Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,313,133 | T→C | P542P (CCT→CCC) | yojN → | putative 2‑component sensor protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,313,133 | 0 | T | C | 99.5% | 769.4 / ‑4.6 | 211 | P542P (CCT→CCC) | yojN | putative 2‑component sensor protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (114/96); total (114/97) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.60e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.89e-01 |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
GAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCTGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACG > NC_000913/2313043‑2313222 | gAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTtgcccgc > 1:1208664/1‑93 (MQ=255) aaCATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTtgcccgcc < 1:4695874/93‑1 (MQ=255) cATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCAt < 2:5849140/93‑1 (MQ=255) aTGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATc > 1:1769151/1‑93 (MQ=255) aTGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATc < 1:1669219/93‑1 (MQ=255) tGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCa > 1:4043986/1‑93 (MQ=255) tGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCa > 1:5602572/1‑93 (MQ=255) gCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCaa > 2:4027191/1‑93 (MQ=255) ttGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGc > 1:1296206/1‑93 (MQ=255) ttGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGc > 1:880085/1‑93 (MQ=255) tGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCg < 1:141775/93‑1 (MQ=255) gCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGt < 1:1866627/93‑1 (MQ=255) ggATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTaa > 1:1897737/1‑93 (MQ=255) ggATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTaa > 2:5676573/1‑93 (MQ=255) ggATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTaa > 1:4835578/1‑93 (MQ=255) ggATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGGGTTGCCCGCCATCAAGCGTaa < 2:2878374/93‑1 (MQ=255) gatgatAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTaaa > 2:1329119/1‑93 (MQ=255) gatgatAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTaaa < 2:3643554/93‑1 (MQ=255) tgatAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAgg > 1:2770489/1‑93 (MQ=255) tgatAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAgg > 1:677827/1‑93 (MQ=255) tgatAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAgg > 2:3180473/1‑93 (MQ=255) tgatAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAgg < 2:5062042/93‑1 (MQ=255) atAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTc < 2:1070837/93‑1 (MQ=255) tAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCt > 2:5824882/1‑93 (MQ=255) tAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCt > 1:5217834/1‑93 (MQ=255) tGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCaa < 1:4990315/93‑1 (MQ=255) tGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCaa > 1:4086313/1‑93 (MQ=255) tGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCaa > 1:1139053/1‑93 (MQ=255) ggAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAAc > 2:1809855/1‑93 (MQ=255) aaaGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAActgc > 2:3517463/1‑93 (MQ=255) aaaGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAActgc > 2:5190539/1‑93 (MQ=255) aGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAActgctg > 1:3666187/1‑93 (MQ=255) gTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGa > 1:2803187/1‑93 (MQ=255) gTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGa > 1:3910855/1‑93 (MQ=255) tGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGAt < 2:5155976/93‑1 (MQ=255) gaCGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTaa > 2:4269781/1‑93 (MQ=255) gcGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAAc < 1:3606040/92‑1 (MQ=255) cGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACa > 2:172247/1‑93 (MQ=255) ggTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACaa < 2:569466/93‑1 (MQ=255) gTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAat > 2:2936676/1‑93 (MQ=255) gTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAat > 2:3675417/1‑93 (MQ=255) gTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAat > 1:4930074/1‑93 (MQ=255) gTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAat < 2:2720693/93‑1 (MQ=255) gTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAat > 2:6013319/1‑93 (MQ=255) tGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAatc > 1:94592/1‑93 (MQ=255) gCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAatca > 1:3051971/1‑93 (MQ=255) gCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAatca < 1:4645688/93‑1 (MQ=255) cTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAatcat > 2:2104598/1‑93 (MQ=255) cTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAatcat > 1:5913253/1‑93 (MQ=255) cTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAatcat < 2:605414/93‑1 (MQ=255) tGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAatcatc > 1:1044446/1‑93 (MQ=255) tGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAatcatc > 2:1658799/1‑93 (MQ=255) tGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAatcatc > 2:1217263/1‑93 (MQ=255) gTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCt > 1:250051/1‑93 (MQ=255) ttttcCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTg < 1:2272928/90‑1 (MQ=255) ctcCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGaa < 1:4277238/93‑1 (MQ=255) tcCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGaaa > 1:796532/1‑93 (MQ=255) tcCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGaaa > 1:4190867/1‑93 (MQ=255) ccGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAg > 2:2825310/1‑93 (MQ=255) cGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGc < 2:3552707/93‑1 (MQ=255) gTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGca < 2:3094003/93‑1 (MQ=255) gCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGcaca > 2:1022787/1‑93 (MQ=255) gCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGcaca > 2:4800576/1‑93 (MQ=255) gCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGcaca > 1:5749015/1‑93 (MQ=255) gCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGcaca < 2:5942940/93‑1 (MQ=255) gCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGGCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGcaca > 2:3446791/1‑93 (MQ=255) cAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCacac < 1:4958268/93‑1 (MQ=255) cAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAACCacac > 2:5269835/1‑93 (MQ=255) aGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACg > 2:4310640/1‑93 (MQ=255) ggATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGa > 2:3300776/1‑93 (MQ=255) gATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGat < 1:3148893/93‑1 (MQ=255) aTTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAACGCCCACGata > 2:4692804/1‑93 (MQ=255) tttAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGatat < 1:477634/93‑1 (MQ=255) ttAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATg < 1:2959795/93‑1 (MQ=255) ttAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATg < 1:3111274/93‑1 (MQ=255) tAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATgc < 1:2666127/93‑1 (MQ=255) tAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATgc < 2:1430415/93‑1 (MQ=255) aTTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATgcgc > 1:2301295/1‑93 (MQ=255) atgaAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCcgcg < 2:2007247/93‑1 (MQ=255) atgaAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCcgcg > 2:1831453/1‑93 (MQ=255) aaGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCgcggcg > 2:4999864/1‑93 (MQ=255) gTTGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGAt < 1:309347/93‑1 (MQ=255) ttGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATc < 2:5294340/93‑1 (MQ=255) ttGTGCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATc < 2:4158840/93‑1 (MQ=255) tgtgCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATcg > 2:3250560/1‑93 (MQ=255) gtgCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATcgc > 1:371222/1‑93 (MQ=255) gtgCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATcgc > 2:11609/1‑93 (MQ=255) gtgCCTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATcgc > 1:565159/1‑93 (MQ=255) ccTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGAt < 1:2218408/93‑1 (MQ=255) cTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGAtc > 2:2847686/1‑92 (MQ=255) cTTCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATg < 1:3411577/93‑1 (MQ=255) ttCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGc > 1:288805/1‑93 (MQ=255) tCAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGcc > 1:160863/1‑93 (MQ=255) cAGTGTTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCt < 1:3284918/93‑1 (MQ=255) tgtTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACATTCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTac < 2:3880762/93‑1 (MQ=255) tgtTGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTac < 1:1951793/93‑1 (MQ=255) ttGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTacga < 2:3929699/93‑1 (MQ=255) ttGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTacga > 2:2573530/1‑93 (MQ=255) ttGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTacga > 1:351764/1‑93 (MQ=255) ttGCCCGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTAATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTacga > 1:608519/1‑93 (MQ=255) | GAACATGCTTGCGGATGATAGCTGGAAAAGTGAGACGGTGCTGTTCTCCGTGCAGGATTTAATTGATGAAGTTGTGCCTTCAGTGTTGCCTGCCATCAAGCGTAAAGGTCTGCAACTGCTGATTAACAATCATCTGAAAGCACACGATATGCGCCGCGGCGATCGCGATGCCTTACGACG > NC_000913/2313043‑2313222 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |