| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,015,142 | T→C | S189S (AGT→AGC) | fliI → | flagellum‑specific ATP synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,015,142 | 0 | T | C | 94.7% | 477.4 / 8.5 | 152 | S189S (AGT→AGC) | fliI | flagellum‑specific ATP synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/4); new base C (70/74); total (74/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 | |||||||||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
GGACACCGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGATT > NC_000913/2015052‑2015230 | ggACACCGGCCTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAgcgt < 2:3514710/93‑1 (MQ=255) acacCGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGtgc < 1:302628/93‑1 (MQ=255) cacCGCCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGtgct < 2:4290151/93‑1 (MQ=255) acCGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGtgctg < 1:5194967/93‑1 (MQ=255) cGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTgctgct < 2:5711484/93‑1 (MQ=255) cGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTgctgct < 1:1711128/93‑1 (MQ=255) ggCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGctgctg > 2:3777397/1‑93 (MQ=255) gCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTgg > 1:1619298/1‑93 (MQ=255) gTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTgggg < 1:5977884/93‑1 (MQ=255) tGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTGCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTggggg > 1:4938375/1‑92 (MQ=255) tGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGga > 2:1496109/1‑93 (MQ=255) tGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGga < 1:3934781/93‑1 (MQ=255) gcgcCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGgat < 2:1146235/93‑1 (MQ=255) gcCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGgatga < 2:313284/93‑1 (MQ=255) cccAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGgatgag > 2:1665576/1‑92 (MQ=255) ccAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGatgatg < 1:5842763/93‑1 (MQ=255) ccAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGatgatg < 1:3693954/93‑1 (MQ=255) caatcaatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATgg > 1:3573372/1‑93 (MQ=255) aatcaatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGc > 2:2898174/1‑93 (MQ=255) aatcaatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGc > 2:1296254/1‑93 (MQ=255) aatcaatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGc > 1:132029/1‑93 (MQ=255) aatcaatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGc < 2:400926/93‑1 (MQ=255) atcaatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATggag > 2:1238544/1‑91 (MQ=255) atcaatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATggaa > 2:2284160/1‑91 (MQ=255) caatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACg > 1:1971619/1‑93 (MQ=255) caatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACg < 1:4168807/93‑1 (MQ=255) aatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGt > 1:4284979/1‑93 (MQ=255) aatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGt > 1:2265763/1‑93 (MQ=255) aatGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGt < 1:3041230/93‑1 (MQ=255) atGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGtt > 2:2037867/1‑93 (MQ=255) tGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTa > 1:6130355/1‑93 (MQ=255) gCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTac < 1:3822595/93‑1 (MQ=255) ccTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGTGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGTAGGATGGCACGTTacac > 2:5476374/1‑93 (MQ=255) ccTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTacac > 2:5106825/1‑93 (MQ=255) ccTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTacac < 2:268385/93‑1 (MQ=255) ccTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTacac > 2:6128607/1‑93 (MQ=255) cTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACAcc < 2:5880152/93‑1 (MQ=255) cTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACAcc < 1:1546303/93‑1 (MQ=255) tGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACAccc > 1:435594/1‑93 (MQ=255) tGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACAccc > 2:6007692/1‑93 (MQ=255) tGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACAccc > 1:3160477/1‑93 (MQ=255) gCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCcg < 1:2913779/93‑1 (MQ=255) gTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGAt > 1:4394707/1‑93 (MQ=255) ttGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATg < 2:2491377/93‑1 (MQ=255) gCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCAt < 1:5846930/93‑1 (MQ=255) gTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTg < 1:1600194/93‑1 (MQ=255) ggggCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTCCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGt < 1:3049642/92‑1 (MQ=255) gggCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTc < 1:2937597/93‑1 (MQ=255) gCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGt < 2:775099/93‑1 (MQ=255) gCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTggg < 2:4637974/93‑1 (MQ=255) gCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTggg > 2:5559728/1‑93 (MQ=255) gTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTgggct > 2:3747566/1‑91 (MQ=255) tATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGttt > 2:1494876/1‑93 (MQ=255) tATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGttt > 1:4524654/1‑93 (MQ=255) tATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGttt > 1:5705096/1‑93 (MQ=255) tATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGttt > 2:881085/1‑93 (MQ=255) tATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGttt > 1:3466938/1‑93 (MQ=255) aTGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTg > 1:2687551/1‑93 (MQ=255) tGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGa > 2:4485204/1‑93 (MQ=255) gggCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGAtt < 2:976702/93‑1 (MQ=255) gggCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGAtt < 2:3938043/93‑1 (MQ=255) ggCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTg > 1:1933735/1‑93 (MQ=255) gCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTgg < 1:2174652/93‑1 (MQ=255) gCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTgg < 2:2735504/93‑1 (MQ=255) cTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTggg > 1:5025248/1‑92 (MQ=255) cTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGt < 2:4777840/93‑1 (MQ=255) tGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTg > 2:4893040/1‑93 (MQ=255) tGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTg > 1:4114939/1‑93 (MQ=255) agTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCAGCTGGGGATGAAGGCACGTTACACCCACGACGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTg < 1:4763245/92‑1 (MQ=255) tttGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGaa < 1:2750778/93‑1 (MQ=255) tGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACg < 1:4444199/93‑1 (MQ=255) gCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGt < 2:3069802/93‑1 (MQ=255) ccGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTg > 1:3400250/1‑93 (MQ=255) gggTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTggg < 1:1119804/93‑1 (MQ=255) gggTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTggg < 1:2526044/93‑1 (MQ=255) gggTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTggg < 1:5223687/93‑1 (MQ=255) ggTCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGgc > 2:5824431/1‑93 (MQ=255) tCCGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGgcgc > 2:5265982/1‑93 (MQ=255) tCCGGCGTTGGTAAAAGCGGGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGgcgc > 2:3956405/1‑93 (MQ=255) ccGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGcgcg > 2:5536771/1‑93 (MQ=255) ccGGCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGcgcg > 1:748841/1‑93 (MQ=255) ggCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGaa < 2:4545354/93‑1 (MQ=255) ggCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGaa > 1:4832718/1‑93 (MQ=255) gCGTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAg > 1:3299906/1‑93 (MQ=255) ggTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGt < 2:4297667/92‑1 (MQ=255) gTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAgaa > 1:92488/1‑91 (MQ=255) gTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTa > 2:352549/1‑93 (MQ=255) gTTGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTa > 1:4013704/1‑93 (MQ=255) ttGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTaa < 1:4884048/93‑1 (MQ=255) ttGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTaa < 2:4707815/93‑1 (MQ=255) ttGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTaa > 2:2133435/1‑93 (MQ=255) ttGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTaa > 2:2524669/1‑93 (MQ=255) ttGGTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTaa < 1:1663343/93‑1 (MQ=255) ggTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTaaaa < 2:4949783/93‑1 (MQ=255) ggTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTaaaa < 2:1793291/93‑1 (MQ=255) gTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAg < 2:1229894/93‑1 (MQ=255) gTAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAg < 2:360769/93‑1 (MQ=255) tAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGa < 1:3200847/93‑1 (MQ=255) tAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGa < 1:1775332/93‑1 (MQ=255) tAAAAGCGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGa > 1:1094831/1‑93 (MQ=255) | GGACACCGGCGTGCGCCCAATCAATGCCCTGCTTACCGTTGGGCGTGGGCAGCGTATGGGGCTGTTTGCCGGGTCCGGCGTTGGTAAAAGTGTGCTGCTGGGGATGATGGCACGTTACACCCGCGCCGATGTCATTGTCGTGGGTTTGATTGGTGAACGTGGGCGCGAAGTAAAAGATT > NC_000913/2015052‑2015230 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |