Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 2,875,936 | Δ61 bp | intergenic (+295/+596) | iap → / ← ygbF | Iap/hypothetical protein |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 2875936 | 2875996 | 61 | 178 [1] | [0] 178 | iap/ygbF | Iap/hypothetical protein |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2875935 | 1 (0.000) | 108 (0.630) | 65/122 | 2.1 | 99.7% | intergenic (+294/+657) | iap/ygbF | Iap/hypothetical protein |
? | NC_000913 | 2875997 = | 0 (0.000) | intergenic (+356/+595) | iap/ygbF | Iap/hypothetical protein |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
CCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTC > NC_000913/2875905‑2876089 | ggcggtttatccccgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactct > 1:3577777‑M2/93‑93 (MQ=255) ggcggtttatccccgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactct < 2:5960061‑M2/1‑1 (MQ=255) cggtttatccccgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTgg < 2:1982321‑M2/3‑1 (MQ=255) ggtttatccccgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTggg < 2:562983‑M2/4‑1 (MQ=255) ggtttatccccgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTggg < 1:406875‑M2/4‑1 (MQ=255) gtttatccccgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGggc > 1:5786160‑M2/89‑93 (MQ=255) gtttatccccgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGggc < 2:2362871‑M2/5‑1 (MQ=255) ttatccccgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGggcgg > 2:5371467‑M2/87‑93 (MQ=255) ttatccccgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcactgggcactcTGggagg > 1:1361860‑M2/87‑93 (MQ=255) tatccccgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGggcggc > 2:6460463‑M2/86‑93 (MQ=255) cccgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGcttgc > 2:5456172‑M2/82‑93 (MQ=255) cccgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGcttgc < 2:5577153‑M2/12‑1 (MQ=255) cgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGcttgcct < 1:1028622‑M2/14‑1 (MQ=255) cgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGcttgcct < 2:1415306‑M2/14‑1 (MQ=255) cgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGcttgcct < 2:3227232‑M2/14‑1 (MQ=255) cgctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGcttgcct < 1:3241124‑M2/14‑1 (MQ=255) gctaacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGcttgcctt > 2:2811206‑M2/79‑93 (MQ=255) taacgcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGcttgccttgc < 1:655036‑M2/17‑1 (MQ=255) gcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGcagcc > 1:6149432‑M2/73‑93 (MQ=255) gcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGcagcc > 1:6198529‑M2/73‑93 (MQ=255) gcggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGcagcc < 2:2971524‑M2/21‑1 (MQ=255) cggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTCGGCGGCTTGCGTTtcagccc > 1:5185629‑M2/72‑92 (MQ=255) ggggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGcagccag > 2:1480487‑M2/71‑93 (MQ=255) ggaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCt > 2:6134282‑M2/69‑93 (MQ=255) gaactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTc < 2:1265428‑M2/26‑1 (MQ=255) aactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTcc < 2:4740800‑M2/27‑1 (MQ=255) aactcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTcc < 2:394796‑M2/27‑1 (MQ=255) actcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCca < 2:4859870‑M2/28‑1 (MQ=255) tcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCcagc > 2:2757900‑M2/64‑93 (MQ=255) tcgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCcagc < 1:1132885‑M2/30‑1 (MQ=255) cgtagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCcagca < 2:4143457‑M2/31‑1 (MQ=255) tagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCagcagc < 1:2674500‑M2/33‑1 (MQ=255) tagtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCagcagc < 1:5720261‑M2/33‑1 (MQ=255) agtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCg > 2:2613690‑M2/60‑93 (MQ=255) agtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCg > 2:1026583‑M2/60‑93 (MQ=255) agtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCg > 1:700357‑M2/60‑93 (MQ=255) agtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCg > 2:3570725‑M2/60‑93 (MQ=255) gtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCgg < 2:2396265‑M2/35‑1 (MQ=255) gtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCgg < 2:6174048‑M2/35‑1 (MQ=255) gtccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCgg < 2:5172679‑M2/35‑1 (MQ=255) tccatcatgccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGt > 1:6491032‑M2/58‑93 (MQ=255) ccatcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGtt > 2:4239197‑M2/57‑93 (MQ=255) catcattccacctatgtctgacctcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGttt < 2:4331013‑M2/38‑1 (MQ=255) catcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGttt > 1:597934‑M2/56‑93 (MQ=255) catcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGttt > 2:1067343‑M2/56‑93 (MQ=255) atcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTa < 2:1336176‑M2/39‑1 (MQ=255) tcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTAt < 2:3771046‑M2/40‑1 (MQ=255) tcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTAt > 2:6379301‑M2/54‑93 (MQ=255) tcattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTAt > 2:5097733‑M2/54‑93 (MQ=255) cattccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATc > 1:542073‑M2/53‑93 (MQ=255) ccacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCg > 2:554158‑M2/49‑93 (MQ=255) cacctatgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGc < 1:333913‑M2/46‑1 (MQ=255) acctatgtctgacctcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCt < 1:171330‑M2/47‑1 (MQ=255) atgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGgcg > 1:2040323‑M2/43‑93 (MQ=255) atgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGgcg < 1:4943682‑M2/51‑1 (MQ=255) atgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGgcg > 2:5445814‑M2/43‑93 (MQ=255) tgtctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGTCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGgcgc < 2:3024955‑M2/52‑1 (MQ=255) tctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaattcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCgg < 1:2189458‑M2/54‑1 (MQ=255) tctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCgg < 1:6045327‑M2/54‑1 (MQ=255) ctgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCTCggg < 1:4424761‑M2/55‑1 (MQ=255) tgaactcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCgggg > 2:5532164‑M2/38‑93 (MQ=255) aactcccggtttatcccgcctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGaa < 2:3509301‑M2/58‑1 (MQ=255) ctcccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACt > 1:4655758‑M2/34‑93 (MQ=255) cccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCa < 1:4486679‑M2/62‑1 (MQ=255) ccggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCaa < 2:6524692‑M2/63‑1 (MQ=255) ggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCTCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAgc > 1:2971169‑M2/29‑93 (MQ=255) ggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGGACTCAAgc > 1:5836586‑M2/29‑93 (MQ=255) ggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAgc < 1:5553643‑M2/65‑1 (MQ=255) ggtttatccccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAgc > 2:2012947‑M2/29‑93 (MQ=255) cccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCtggctggc < 1:3601460‑M2/73‑1 (MQ=255) ccgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCa > 2:375879‑M2/20‑93 (MQ=255) cgctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCaa < 2:6492888‑M2/75‑1 (MQ=255) gctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAAt < 1:6576903‑M2/76‑1 (MQ=255) ctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAAtc < 1:141684‑M2/77‑1 (MQ=255) ctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAAtc > 1:388623‑M2/17‑93 (MQ=255) ctggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAAtc < 2:942792‑M2/77‑1 (MQ=255) tggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAAtct < 2:1572475‑M2/78‑1 (MQ=255) ggcgcggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAatctt > 2:4283737‑M2/15‑92 (MQ=255) 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ggggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCg < 1:5190055‑M2/84‑1 (MQ=255) gggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGGACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCgg > 2:2667708‑M2/9‑93 (MQ=255) gggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCgg > 2:4531806‑M2/9‑93 (MQ=255) gggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCgg < 2:3834549‑M2/85‑1 (MQ=255) ggaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCggg < 2:4871091‑M2/86‑1 (MQ=255) gaactcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCgggg < 2:5007668‑M2/87‑1 (MQ=255) actcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTg > 2:6070977‑M2/5‑93 (MQ=255) actcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTg < 2:1147177‑M2/89‑1 (MQ=255) ctcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGa < 1:1942735‑M2/90‑1 (MQ=255) tcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAg > 2:3158245‑M2/3‑93 (MQ=255) tcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAg > 2:628785‑M2/3‑93 (MQ=255) tcTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAg < 2:6580459‑M2/91‑1 (MQ=255) tGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTc < 2:1534078/93‑1 (MQ=255) tGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTc < 1:5049106/93‑1 (MQ=255) | CCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCCCGGGGGATAATGTTTACGGTCATGCGCCCCCCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCTGGGCGGCTTGCCTTGCAGCCAGCTCCAGCAGCGGTTTATCCCCGCTGGCGCGGGGAACTCAAGCTGGCTGGCAATCTCTTTCGGGGTGAGTC > NC_000913/2875905‑2876089 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |