Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,134,357 | C→T | P303P (CCG→CCA) | wza ← | putative polysaccharide export protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,134,357 | 0 | C | T | 87.4% | 733.2 / 71.5 | 246 | P303P (CCG→CCA) | wza | putative polysaccharide export protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (20/11); new base T (109/106); total (129/117) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.80e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.42e-01 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
TTCTGTCGCCATCACCAGCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAGGGTCATGCCGC > NC_000913/2134267‑2134445 | ttCTGTCGCCATCACCAGCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTgg > 2:2370944/1‑93 (MQ=255) cTGTCGCCATCACCAGCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGAc < 2:6448659/93‑1 (MQ=255) tGTCGCCATCACCAGCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACg > 1:2785266/1‑93 (MQ=255) gTCGCCATCACCAGCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGa > 2:873887/1‑93 (MQ=255) tCGCCATCACCAGCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGaa < 2:4197229/93‑1 (MQ=255) tCGCCATCACCAGCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGaa > 2:625639/1‑93 (MQ=255) cGCCATCACCAGCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAAt > 1:4656056/1‑93 (MQ=255) cATCACCAGCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGAc > 1:5757716/1‑93 (MQ=255) cACCAGCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACaaa < 1:1814554/93‑1 (MQ=255) aCCAGCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAg > 2:4612433/1‑93 (MQ=255) ccAGCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGa < 2:2106197/93‑1 (MQ=255) cAGCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGAt < 1:2614649/93‑1 (MQ=255) aGCGACGTGGCATCGGACGTATCCAGCTGGTAGATATTGGGAATCTTGCCGTGACGCCCGACCTCGTCTTTCTGTGTGCGAATGACCAAGATg > 1:4872377/1‑93 (MQ=255) gCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGc > 1:6506221/1‑93 (MQ=255) gCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGc < 2:5432948/93‑1 (MQ=255) aCGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGc > 1:5973391/1‑93 (MQ=255) cGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCt < 2:1979279/93‑1 (MQ=255) ggCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGc < 1:4235677/93‑1 (MQ=255) gCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCg < 1:3225304/93‑1 (MQ=255) cATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGt < 2:3274321/93‑1 (MQ=255) tCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTGGCCTTTCACCGACCGATTACCAAAGAGGCC‑CCGGCGtttg > 2:2063124/1‑91 (MQ=255) tCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTg > 2:4630139/1‑93 (MQ=255) tCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTg > 1:3967628/1‑93 (MQ=255) tCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTg > 1:1232327/1‑93 (MQ=255) ggACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGa < 1:4823754/93‑1 (MQ=255) gACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAg > 2:3701610/1‑93 (MQ=255) atatCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAggtg > 1:3518206/1‑93 (MQ=255) tatCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAggtgg > 1:1387623/1‑93 (MQ=255) tCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTc > 1:2758055/1‑93 (MQ=255) ccAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCa > 1:1518242/1‑93 (MQ=255) ccAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCa > 1:3736916/1‑93 (MQ=255) ccAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCa > 2:2920613/1‑93 (MQ=255) cAGCTGGTNGNTATTGGCAATCTTNCNGTNACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGACAt < 1:1150920/93‑1 (MQ=255) cAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCAt > 1:2319248/1‑93 (MQ=255) aGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATg > 1:5204154/1‑93 (MQ=255) aGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATg > 2:6605734/1‑93 (MQ=255) gCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGt > 1:4355755/1‑93 (MQ=255) gCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGt > 1:3804261/1‑93 (MQ=255) tGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCg > 2:6526064/1‑93 (MQ=255) tGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCg > 1:2682252/1‑93 (MQ=255) ggTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGa > 1:6580563/1‑93 (MQ=255) ggTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGa > 2:384242/1‑93 (MQ=255) gTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGAt > 1:2098617/1‑93 (MQ=255) gTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGAt < 1:3175464/93‑1 (MQ=255) gTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGAt > 2:1386757/1‑93 (MQ=255) gTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCCTTCAGTTGACGAATGACAAAGATGCAGCTGGCGATGGAGGTTGTCATTGCGAt > 1:3591075/1‑93 (MQ=255) tAGATATTGGCTATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATg > 1:5011963/1‑93 (MQ=255) gATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGcc < 2:2225495/93‑1 (MQ=255) gATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGcc < 1:4327158/93‑1 (MQ=255) gATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGcc > 1:4697795/1‑93 (MQ=255) tatTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCtt > 2:2658774/1‑93 (MQ=255) tatTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCtt < 1:1203366/93‑1 (MQ=255) atTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTc < 1:6164397/93‑1 (MQ=255) tGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAg > 1:2651847/1‑93 (MQ=255) ggCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGc > 1:4441907/1‑93 (MQ=255) gCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCa < 1:3443076/93‑1 (MQ=255) cAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCAt > 1:1624941/1‑93 (MQ=255) aaTCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCAtt > 2:5755115/1‑93 (MQ=255) aTCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTg > 2:5888328/1‑93 (MQ=255) aTCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTg > 1:937000/1‑93 (MQ=255) aTCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTg > 2:1945075/1‑93 (MQ=255) tCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGc < 1:368675/93‑1 (MQ=255) cTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGcc < 2:4536550/93‑1 (MQ=255) ttGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGccc < 1:538175/93‑1 (MQ=255) ttGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGccc > 2:1790070/1‑93 (MQ=255) ttGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGccc < 1:4064092/93‑1 (MQ=255) ttGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGccc > 2:251615/1‑93 (MQ=255) ttGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGccc < 1:5331278/93‑1 (MQ=255) ttGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGccc < 2:682834/93‑1 (MQ=255) gCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAg < 1:4319099/93‑1 (MQ=255) gCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAg < 2:3347239/93‑1 (MQ=255) gCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAg < 2:1707304/93‑1 (MQ=255) ccGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAgg > 2:178488/1‑93 (MQ=255) gTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCTTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGc > 2:4327760/1‑93 (MQ=255) gTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGc > 1:802247/1‑93 (MQ=255) ttACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCt > 1:1755091/1‑93 (MQ=255) ttACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCt < 2:6244506/93‑1 (MQ=255) ttACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCt > 2:4731134/1‑93 (MQ=255) ttACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCt > 1:6244916/1‑93 (MQ=255) tACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCtt > 1:742993/1‑93 (MQ=255) tACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCtt < 2:5997942/93‑1 (MQ=255) aCGCCCGCCCTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTtc > 2:414880/1‑93 (MQ=255) ccgcccTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTtcagtc > 2:3047374/1‑93 (MQ=255) ccgcccTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTtcagtc < 2:5693596/93‑1 (MQ=255) gcccTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTtcagtcag > 2:3486267/1‑93 (MQ=255) cccTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTGGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAgg > 2:3449508/1‑93 (MQ=255) cccTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAgg > 2:4858085/1‑93 (MQ=255) ccTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAggg < 2:1254732/93‑1 (MQ=255) ccTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAggg > 2:3102395/1‑93 (MQ=255) cTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAGGGt < 2:1638170/93‑1 (MQ=255) cTCGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAGGGt > 1:254572/1‑93 (MQ=255) cGCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAGGGTCa > 1:2398758/1‑93 (MQ=255) cGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAGGGTCa > 2:3733733/1‑93 (MQ=255) gCCTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAGGGTCAt < 1:1891110/93‑1 (MQ=255) ccTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAGGGTCATg > 2:5095841/1‑93 (MQ=255) ccTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAGGGTCATg > 1:4523487/1‑93 (MQ=255) cTTTCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAGGGTCATGc < 1:1715685/93‑1 (MQ=255) tttCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAGGGTCATGcc > 1:3336947/1‑93 (MQ=255) tCAGTGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAGGGTCATGCCGc < 2:4217829/93‑1 (MQ=255) tCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAGGGTCATGCCGc < 2:5342715/93‑1 (MQ=255) | TTCTGTCGCCATCACCAGCGACGTGGCATCGGACATATCCAGCTGGTAGATATTGGCAATCTTGCCGTTACGCCCGCCCTCGCCTTTCAGCGGACGAATGACAAAGATGCCGCTGGCGTTGGAGGTGGTCATGTCGATGCCTTCAGCATTGCCCAGGGCTTCAGTCAGGGTCATGCCGC > NC_000913/2134267‑2134445 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |