| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,029,284 | T→C | intergenic (‑318/‑34) | ygfT ← / → ygfU | putative oxidoreductase Fe‑S subunit/putative permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,029,284 | 0 | T | C | 83.7% | 617.6 / 106.1 | 251 | intergenic (‑318/‑34) | ygfT/ygfU | putative oxidoreductase Fe‑S subunit/putative permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (21/20); new base C (112/98); total (133/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
AAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAA > NC_000913/3029192‑3029373 | aaaTTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTc > 1:4006772/1‑93 (MQ=255) aTTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACcccc > 1:1192756/1‑93 (MQ=255) ttACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAAcccccc > 1:1377788/1‑93 (MQ=255) tACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCt < 2:5863772/93‑1 (MQ=255) aCAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCtt < 2:5986904/93‑1 (MQ=255) aGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTcc > 1:758624/1‑93 (MQ=255) aGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTcc < 2:4418522/93‑1 (MQ=255) aGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTcc > 1:4349857/1‑93 (MQ=255) aGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTcc > 1:3305802/1‑93 (MQ=255) aGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTcc < 1:1556795/93‑1 (MQ=255) gATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCt > 1:2047742/1‑93 (MQ=255) gATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCt > 1:3033551/1‑93 (MQ=255) tAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTcc > 2:4427819/1‑92 (MQ=255) aTTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCa > 2:1568670/1‑93 (MQ=255) ccATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCaaaa > 1:2223118/1‑93 (MQ=255) cATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCaaaaa > 1:6175713/1‑93 (MQ=255) aTTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAAc > 2:272592/1‑93 (MQ=255) ttGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACt < 2:6178593/93‑1 (MQ=255) ttGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACt > 1:4688698/1‑93 (MQ=255) tGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTg < 1:993015/93‑1 (MQ=255) tCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGc < 1:2690342/93‑1 (MQ=255) cAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCa < 2:4802064/93‑1 (MQ=255) aGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCAc < 1:664390/93‑1 (MQ=255) aGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCAc < 1:320047/93‑1 (MQ=255) gTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTc < 1:1780298/93‑1 (MQ=255) ttctcttctcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTcc < 2:1886478/93‑1 (MQ=255) ttctcttctcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTcc > 2:5048463/1‑93 (MQ=255) ctcttctcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCAc > 2:3050619/1‑93 (MQ=255) ctcttctcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCAc > 1:472182/1‑93 (MQ=255) tcttctcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACg > 1:3373902/1‑93 (MQ=255) tcttctcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACg > 2:1582209/1‑93 (MQ=255) tcttctcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCACCCTTCCTCGCAAACACTGGCACTCCACg > 2:6326698/1‑93 (MQ=255) cttctcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTACCTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGa < 1:128052/93‑1 (MQ=255) cttctcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGa < 1:6508324/93‑1 (MQ=255) cttctcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGa < 1:3334275/93‑1 (MQ=255) ttctcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAg > 2:3859073/1‑93 (MQ=255) ctcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCa < 2:3096448/93‑1 (MQ=255) tcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCAt > 1:2703706/1‑93 (MQ=255) tcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCAt > 2:5723742/1‑93 (MQ=255) tcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCAt < 2:5536070/93‑1 (MQ=255) tcATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCAt > 1:4418630/1‑93 (MQ=255) cATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCAtg < 1:384769/93‑1 (MQ=255) cATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCAtg < 2:1010644/93‑1 (MQ=255) aTTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCAtgt < 1:1980745/93‑1 (MQ=255) ttttCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCAtgtg < 2:2979982/93‑1 (MQ=255) tttCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAACCTGGCACTCCACGAGCATgtgt < 1:3322651/93‑1 (MQ=255) tttCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATgtgt < 2:3651801/93‑1 (MQ=255) cGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTa < 1:2863318/93‑1 (MQ=255) gTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACa > 2:2199884/1‑93 (MQ=255) tttAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAg < 2:865160/93‑1 (MQ=255) tttAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAg < 2:757300/93‑1 (MQ=255) ttAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGt < 1:820307/93‑1 (MQ=255) ttAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGt < 2:4355205/93‑1 (MQ=255) ttAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGt < 2:4108845/93‑1 (MQ=255) tAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGtt < 1:1271471/93‑1 (MQ=255) tAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGtt < 1:3720553/93‑1 (MQ=255) tAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGtt > 2:2811132/1‑93 (MQ=255) aaCCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACTAGCATGTGTTTAGACAGttt < 1:2156026/93‑1 (MQ=255) aaCCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGttt > 1:5784152/1‑93 (MQ=255) ccACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCa > 2:1082846/1‑93 (MQ=255) ccACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCa > 2:396061/1‑93 (MQ=255) cACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCAt < 2:1397988/93‑1 (MQ=255) cACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCAt > 1:6110577/1‑93 (MQ=255) aCGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCAtt > 2:1895207/1‑93 (MQ=255) aCGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCAtt < 2:4677785/93‑1 (MQ=255) cGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTa < 1:2435588/93‑1 (MQ=255) gATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTaa < 2:1255585/93‑1 (MQ=255) aTTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAAc > 2:4223680/1‑93 (MQ=255) tgtgATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTaa > 2:6521996/1‑93 (MQ=255) gtgATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTaaa < 1:2349006/93‑1 (MQ=255) gtgATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTaaa < 1:5837050/93‑1 (MQ=255) tgATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAAc < 1:2286245/93‑1 (MQ=255) tgATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAAc > 2:5394553/1‑93 (MQ=255) gATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACg < 1:1940905/93‑1 (MQ=255) aTTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACgg > 1:541416/1‑93 (MQ=255) aTTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACgg > 2:4627506/1‑93 (MQ=255) ttGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGt > 2:3017548/1‑93 (MQ=255) ttGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGt < 1:4131818/93‑1 (MQ=255) tGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGtt > 1:4442699/1‑93 (MQ=255) cTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCt > 2:5271413/1‑93 (MQ=255) cTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCCCTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCt < 1:539204/93‑1 (MQ=255) cTCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCt > 1:345844/1‑93 (MQ=255) tCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCtt > 1:2527681/1‑93 (MQ=255) tCCGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCtt > 2:4994980/1‑93 (MQ=255) ccGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCttt < 1:5494476/93‑1 (MQ=255) cGCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCtttt < 1:1604134/93‑1 (MQ=255) gCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCttttt < 2:404302/93‑1 (MQ=255) gCAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCttttt > 2:456789/1‑93 (MQ=255) cAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTa < 1:3240350/93‑1 (MQ=255) cAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTa > 1:3654710/1‑93 (MQ=255) cAATTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTa > 2:2038040/1‑93 (MQ=255) aaTTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTAc > 1:6293862/1‑93 (MQ=255) aaTTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTAc > 2:2642546/1‑93 (MQ=255) aTTCCTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTAct > 2:3433180/1‑93 (MQ=255) ccTGTCTCTAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTg < 1:494001/93‑1 (MQ=255) ctctAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTggcggg < 2:487186/93‑1 (MQ=255) ctAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTggcgggcg > 1:1043662/1‑93 (MQ=255) tAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGa < 2:1733594/93‑1 (MQ=255) tAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGa > 1:2984368/1‑93 (MQ=255) tAACCCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGa < 2:3577182/93‑1 (MQ=255) | AAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATGTGATTGCCTCCGCAATTCCTGTCTCTAACTCCCCTTCCTCGCAAAAACTGGCACTCCACGAGCATGTGTTTAGACAGTTTCATTAACGTAAACGGTTGCTTTTTACTCTGGCGGGCGAA > NC_000913/3029192‑3029373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |