| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,329,673 | T→C | V201A (GTT→GCT) | topA → | DNA topoisomerase type I omega protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,329,673 | 0 | T | C | 87.2% | 475.2 / 54.1 | 180 | V201A (GTT→GCT) | topA | DNA topoisomerase type I omega protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (13/10); new base C (63/94); total (76/104) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
TGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATCTG > NC_000913/1329583‑1329762 | tGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTc > 2:4988434/1‑93 (MQ=255) ggACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCg > 2:2288909/1‑93 (MQ=255) gACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGc > 2:6307045/1‑93 (MQ=255) aCCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGcc > 1:781885/1‑93 (MQ=255) aCCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGcc < 2:1984445/93‑1 (MQ=255) cgggtggtgGGGTATATGGTTGCGCGGCTGATATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtg < 1:3640714/90‑1 (MQ=255) cgcgTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtg < 1:3230414/93‑1 (MQ=255) gcgTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCtgg > 2:415826/1‑93 (MQ=255) gcgTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtgg > 2:1805030/1‑93 (MQ=255) gcgTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCGCGCCtgg > 2:739068/1‑93 (MQ=255) cgTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtggt < 1:446464/93‑1 (MQ=255) cgTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtggt < 1:5497170/93‑1 (MQ=255) tggtggGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtggtgg < 2:6117354/93‑1 (MQ=255) tggtggCGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtggtgg < 2:5663680/93‑1 (MQ=255) tggaggGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCtggtgg > 1:4818221/1‑93 (MQ=255) ggtggGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTggtggt < 2:688826/93‑1 (MQ=255) tggGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCg < 2:2737103/93‑1 (MQ=255) gggTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCgag > 2:2149330/1‑93 (MQ=255) gTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCgagcg < 2:1625462/93‑1 (MQ=255) atatGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCgagcgtg < 2:2254393/93‑1 (MQ=255) atGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCgagcgtgag > 1:2684837/1‑93 (MQ=255) tgttttCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCgagcgtgagc < 1:2999840/90‑1 (MQ=255) gTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCgagcgtgagcgt < 1:1293113/93‑1 (MQ=255) gTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCgagcgtgagcgt < 2:134086/93‑1 (MQ=255) tttCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGagcgtgagcgtg < 1:1638162/93‑1 (MQ=255) tttCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGagcgtgagcgtg < 1:6135569/93‑1 (MQ=255) ttCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAgcgtgagcgtga < 2:3374676/93‑1 (MQ=255) tCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGaa > 1:2415980/1‑93 (MQ=255) tCGCCGCTGCTATGGAAAAAGAGCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGaa < 1:1926297/93‑1 (MQ=255) cgccgcTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGaaa > 2:4452988/1‑93 (MQ=255) ccgcTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAAtt < 1:1024084/93‑1 (MQ=255) cgcTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGCGGTCGAGCGTGAGCGTGCAAGTa > 1:3760511/1‑93 (MQ=255) ctgctATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTaaa < 1:1151271/93‑1 (MQ=255) ctgctATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTaaa < 2:599710/93‑1 (MQ=255) tgctATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAg > 1:4353589/1‑93 (MQ=255) tctATGGAAAAATATCGCTCTGGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGc < 1:1615529/92‑1 (MQ=255) gctATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGGGTGAAATTAAAGc > 2:5368520/1‑93 (MQ=255) gctATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGc > 1:4487857/1‑93 (MQ=255) gctATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGc < 2:6070859/93‑1 (MQ=255) gctATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGAGAGAAATTaaaac > 2:5745054/1‑91 (MQ=255) tATGGAAAAAGATGGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGt < 1:1693542/93‑1 (MQ=255) aTGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGtt > 1:1398579/1‑93 (MQ=255) aTGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGtt < 2:4700408/93‑1 (MQ=255) aTGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGGGGTCGAGCGGGGGCGGGAAATTAAAACGtt > 1:2045775/1‑93 (MQ=255) tGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTc > 1:3934379/1‑93 (MQ=255) tGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTc < 1:3013152/93‑1 (MQ=255) tGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTc < 1:5433230/93‑1 (MQ=255) ggAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCg < 1:3995197/93‑1 (MQ=255) gAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGt < 2:5823425/93‑1 (MQ=255) gAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGt < 1:4639925/93‑1 (MQ=255) aaaaaGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTg > 2:2328144/1‑93 (MQ=255) aaaGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGcc > 1:4316633/1‑93 (MQ=255) aaaGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGcc < 2:397847/93‑1 (MQ=255) aaGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCg < 1:2352752/93‑1 (MQ=255) gATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGa > 2:3638536/1‑93 (MQ=255) aTCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGaa > 1:4829167/1‑93 (MQ=255) tCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAag < 2:3836635/93‑1 (MQ=255) gCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAagag > 1:4560510/1‑93 (MQ=255) cTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGt < 2:6557180/93‑1 (MQ=255) tCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGtt > 2:6379065/1‑93 (MQ=255) tCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGtt < 2:3024329/93‑1 (MQ=255) gTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGGGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCt > 2:1448105/1‑93 (MQ=255) tGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTg < 2:4926647/93‑1 (MQ=255) ggCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTgg < 2:919565/93‑1 (MQ=255) ggCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTgg < 2:2415997/93‑1 (MQ=255) gCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTggg < 2:2853088/93‑1 (MQ=255) gCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTggg > 1:2467382/1‑93 (MQ=255) cTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGaa > 2:3930378/1‑93 (MQ=255) cTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGaa > 2:190800/1‑93 (MQ=255) tGTCTCCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAg < 1:5203732/93‑1 (MQ=255) gTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGt < 2:2506770/93‑1 (MQ=255) tCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTCGCGGCTCGCCTGGTGGTCGATCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTc < 1:1528911/93‑1 (MQ=255) gCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGAt < 2:4634286/93‑1 (MQ=255) gCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGAt > 2:4298765/1‑93 (MQ=255) gCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGAt > 1:4967279/1‑93 (MQ=255) gcGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATg < 1:172877/92‑1 (MQ=255) ggTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGcc < 2:1140407/93‑1 (MQ=255) ggTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCCGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGcc > 1:6521086/1‑93 (MQ=255) ggTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTAGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGcc > 1:6440993/1‑93 (MQ=255) gTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCa < 1:6034141/93‑1 (MQ=255) gTCGTGTGCAGTCGGTGGCGCCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTTCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCa < 1:5974207/93‑1 (MQ=255) tCGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAg < 1:5808628/93‑1 (MQ=255) cGTGTGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGc < 2:5426310/93‑1 (MQ=255) gtgtGCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCa > 1:5306714/1‑93 (MQ=255) tgtgCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCAc < 1:2714239/93‑1 (MQ=255) tgtgCAGTCGGTGGCGGCTCGCGTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCAc < 2:6417060/93‑1 (MQ=255) tgtgCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCAc < 2:3544803/93‑1 (MQ=255) gCAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGAc < 2:2899613/93‑1 (MQ=255) cAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGAcc < 1:5729462/93‑1 (MQ=255) cAGTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGAcc < 1:637354/93‑1 (MQ=255) gTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCAc > 1:1935362/1‑93 (MQ=255) gTCGGTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCAc > 2:5203512/1‑93 (MQ=255) ggTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGcc < 2:36952/93‑1 (MQ=255) ggTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGcc > 1:2943926/1‑93 (MQ=255) cgTGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGcc < 1:5271967/92‑1 (MQ=255) tGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCAt > 1:1010748/1‑93 (MQ=255) tGGCGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCAt < 2:3486814/93‑1 (MQ=255) ggcggcTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATc > 1:3157750/1‑93 (MQ=255) cGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATCTg > 2:1169158/1‑93 (MQ=255) cGGCTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCATGCCATCTg < 1:6505135/93‑1 (MQ=255) | TGGACCGCGTGGTGGGGTATATGGTTTCGCCGCTGCTATGGAAAAAGATCGCTCGTGGCCTGTCTGCCGGTCGTGTGCAGTCGGTGGCGGTTCGCCTGGTGGTCGAGCGTGAGCGTGAAATTAAAGCGTTCGTGCCGGAAGAGTTCTGGGAAGTCGATGCCAGCACGACCACGCCATCTG > NC_000913/1329583‑1329762 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |