| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,896,819 | +C | coding (622/657 nt) | ygcU ← | putative oxidoreductase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,896,818 | 1 | . | C | 99.6% | 855.8 / ‑3.8 | 231 | coding (623/657 nt) | ygcU | putative oxidoreductase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (129/101); total (129/102) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.65e-01 | |||||||||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
TCCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑C‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTT > NC_000913/2896726‑2896905 | tCCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTg > 1:2194838/1‑93 (MQ=255) ccAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑c < 2:5427869/93‑1 (MQ=255) ccAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑c < 2:4697089/93‑1 (MQ=255) ggATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccga > 2:2234603/1‑90 (MQ=255) ggATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccga < 1:3937997/93‑4 (MQ=255) ggATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccga > 1:4696897/1‑90 (MQ=255) gATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑ccgat > 2:3101810/1‑89 (MQ=255) tataGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑gatga < 2:3743024/93‑1 (MQ=255) tataGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑gatga < 2:6047699/93‑1 (MQ=255) tataGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑gatga > 1:2355687/1‑93 (MQ=255) ataGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑gatgat < 2:5098220/93‑1 (MQ=255) aGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑gatgatga < 2:705140/93‑1 (MQ=255) aGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑gatgatga < 1:2387546/93‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑gatgatgat > 1:4839747/1‑93 (MQ=255) gCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑gatgatgat > 2:4398277/1‑93 (MQ=255) ccGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑Gatgatgatg > 2:4817492/1‑93 (MQ=255) cGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGAtgt < 2:2282383/93‑1 (MQ=255) cGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGAtgt > 1:2495088/1‑93 (MQ=255) tAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGa < 1:4613572/93‑1 (MQ=255) agagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGaa < 1:635459/93‑1 (MQ=255) agagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGaa > 2:2014456/1‑93 (MQ=255) gagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAAt > 2:3409142/1‑93 (MQ=255) gagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAAt > 2:9559/1‑93 (MQ=255) agGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATg < 1:5656528/93‑1 (MQ=255) agGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATg < 2:6273445/93‑1 (MQ=255) agGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATg > 1:2595498/1‑93 (MQ=255) ggTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGt > 1:1493674/1‑93 (MQ=255) ttgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCACTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTcc > 2:3565072/1‑93 (MQ=255) tgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCg < 1:6237087/93‑1 (MQ=255) tgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCg < 1:1433779/93‑1 (MQ=255) ttttCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCggg < 1:2315860/93‑1 (MQ=255) tCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCa > 1:208508/1‑93 (MQ=255) ccGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAg < 1:5535026/93‑1 (MQ=255) cGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGc > 2:3186392/1‑93 (MQ=255) cGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGc < 1:5219110/93‑1 (MQ=255) cGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGc < 1:2014843/93‑1 (MQ=255) ggggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGcc > 2:3921154/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcg < 1:5335284/93‑1 (MQ=255) gggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcg > 2:5519317/1‑93 (MQ=255) ggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgc < 2:1638404/93‑1 (MQ=255) gTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgcg > 1:3657025/1‑93 (MQ=255) ttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGt > 1:6297197/1‑93 (MQ=255) tAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTg > 1:3622766/1‑93 (MQ=255) tAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTg < 2:6081575/93‑1 (MQ=255) aaGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGc > 2:1368897/1‑93 (MQ=255) aGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCa > 1:1760355/1‑93 (MQ=255) aGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCa < 2:3265620/93‑1 (MQ=255) tttCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCATCCGCGCGGCGAGGCACGtt < 1:6484366/93‑1 (MQ=255) tCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGtttt < 2:3301394/93‑1 (MQ=255) tCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGtttt < 1:4495577/93‑1 (MQ=255) aCTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTa > 2:4129525/1‑93 (MQ=255) aCTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTa > 2:4649236/1‑93 (MQ=255) aCTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTa > 1:1659232/1‑93 (MQ=255) aCTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTa > 1:2699085/1‑93 (MQ=255) aCTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTa > 2:566653/1‑93 (MQ=255) cTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTaa > 2:76008/1‑93 (MQ=255) cTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTaa > 2:2984827/1‑93 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt > 2:5199693/1‑93 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt > 1:1133548/1‑93 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt > 1:5832385/1‑93 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt < 1:6513569/93‑1 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt > 2:1223327/1‑93 (MQ=255) ttACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTTAttc > 2:4513747/1‑91 (MQ=255) ttACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGc < 2:1884460/93‑1 (MQ=255) tACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCg < 2:428768/93‑1 (MQ=255) tACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCg > 1:4373484/1‑93 (MQ=255) tACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑CAGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCg < 2:5125641/93‑1 (MQ=255) aCTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgt < 1:1846988/93‑1 (MQ=255) cTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtg > 2:1096591/1‑93 (MQ=255) cTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtg > 1:6085196/1‑93 (MQ=255) tCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGtgtg < 1:781446/93‑1 (MQ=255) tCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGtgtg > 1:5558611/1‑93 (MQ=255) tCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGtgtg > 1:1725936/1‑93 (MQ=255) cAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGa > 1:4022642/1‑93 (MQ=255) aGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGAc > 1:3117671/1‑93 (MQ=255) gTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACg > 1:3199014/1‑93 (MQ=255) tGATATAGCACAATGCGCCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACgg < 1:3816140/93‑1 (MQ=255) tGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACgg > 2:1902791/1‑93 (MQ=255) tGATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACgg > 2:5032458/1‑93 (MQ=255) gATATAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGt < 1:5939274/93‑1 (MQ=255) atatAGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTg > 2:4765885/1‑93 (MQ=255) tataGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGc > 2:1550981/1‑93 (MQ=255) ataGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGcc < 2:3343468/93‑1 (MQ=255) ataGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGcc > 1:2123577/1‑93 (MQ=255) taGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCa > 1:1040739/1‑93 (MQ=255) taGCACAATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCa < 2:2466540/93‑1 (MQ=255) acaATGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAg > 1:4076590/1‑93 (MQ=255) tGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCaa > 2:6502159/1‑93 (MQ=255) tGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCaa < 2:1009660/93‑1 (MQ=255) tGCACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCaa > 2:2661207/1‑93 (MQ=255) cACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATa < 2:45352/93‑1 (MQ=255) cACCTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATa > 1:1951907/1‑93 (MQ=255) ccTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACt > 1:6387867/1‑93 (MQ=255) ccTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACt < 2:2400246/93‑1 (MQ=255) ccTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACt > 2:4323859/1‑93 (MQ=255) cTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTg < 1:5064589/93‑1 (MQ=255) cTTCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTg > 2:203292/1‑93 (MQ=255) tCGTTGCC‑GNTGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCNCGGNGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCt > 2:5415297/1‑93 (MQ=255) tCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCt < 2:2828015/93‑1 (MQ=255) tCGTTGCC‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCt < 1:3006315/93‑1 (MQ=255) | TCCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCGTTG‑C‑GATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCTT > NC_000913/2896726‑2896905 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |