑1 (MQ=255) aGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGGTTTCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGgct > 1:5073403/1‑93 (MQ=255) aGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGGTATTTGACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATTCGTTGTTCTGTATGCACCGGGgct > 1:5299565/1‑93 (MQ=255) gtgtCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGgctgc < 1:3614911/93‑1 (MQ=255) tgtCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGgctgct < 2:2626110/93‑1 (MQ=255) tCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTgg > 1:4110300/1‑93 (MQ=255) tCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCACTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTgg < 2:4544585/93‑1 (MQ=255) ggTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGtt < 2:4072274/93‑1 (MQ=255) ggTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGtt > 1:2719706/1‑93 (MQ=255) gTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGttt > 2:613083/1‑93 (MQ=255) tGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGtttt > 2:1084523/1‑93 (MQ=255) gCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTc > 2:1225076/1‑93 (MQ=255) gCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTc > 2:179283/1‑93 (MQ=255) ccTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTcc < 1:1941542/93‑1 (MQ=255) ccTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTcc > 2:3336794/1‑93 (MQ=255) ccTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGCTTTcc > 2:4206555/1‑93 (MQ=255) cTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCt < 1:3907139/93‑1 (MQ=255) cTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCt < 1:3852804/93‑1 (MQ=255) cTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCt < 1:587498/93‑1 (MQ=255) gCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGt > 2:4388397/1‑93 (MQ=255) gCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGt < 2:1636638/93‑1 (MQ=255) cATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTa < 2:6039850/93‑1 (MQ=255) cATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTa < 1:967408/93‑1 (MQ=255) tttATGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTAcg < 1:1875861/93‑1 (MQ=255) tGGCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTAcgcgcg > 2:2240415/1‑93 (MQ=255) ggCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACgcgcgc > 1:3526620/1‑93 (MQ=255) ggCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACgcgcgc < 2:593140/93‑1 (MQ=255) gCTTATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCa > 1:1090753/1‑93 (MQ=255) ttATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCaaa > 2:1617983/1‑93 (MQ=255) tATGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCaaaa > 2:3661535/1‑93 (MQ=255) aTGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAAc < 1:772265/93‑1 (MQ=255) tGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACg > 1:6043109/1‑93 (MQ=255) tGGTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACg < 1:2406832/93‑1 (MQ=255) gTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGGAAAACGCa > 1:5619237/1‑93 (MQ=255) gTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCa > 1:3881466/1‑93 (MQ=255) gTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCa > 1:2193477/1‑93 (MQ=255) gTTATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCa > 2:834825/1‑93 (MQ=255) ttATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCAt < 1:59516/93‑1 (MQ=255) ttATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCAt < 2:5064475/93‑1 (MQ=255) tATTGTACGCCCCTGGTCCAGTGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATa < 1:1008824/93‑1 (MQ=255) tATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGTTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATa > 2:728351/1‑93 (MQ=255) tATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATa < 2:3704799/93‑1 (MQ=255) tATTGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATa > 1:5378521/1‑93 (MQ=255) ttGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATAcc < 1:5053672/93‑1 (MQ=255) tGTACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATAccc > 2:4705828/1‑93 (MQ=255) tACGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCAt > 1:484103/1‑93 (MQ=255) cGCCCCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCATGa > 1:3428479/1‑93 (MQ=255) | GGCGCGTTCTTGCTGAAAATCGCAACCCGTCCACTGCATAAAGCGGTAGGTGTCGGTGCCTGCATTTATGGCTTATGGTTATTGTACGCCTCTGGTCCAATGCACTTGCTGTTATCCGTTGTTCTGTATGCACCGGGGCTGCTGGTTTTCCTGTACGCGCGCAAAACGCATACCCATGAT > NC_000913/1678700‑1678879 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |