| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,237,247 | +C | intergenic (+60/‑337) | ygjT → / → ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,237,245 | 1 | . | C | 99.2% | 468.7 / ‑3.5 | 132 | intergenic (+58/‑339) | ygjT/ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base C (92/39); total (93/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
ATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑T‑CCTCT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGG > NC_000913/3237156‑3237332 | aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑c‑tccctct‑cc > 1:313680/1‑93 (MQ=255)aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑c‑tccctct‑cc > 2:2734421/1‑93 (MQ=255)aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑c‑tccctct‑cc > 1:2505665/1‑93 (MQ=255) ttATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑c‑tccctct‑ccc < 2:1908330/93‑2 (MQ=255) ttATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑c‑tccctct‑ccc > 2:6211902/1‑92 (MQ=255) tATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGAGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑c‑tccctct‑ccct < 1:2656131/93‑3 (MQ=255) aTCGGCATGATAAGCAGCTGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑c‑tccctct‑ccctt > 2:3657107/1‑90 (MQ=255) aTCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑c‑tccctct‑ccctt > 1:6337102/1‑90 (MQ=255) aTCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCC‑TGTACCCTGTCATTTACATGAGCACCGTTTTt‑t‑t‑cctct‑cccctc > 2:6077980/1‑89 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑c‑tccctct‑cccttc > 1:4184904/1‑89 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCa > 2:1818321/1‑93 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCa < 2:6377895/93‑1 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAg < 1:1329389/93‑1 (MQ=255) caggATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAgg < 1:4561186/90‑1 (MQ=255) cATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAgg > 1:5219946/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGga > 2:4345567/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGga < 1:1361483/93‑1 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGga > 1:866854/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGga < 1:5950295/93‑1 (MQ=255) gATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGCGCACCG‑TTAT‑CTT‑CCTCTCCCTTCCAGGgag > 2:1723108/1‑93 (MQ=255) gATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGgag > 1:2808001/1‑93 (MQ=255) gATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGgag < 2:5038803/93‑1 (MQ=255) gATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGgag > 1:345327/1‑93 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGgaga > 1:345387/1‑93 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGgaga < 1:1885319/93‑1 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGagag < 2:36691/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 2:2719633/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 2:2691099/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TCTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGt > 2:818316/1‑93 (MQ=255) gcagcGGGGGGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGt > 2:2935072/1‑93 (MQ=255) cagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTc < 2:1638791/93‑1 (MQ=255) cagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTc < 2:5529010/93‑1 (MQ=255) agcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCg < 1:5941661/93‑1 (MQ=255) agcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCg < 2:861207/93‑1 (MQ=255) agcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCg < 2:630210/93‑1 (MQ=255) gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgg > 1:6400072/1‑93 (MQ=255) gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgg > 2:3972790/1‑93 (MQ=255) ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgggg < 1:2768181/93‑1 (MQ=255) gtgTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt < 1:1683442/91‑1 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCggggg > 1:2221755/1‑92 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCggggg > 2:837529/1‑92 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt > 2:6597063/1‑93 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt < 1:1094257/93‑1 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt > 1:2291925/1‑93 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTg > 1:4116926/1‑93 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTg > 1:403691/1‑93 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTg > 2:3928500/1‑93 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTg < 2:1112844/93‑1 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTg < 2:4928155/93‑1 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa < 1:4829293/93‑1 (MQ=255) ggATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAgg > 1:3953754/1‑93 (MQ=39) ggATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAgg > 2:6522266/1‑93 (MQ=39) tAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAgggga > 2:605133/1‑91 (MQ=38) aaTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTaa > 1:6157216/1‑93 (MQ=38) tttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtt > 2:171561/1‑93 (MQ=38) tttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtt > 2:2005182/1‑93 (MQ=38) ttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttt > 1:6647281/1‑93 (MQ=38) ttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttt > 1:5895415/1‑93 (MQ=38) aTCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGc > 1:1838211/1‑93 (MQ=38) tGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCAcc > 2:3232901/1‑93 (MQ=38) tGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGAGAGGGTAATTTTTCGCAcc > 2:538957/1‑93 (MQ=38) gCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCg > 2:2968238/1‑93 (MQ=38) cTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGAt > 1:1035910/1‑93 (MQ=38) cTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGAt > 2:522068/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATg > 2:2451415/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATg > 1:2451835/1‑93 (MQ=38) aaGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGc > 1:861625/1‑93 (MQ=37) aaGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGc > 2:748423/1‑93 (MQ=37) aaGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGc > 2:3410937/1‑93 (MQ=38) ccGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTgg > 2:1273169/1‑93 (MQ=37) gtgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGcc > 2:232268/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 2:5480661/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 1:5051845/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 1:427826/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGGAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 1:5598033/1‑93 (MQ=37) gtACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTg > 1:1285387/1‑93 (MQ=37) tACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑t > 2:4045072/1‑93 (MQ=38) tACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑t > 2:3106556/1‑93 (MQ=37) cccTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTc > 2:472910/1‑93 (MQ=37) ccTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGTGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTcc > 2:2020161/1‑93 (MQ=37) cTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTccc > 1:2047483/1‑93 (MQ=25) cTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCCGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTtcc > 1:6091422/1‑93 (MQ=37) tGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTcccc > 1:3258063/1‑93 (MQ=37) tCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTc > 1:6312543/1‑93 (MQ=25) gcATTAACATGAGCACCG‑TTTTCC‑C‑CCTCTCCCTTCCAGGGAGACGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTc < 2:1667545/92‑1 (MQ=21) aTTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTtccccccc > 1:3853377/1‑89 (MQ=25) cATGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTTCccccccccccc > 1:3742839/1‑90 (MQ=25) aTGAGCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGCGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑CTcccccccccccccc > 1:5610048/1‑89 (MQ=21) gCACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCTAACCctc > 1:4272111/1‑93 (MQ=18) cACCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCCCCCCCACCctct > 1:698968/1‑93 (MQ=18) aCCG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCTAACCCtctc > 1:1023340/1‑93 (MQ=18) ccG‑TTTT‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCCCCCCCCCCCAAcccctcc > 2:5109506/1‑89 (MQ=18) ttt‑C‑TCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTTTCCTCCCCCCCACCCTCTccccca > 1:4756074/1‑91 (MQ=18) tccctctcccTTCCAGGGAGCGGGTCGGGGCGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCCCGCTAAACCTCTCGCCCAAccg > 1:3082250/3‑91 (MQ=18) tccctctcccTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACgg > 2:4391017/3‑93 (MQ=255) tccctctcccTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCTAAACCTCTCCCCCAACgg > 1:853142/3‑93 (MQ=18) ccctctcccTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTTCCCCCCCCCCCACCCTCCCCCCacacacg > 2:1498877/2‑90 (MQ=18) ccctctcccTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCCAACggg > 1:5328322/2‑93 (MQ=18) ccctctcccTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACggg > 1:5465351/2‑93 (MQ=255) ccctctcccTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACcgg > 1:5396325/2‑93 (MQ=18) | ATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCG‑TTTT‑C‑T‑CCTCT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGG > NC_000913/3237156‑3237332 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |