Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,203,865 | C→T | L11L (TTG→TTA) | ygiP ← | putative transcriptional regulator LYSR‑type |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,203,865 | 0 | C | T | 88.9% | 873.2 / 70.3 | 280 | L11L (TTG→TTA) | ygiP | putative transcriptional regulator LYSR‑type |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (17/14); new base T (111/138); total (128/152) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.40e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.05e-01 |
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
TGGATCCGCTTGGTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCT > NC_000913/3203773‑3203956 | tGGATCCGCTTGGTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGc > 2:4309167/1‑93 (MQ=255) tCCGCTTGGTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAgc > 1:4806689/1‑92 (MQ=255) cGCTTGGTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCt < 1:1113205/93‑1 (MQ=255) cGCTTGGTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCt > 1:1665775/1‑93 (MQ=255) gCTTGGTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCtt > 1:1576797/1‑93 (MQ=255) gCTTGGTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCtt < 2:6431438/93‑1 (MQ=255) gCTTGGTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCtt < 2:4546538/93‑1 (MQ=255) ttGGTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTg < 2:2159667/93‑1 (MQ=255) ttGGTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTg < 2:3277681/93‑1 (MQ=255) ttGGTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTg < 2:493515/93‑1 (MQ=255) ttGGTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTg < 2:4959842/93‑1 (MQ=255) ttGGTGACAAATGCAGGCGGCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGTCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTg < 1:510726/93‑1 (MQ=255) tGGTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTgg > 2:502709/1‑93 (MQ=255) tGGTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTgg > 1:1312783/1‑93 (MQ=255) ggTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGc < 2:6148726/93‑1 (MQ=255) ggTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGc > 1:3354826/1‑93 (MQ=255) ggTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGCGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGc > 2:785470/1‑93 (MQ=255) gTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCt < 2:1251396/93‑1 (MQ=255) tGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTa > 2:5873837/1‑93 (MQ=255) ggACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTa < 2:1885178/92‑1 (MQ=255) gACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTaa > 1:3698513/1‑93 (MQ=255) aCAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTaaa < 1:999023/93‑1 (MQ=255) aCAAAAGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTaaa < 1:1556758/93‑1 (MQ=255) cAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAg < 1:2808262/93‑1 (MQ=255) aaaTGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAgg < 2:4803062/93‑1 (MQ=255) aTGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGcc > 2:6602869/1‑93 (MQ=255) aTGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGcc > 1:4947990/1‑93 (MQ=255) aTGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGcc > 1:2516766/1‑93 (MQ=255) gCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAg < 2:1145755/93‑1 (MQ=255) gCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAg < 2:5550471/93‑1 (MQ=255) cAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGc > 2:1050569/1‑93 (MQ=255) aGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCTCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCt < 2:1410974/93‑1 (MQ=255) aGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCt > 1:3195167/1‑93 (MQ=255) aGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCt > 2:3903743/1‑93 (MQ=255) cGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTAtt > 2:2496815/1‑93 (MQ=255) cGTCTCCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTAtt < 1:5226423/93‑1 (MQ=255) gTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTc > 1:4102400/1‑93 (MQ=255) tCTGCCCGAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCa < 1:3965458/93‑1 (MQ=255) gCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCa < 1:2987176/93‑1 (MQ=255) ccAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGTCCAGCTATTCAGCATc > 1:642713/1‑93 (MQ=255) ccAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATc > 2:957113/1‑93 (MQ=255) ccAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATc > 1:4206085/1‑93 (MQ=255) gCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTa > 2:5355475/1‑93 (MQ=255) cgccgcTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTa > 1:2723279/1‑93 (MQ=255) cgccgcTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTa < 2:4735300/93‑1 (MQ=255) cgccgcTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTa < 2:2260658/93‑1 (MQ=255) gccgcTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTAt > 1:5180447/1‑93 (MQ=255) ccgcTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATc > 2:3007838/1‑93 (MQ=255) ccgcTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATc < 1:6294928/93‑1 (MQ=255) cgcTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATcc < 1:1234876/93‑1 (MQ=255) cgcTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATcc > 2:3544012/1‑93 (MQ=255) cgcTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATcc < 2:4121449/93‑1 (MQ=255) gcTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCg > 1:2067752/1‑93 (MQ=255) cTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGGCAGCTAGTCAGCATCGGTCATTATCGGc > 2:1587965/1‑93 (MQ=255) cTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGc < 2:1708474/93‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCa < 1:4438319/93‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCa < 1:253191/93‑1 (MQ=255) gcggcgCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAg < 1:6206770/93‑1 (MQ=255) gcggcgCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAg < 1:2017155/93‑1 (MQ=255) cggcgCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGt > 1:3078978/1‑93 (MQ=255) cggcgCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGt < 2:1719096/93‑1 (MQ=255) cggcgCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGt > 2:2811228/1‑93 (MQ=255) cggcgCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGt < 1:105653/93‑1 (MQ=255) gtcgcTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGtt < 1:5996463/91‑1 (MQ=255) ggcgCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGtt < 2:3671447/93‑1 (MQ=255) cgcTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTtgt < 2:89014/93‑1 (MQ=255) gcTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTtgtg > 2:6002925/1‑93 (MQ=255) cTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGa < 2:5726083/93‑1 (MQ=255) cTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGa > 2:3719180/1‑93 (MQ=255) tAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGAt < 1:3886830/93‑1 (MQ=255) aaaCTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATaa > 2:2394407/1‑93 (MQ=255) aaCTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAg > 2:2265041/1‑93 (MQ=255) aCTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAgc > 2:3211273/1‑93 (MQ=255) cTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAgcg > 2:2168617/1‑93 (MQ=255) gCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAgtg < 2:5277754/93‑1 (MQ=255) cTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAgtgt > 1:729639/1‑93 (MQ=255) tgtgAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTa > 1:868939/1‑93 (MQ=255) tgtgAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTa < 1:5693463/93‑1 (MQ=255) gtgAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTAt < 2:6322120/93‑1 (MQ=255) gtgAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTAt < 1:3437381/93‑1 (MQ=255) tgAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTAtt > 1:2196972/1‑93 (MQ=255) tgAACGATTTCCACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTAtt < 2:2360342/93‑1 (MQ=255) gAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTAttt < 2:1394131/93‑1 (MQ=255) gAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTAttt < 2:3099992/93‑1 (MQ=255) gAACGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTAttt > 2:2687784/1‑93 (MQ=255) cGATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGc < 1:2321115/93‑1 (MQ=255) gATTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCa > 2:152529/1‑93 (MQ=255) aTTTCTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCaa > 1:5382940/1‑93 (MQ=255) cTACCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACa < 1:3487207/93‑1 (MQ=255) aCCAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACAtt > 2:2094775/1‑93 (MQ=255) ccAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTg > 2:4833128/1‑93 (MQ=255) cAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGc < 1:6364835/93‑1 (MQ=255) cAGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGc > 1:2050715/1‑93 (MQ=255) cAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGc < 1:3258264/93‑1 (MQ=255) aGTACCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGcc < 1:1363840/93‑1 (MQ=255) aGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGcc > 2:3347650/1‑93 (MQ=255) aCCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCAtt < 2:6484673/93‑1 (MQ=255) aCCTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCAtt > 2:2233226/1‑93 (MQ=255) cTGTAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTcc < 2:644907/93‑1 (MQ=255) tGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTccc < 1:5435864/93‑1 (MQ=255) | TGGATCCGCTTGGTGACAAATGCAGGCGTCTGCCCAAGCGTCGCCGCTGCGGCGCTAAAACTCCCGCTGTGAACGATTTCTACCAGTACCTGCAAGTCTTTGGCTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCT > NC_000913/3203773‑3203956 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |