| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,156,257 | (CCA)2→1 | coding (594‑596/930 nt) | yqhG → | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3156256 | 1 (0.000) | 258 (1.030) | 127/178 | 0.2 | 99.6% | coding (593/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | 3156260 = | 1 (0.000) | coding (597/930 nt) | yqhG | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACA > NC_000913/3156164‑3156348 | aGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA < 2:4582277‑M1/93‑1 (MQ=255) aaacAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAg < 1:5499067‑M1/92‑2 (MQ=255) aaCAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAgg > 2:4192326‑M1/1‑91 (MQ=255) aaCAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAgg > 2:6408348‑M1/1‑91 (MQ=255) aCAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggc < 1:1580663‑M1/93‑4 (MQ=255) cAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcg > 2:6186784‑M1/1‑89 (MQ=255) gCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggt < 1:4240133‑M1/93‑7 (MQ=255) gCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggt > 1:5987192‑M1/1‑87 (MQ=255) ccGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggtt < 1:4081502‑M1/93‑8 (MQ=255) cGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggtta > 1:1521012‑M1/1‑85 (MQ=255) cGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggtta > 2:1714890‑M1/1‑85 (MQ=255) ggAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaa > 1:1433573‑M1/1‑84 (MQ=255) gAAGCCTTTGTTGGCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaat > 1:6535541‑M1/1‑83 (MQ=255) gAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaat > 2:2845455‑M1/1‑83 (MQ=255) aGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgc > 1:320470‑M1/1‑81 (MQ=255) aGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgc > 1:5380548‑M1/1‑81 (MQ=255) gCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgcc > 1:1766223‑M1/1‑80 (MQ=255) gCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgcc < 2:405784‑M1/93‑14 (MQ=255) ccTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgcct > 2:3249507‑M1/1‑79 (MQ=255) ccTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgcct < 1:2429403‑M1/93‑15 (MQ=255) ccTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgcct > 2:3337717‑M1/1‑79 (MQ=255) tttGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGGTTATAGCTGGCCGTGGACGTGGCTGGTTTCCGACTCTTACAGCCAggcgggtaatgacttc > 1:330857‑M1/1‑77 (MQ=255) tttGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttc < 1:6394818‑M1/93‑17 (MQ=255) tgttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttcta < 1:4614933‑M1/93‑19 (MQ=255) gttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctat < 2:4758521‑M1/93‑20 (MQ=255) cGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaac > 2:2457390‑M1/1‑69 (MQ=255) cGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaac > 2:2896079‑M1/1‑69 (MQ=255) gAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaacc > 1:238923‑M1/1‑68 (MQ=255) aaCTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaacca < 1:849552‑M1/93‑27 (MQ=255) aCTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccac < 1:1205238‑M1/93‑28 (MQ=255) ctctTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccacc < 2:1659192‑M1/93‑29 (MQ=255) tctTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccacct > 2:5562751‑M1/1‑64 (MQ=255) ctTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctgtaaaaccacctt > 1:4016706‑M1/1‑63 (MQ=255) ctTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccacctt < 1:3787502‑M1/93‑31 (MQ=255) tttGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttc < 1:4566018‑M1/93‑32 (MQ=255) tGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaa > 2:2755504‑M1/1‑60 (MQ=255) tGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaa < 1:25503‑M1/93‑34 (MQ=255) tGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaa > 1:2753135‑M1/1‑60 (MQ=255) gAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaag < 2:5960225‑M1/93‑35 (MQ=255) aaCATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaaga < 1:3356685‑M1/93‑36 (MQ=255) aCATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagac < 2:3939046‑M1/93‑37 (MQ=255) atatTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacgg > 1:2027998‑M1/1‑55 (MQ=255) atatTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcgggtaatgccttctataaagccaccttcaagacgg > 2:589320‑M1/1‑55 (MQ=255) tatTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggc < 2:1358874‑M1/93‑40 (MQ=255) tatTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggc < 1:4418410‑M1/93‑40 (MQ=255) tatTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggc > 1:1147230‑M1/1‑54 (MQ=255) atTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggcc < 1:775276‑M1/93‑41 (MQ=255) atTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggca > 2:2211810‑M1/1‑53 (MQ=255) ttGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggcca < 1:2052058‑M1/93‑42 (MQ=255) ttGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggcca < 2:3217762‑M1/93‑42 (MQ=255) tGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaa < 2:3046904‑M1/93‑43 (MQ=255) gCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaat < 2:1831531‑M1/93‑44 (MQ=255) tGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataa > 2:5397078‑M1/1‑48 (MQ=255) ttATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcc > 2:4794973‑M1/1‑45 (MQ=255) ttATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcc < 1:3512705‑M1/93‑49 (MQ=255) tataGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatccc < 1:4989758‑M1/93‑50 (MQ=255) tataGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatccc < 2:744443‑M1/93‑50 (MQ=255) aGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgat < 1:1846862‑M1/93‑53 (MQ=255) aGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgat < 1:3123394‑M1/93‑53 (MQ=255) gCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatg < 1:1055309‑M1/93‑54 (MQ=255) cTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggctaataatcccgatga < 2:2994755‑M1/93‑55 (MQ=255) tGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaa < 2:5036142‑M1/93‑56 (MQ=255) ggCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaag > 2:4325554‑M1/1‑37 (MQ=255) ggCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaag > 1:2901564‑M1/1‑37 (MQ=255) gCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaaga < 2:1487728‑M1/93‑58 (MQ=255) tGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatg > 2:1165935‑M1/1‑32 (MQ=255) tGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatg < 1:3017268‑M1/93‑62 (MQ=255) ggACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaanccaccttcaagacggcnaataatcccgatgngnatangc > 2:2032061‑M1/1‑31 (MQ=255) ggACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgc < 2:6623172‑M1/93‑63 (MQ=255) ggACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgc > 1:5152324‑M1/1‑31 (MQ=255) ggACGTGGGTGGTGTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgc < 1:4917758‑M1/93‑63 (MQ=255) cGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaa < 2:861611‑M1/93‑66 (MQ=255) gtgggtggTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaat < 2:3547625‑M1/93‑67 (MQ=255) gggtggTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatag > 2:6441233‑M1/1‑25 (MQ=255) gggtggTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatag > 2:5751223‑M1/1‑25 (MQ=255) ggtggtTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaataga < 1:1124986‑M1/93‑70 (MQ=255) tggtTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaac < 2:4398900‑M1/93‑72 (MQ=255) ggtTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacg < 1:6654624‑M1/93‑73 (MQ=255) 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tctTACCGCCAggccgttaattccttctaaaaaacccccttcaagaccgccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaatttatt < 2:5089065‑M1/93‑83 (MQ=255) ctTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaatttattt < 2:3175877‑M1/93‑84 (MQ=255) ctTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaatttattt < 2:1056766‑M1/93‑84 (MQ=255) aCCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaatttatttacg > 1:3739951‑M1/1‑7 (MQ=255) aCCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaatttatttacg > 1:5878586‑M1/1‑7 (MQ=255) aCCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaatttatttacg > 1:918163‑M1/1‑7 (MQ=255) cGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaatttatttacgac < 2:2932116‑M1/93‑89 (MQ=255) ccAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaatttatttacgacaa > 1:5798621‑M1/1‑3 (MQ=255) ccAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaatttatttacgacaa < 1:1314096‑M1/93‑91 (MQ=255) cAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaatttatttacgacaat > 1:3973861‑M1/1‑2 (MQ=255) cAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaatttatttacgacaat > 1:2109784‑M1/1‑2 (MQ=255) aggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaatttatttacgacaatc > 2:4974872‑M1/1‑1 (MQ=255) aggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaatttatttacgacaatc > 1:2653270‑M1/1‑1 (MQ=255) aggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaatttatttacgacaatc < 2:679674‑M1/93‑93 (MQ=255) | AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACA > NC_000913/3156164‑3156348 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |