| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 348,519 | T→C | V205A (GTG→GCG) | prpB → | putative phosphonomutase 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 348,519 | 0 | T | C | 84.0% | 507.6 / 85.0 | 214 | V205A (GTG→GCG) | prpB | putative phosphonomutase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (20/14); new base C (92/87); total (113/101) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.48e-01 | |||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
GCAGGCCTATGTTGAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCATGTCGCAATGGCGCTGTA > NC_000913/348427‑348609 | aGGCCTATGTTGAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGgcgc < 2:5920285/93‑1 (MQ=255) aGGCCTATGTTGAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGgcgc > 2:4255835/1‑93 (MQ=255) aGGCCTATGTTGAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGgcgc < 1:83122/93‑1 (MQ=255) aGGCCTATGTTGAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGgcgc < 1:3165275/93‑1 (MQ=255) gCCTATGTTGAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCg < 2:4499237/93‑1 (MQ=255) gCCTATGTTGAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCg > 1:1912715/1‑93 (MQ=255) ccTATGTTGAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGa < 1:1207175/93‑1 (MQ=255) ccTATGTTGAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGa > 1:5169999/1‑93 (MQ=255) ccTATGTTGAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGa > 1:2337065/1‑93 (MQ=255) tGTTGAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCt > 2:6186015/1‑93 (MQ=255) tGTTGAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCt > 2:241557/1‑93 (MQ=255) tGTTGAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCt < 1:370499/93‑1 (MQ=255) gTTGAAGTGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTc < 2:5872625/93‑1 (MQ=255) ttGAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCg < 2:1221445/93‑1 (MQ=255) gAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGcc > 1:4241221/1‑93 (MQ=255) gAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGAGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGcc > 1:4806052/1‑93 (MQ=255) aGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCaa > 2:2867105/1‑93 (MQ=255) aGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCaa > 2:1104803/1‑93 (MQ=255) gCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGACCTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAAc > 2:3328319/1‑93 (MQ=255) ggTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATc < 1:3927792/93‑1 (MQ=255) ggTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATc > 1:4367908/1‑93 (MQ=255) ggTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATc > 1:4432122/1‑93 (MQ=255) gTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCa < 1:5878134/93‑1 (MQ=255) tGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCGGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCAc < 1:4903628/93‑1 (MQ=255) gCCTAGATGTTTTTCCCGGAGGCGATTACCGACCTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCAcc < 1:6422542/93‑1 (MQ=255) cGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGa > 1:5623483/1‑93 (MQ=255) gagaTGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGaa > 2:1702988/1‑93 (MQ=255) agaTGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAAt < 2:3998678/93‑1 (MQ=255) agaTGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAAt > 1:1335322/1‑93 (MQ=255) agaTGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAAt > 1:5379041/1‑93 (MQ=255) gaTGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAAtt > 2:4210345/1‑93 (MQ=255) gttgttCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTgg < 1:401281/93‑1 (MQ=255) gttgttCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTgg > 1:2792956/1‑93 (MQ=255) ttgttCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGt > 1:6317545/1‑93 (MQ=255) ttgttCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGt < 2:3798127/93‑1 (MQ=255) tgttCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTg > 1:5522684/1‑93 (MQ=255) ttCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGcc > 2:4128232/1‑93 (MQ=255) ttCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGcc < 1:2911358/93‑1 (MQ=255) tCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCa > 2:3654622/1‑93 (MQ=255) cccGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGGCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCAc > 1:2089239/1‑93 (MQ=255) cGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCAcgc > 2:6134200/1‑93 (MQ=255) cGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCAcgc > 1:1993968/1‑93 (MQ=255) ggAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCAcgcc > 1:4959664/1‑93 (MQ=255) aGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCAcgccgc < 2:236878/93‑1 (MQ=255) aGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCAcgccgc < 1:2625674/93‑1 (MQ=255) aGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCAcgccgc > 2:4657688/1‑93 (MQ=255) aGGCGATGCCCGAACTCGCCATGTTCCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCAcgccgc < 1:168484/93‑1 (MQ=255) ggCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCt > 2:2023401/1‑93 (MQ=255) ggCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCt < 1:3770431/93‑1 (MQ=255) cGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGt < 1:1893274/93‑1 (MQ=255) gATTACCGAACTCGCCATGTCCCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGtt < 1:2172944/93‑1 (MQ=255) gATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGtt < 2:1607171/93‑1 (MQ=255) gATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGtt < 2:2116313/93‑1 (MQ=255) aTTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGttt > 1:449239/1‑93 (MQ=255) ttACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTa > 1:1060515/1‑93 (MQ=255) ttACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTa > 1:4579707/1‑93 (MQ=255) aCCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTacc > 1:5738366/1‑93 (MQ=255) ccGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTacca < 2:1889621/93‑1 (MQ=255) cGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTaccac < 1:4293118/93‑1 (MQ=255) gAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTaccacc < 2:1319332/93‑1 (MQ=255) aCTCGCCATGTACTGCCAGTTTGCCGATGCGTTGCAGGCGCTGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACcga < 1:2972311/93‑1 (MQ=255) aCTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACcga < 2:4815712/93‑1 (MQ=255) tCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACcgacg > 2:5283292/1‑93 (MQ=255) tCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACcgacg < 1:6521532/93‑1 (MQ=255) cGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACcgacga > 1:6486575/1‑93 (MQ=255) gCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGaa > 2:2262141/1‑93 (MQ=255) gCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGaa > 1:3542244/1‑93 (MQ=255) ccATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAAt > 1:404393/1‑93 (MQ=255) cATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAAtt < 2:4765958/93‑1 (MQ=255) aTGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTa > 1:2589301/1‑93 (MQ=255) aTGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTa < 1:3378971/93‑1 (MQ=255) tGTACCCCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTAc < 2:3192129/93‑1 (MQ=255) gTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACg > 2:6364676/1‑93 (MQ=255) gTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACg < 2:6488899/93‑1 (MQ=255) gTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACg > 1:3473030/1‑93 (MQ=255) tACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGc > 2:2679538/1‑93 (MQ=255) tACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGGGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGGATTACga > 1:6172381/1‑92 (MQ=255) aCCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCa < 2:3175003/93‑1 (MQ=255) aCCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCa < 1:943546/93‑1 (MQ=255) ccGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAg < 2:5265289/93‑1 (MQ=255) ccGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAg < 2:5110582/93‑1 (MQ=255) ccGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAg < 2:324655/93‑1 (MQ=255) ccGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAg > 2:5569407/1‑93 (MQ=255) cGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAgc < 2:6639125/93‑1 (MQ=255) cAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGcc > 2:3495291/1‑93 (MQ=255) gTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCa < 1:1634837/93‑1 (MQ=255) gTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCa < 2:3960242/93‑1 (MQ=255) gTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCa < 2:373578/93‑1 (MQ=255) gTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCa < 2:537569/93‑1 (MQ=255) gTTTGCCGATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCa < 2:2942124/93‑1 (MQ=255) ttGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCATg > 2:4940791/1‑93 (MQ=255) ttGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCATg < 1:3091173/93‑1 (MQ=255) ttGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCATg < 1:743768/93‑1 (MQ=255) cGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCATGTCGc > 2:1663415/1‑93 (MQ=255) gATGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCATGTCGCa > 1:3648805/1‑93 (MQ=255) tGCGGTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCATGTCGCAAt < 1:2773501/93‑1 (MQ=255) ggTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCATGTCGCAATgga > 2:3065404/1‑92 (MQ=255) ggTGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCATGTCGCAATGgc > 2:5025882/1‑93 (MQ=255) gTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCATGTCGCAATGgcg > 1:6528688/1‑93 (MQ=255) tGCAGGCGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCATGTCGCAATGgcgc < 2:6568438/93‑1 (MQ=255) | GCAGGCCTATGTTGAAGCGGGTGCCGAGATGTTGTTCCCGGAGGCGATTACCGAACTCGCCATGTACCGCCAGTTTGCCGATGCGGTGCAGGTGCCGATCCTCGCCAACATCACCGAATTTGGTGCCACGCCGCTGTTTACCACCGACGAATTACGCAGCGCCCATGTCGCAATGGCGCTGTA > NC_000913/348427‑348609 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |