| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,442,615 | A→G | P84P (CCT→CCC) | rpsE ← | 30S ribosomal subunit protein S5 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,442,615 | 0 | A | G | 87.9% | 825.9 / 91.7 | 298 | P84P (CCT→CCC) | rpsE | 30S ribosomal subunit protein S5 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (15/21); new base G (121/141); total (136/162) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.40e-01 | |||||||||||
Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
AACGGCGCGCATTGCACCACCGGCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACAGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCGCTGCTGGAACTTCAC > NC_000913/3442525‑3442706 | aaCGGCGCGCATTGCACCAGCGGCGATGATCCCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACggg < 2:6012710/93‑1 (MQ=255)aaCGGCGCGCATTGCACCACCGGCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACggg < 2:5053059/93‑1 (MQ=255) aCGGCGCGCATTGCACCACCGGCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACgggg < 1:5343194/93‑1 (MQ=255) cGGCGCGCATTGCACCACCGGCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGgt < 1:3116215/93‑1 (MQ=255) cgcgcATTGCACCACCGGCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGtt < 1:4361187/93‑1 (MQ=255) cgcATTGCACCACCGGCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGc < 1:242935/93‑1 (MQ=255) cATTGCACCACCGGCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCag < 1:456341/93‑1 (MQ=255) cATTGCACCACCGGCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCag > 1:2024032/1‑93 (MQ=255) aTTGCACCACCGGCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCaga < 1:1025453/93‑1 (MQ=255) ttGCACCACCGGCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCagag > 2:413769/1‑93 (MQ=255) caccacCGGCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGc > 2:3649899/1‑93 (MQ=255) ccaccGGCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACAGGGTGTTGCAGAGTGCCg > 1:3821366/1‑93 (MQ=255) ggCGATGGTACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTAtt > 1:6538827/1‑93 (MQ=255) ggCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTAtt > 2:4783727/1‑93 (MQ=255) ggCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTAtt > 1:6613791/1‑93 (MQ=255) gCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTc > 1:2138258/1‑93 (MQ=255) gCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTc < 2:6389350/93‑1 (MQ=255) gatgatACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAg > 2:1580163/1‑93 (MQ=255) gatgatACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAg < 2:131009/93‑1 (MQ=255) atgatACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAgc > 2:1397773/1‑93 (MQ=255) atgatACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAgc > 1:1793150/1‑93 (MQ=255) atgatACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAgc < 2:1757855/93‑1 (MQ=255) atgatACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAgc > 1:6576305/1‑93 (MQ=255) tgatACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAgcg > 2:305203/1‑93 (MQ=255) tgatACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACAGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAgcg > 2:3034755/1‑93 (MQ=255) atACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGcgcg > 1:4653048/1‑93 (MQ=255) atACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGcgcg > 2:1694023/1‑93 (MQ=255) atACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGcgcg > 1:4875274/1‑93 (MQ=255) tACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACAGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGa < 2:2171957/93‑1 (MQ=255) aCCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGAc < 1:588368/93‑1 (MQ=255) cGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGt < 2:1184021/93‑1 (MQ=255) tACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTaa < 1:2574154/93‑1 (MQ=255) aCCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAAt > 1:3875282/1‑93 (MQ=255) ccTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATc < 1:3629710/93‑1 (MQ=255) ccTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGCGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATc > 2:3913968/1‑93 (MQ=255) ccTTCGGAACCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATc < 2:6156280/93‑1 (MQ=255) tCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCata > 1:4103605/1‑93 (MQ=255) tCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCata < 2:5380765/93‑1 (MQ=255) tCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCata < 1:1191670/93‑1 (MQ=255) cGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCatat > 2:5258525/1‑93 (MQ=255) cGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCatat < 1:98681/93‑1 (MQ=255) cGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCatat < 1:1567283/93‑1 (MQ=255) cGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACAGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCatat > 1:5946016/1‑93 (MQ=255) ggAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATAtt < 2:1366476/93‑1 (MQ=255) gAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTg > 1:1325750/1‑93 (MQ=255) aGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCg < 1:6349042/93‑1 (MQ=255) aGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCg > 1:4006500/1‑93 (MQ=255) gCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGa < 2:1139769/93‑1 (MQ=255) cccGACTGCATCAATACGCGAGAACCCGTGTGAACTCCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGGCGTTAATCATATTGCGa < 1:2671151/92‑1 (MQ=255) cGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACg < 2:5409956/93‑1 (MQ=255) ggCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGCTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACgg > 1:4754861/1‑93 (MQ=255) cTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACAGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGc < 1:1703470/93‑1 (MQ=255) gCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCtt < 2:3317312/93‑1 (MQ=255) gCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCtt < 2:3452723/93‑1 (MQ=255) cATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCttt > 1:6198911/1‑93 (MQ=255) cATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACAGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCttt < 1:3283933/93‑1 (MQ=255) aTGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCtttt > 1:5655327/1‑93 (MQ=255) aTGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGGGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCtttt > 1:3518118/1‑93 (MQ=255) tGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCttttt < 2:4706650/93‑1 (MQ=255) tGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCttttt > 1:2626969/1‑93 (MQ=255) aTACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCa < 2:2465367/93‑1 (MQ=255) tACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCAt < 1:828270/93‑1 (MQ=255) aCGCGAGAGCCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATc < 1:548405/93‑1 (MQ=255) aCGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATc > 2:4982764/1‑93 (MQ=255) aCGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATc < 2:375349/93‑1 (MQ=255) aCGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATc < 2:2219623/93‑1 (MQ=255) gcgAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGc < 2:76621/93‑1 (MQ=255) cgAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCt > 1:3764839/1‑93 (MQ=255) cgAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCt < 1:4967737/93‑1 (MQ=255) cgAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCt < 1:4486515/93‑1 (MQ=255) gagaACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCtt < 2:6396487/93‑1 (MQ=255) gagaACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCtt < 2:6621154/93‑1 (MQ=255) agaACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCttt < 2:5848174/93‑1 (MQ=255) gaACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTc < 2:631862/93‑1 (MQ=255) gaACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTc > 1:2779484/1‑93 (MQ=255) gaACCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTc > 1:6402769/1‑93 (MQ=255) aCCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTg < 2:2734833/93‑1 (MQ=255) aCCCGTGTGAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTg > 2:5281520/1‑93 (MQ=255) 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tgAACACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCgct < 1:4160090/93‑1 (MQ=255) aaCACCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCgctgc > 2:3944804/1‑93 (MQ=255) acacCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCgctgct < 2:3844603/93‑1 (MQ=255) cacCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCGctgctg > 2:6373213/1‑93 (MQ=255) acCTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCGCTGCTgg > 2:2645505/1‑93 (MQ=255) cTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCGCTGCTGGaa > 2:6499666/1‑93 (MQ=255) cTTTAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCGCTGCTGGaa < 1:5034460/93‑1 (MQ=255) cTTTAACGGGGTGTTGCAGACTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCGCTGCTGGaa < 2:4421195/93‑1 (MQ=255) tttAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCGCTGCTGGAAc < 1:2972411/93‑1 (MQ=255) tAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCGCTGCTGGAACtt < 1:4211533/93‑1 (MQ=255) tAACGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCGCTGCTGGAACtt < 2:407733/93‑1 (MQ=255) aaCGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCGCTGCTTGCACTTc > 2:1075546/1‑93 (MQ=255) aaCGGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCGCTGCTGGAACTTc > 1:1642389/1‑93 (MQ=255) cAGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCGCTGCTGGAACTTCAc < 1:1503656/93‑1 (MQ=255) | AACGGCGCGCATTGCACCACCGGCGATGATACCGGTACCTTCGGAAGCCGGCTGCATGAATACGCGAGAACCCGTGTGAACACCTTTAACAGGGTGTTGCAGAGTGCCGTTATTCAGCGCGACGTTAATCATATTGCGACGGGCTTTTTCCATCGCTTTCTGGATCGCTGCTGGAACTTCAC > NC_000913/3442525‑3442706 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |