| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 851,847 | T→C | intergenic (‑27/‑47) | ybiP ← / → b0816 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 851,847 | 0 | T | C | 89.5% | 645.4 / 54.6 | 220 | intergenic (‑27/‑47) | ybiP/b0816 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (13/10); new base C (127/70); total (140/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.70e-01 | |||||||||||
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
GAACGCAGTCCACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGTGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCAATATACGCAGGGCTG > NC_000913/851755‑851938 | gAACGCAGTCCACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCAtgt < 1:5616365/93‑1 (MQ=255) cGCAGTCCACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCt < 2:5590909/93‑1 (MQ=255) gCAGTCCACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCtt > 2:1517245/1‑93 (MQ=255) gCAGTCCACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCtt > 1:4496346/1‑93 (MQ=255) gTCCACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTAcc < 2:1534732/93‑1 (MQ=255) gTCCACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTAcc > 1:6594480/1‑93 (MQ=255) gTCCACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTAcc > 2:3881388/1‑93 (MQ=255) gTCCACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTAcc > 2:6179491/1‑93 (MQ=255) tCCACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTAccc > 1:1119146/1‑93 (MQ=255) tCCACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTAccc > 2:5376504/1‑93 (MQ=255) tCCACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTAccc < 2:5699059/93‑1 (MQ=255) tCCACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATACGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTAccc > 2:1394030/1‑93 (MQ=255) cACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGTGCTTACCCTg > 1:5658892/1‑93 (MQ=255) cACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTg < 2:2110121/93‑1 (MQ=255) aCGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTgg > 1:1983937/1‑93 (MQ=255) gggCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCg > 1:3947412/1‑93 (MQ=255) tAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCaa > 1:4729265/1‑93 (MQ=255) ccGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCaa > 2:2475907/1‑93 (MQ=255) cGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAAt > 2:3925516/1‑93 (MQ=255) cGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAAt < 1:3194430/93‑1 (MQ=255) ggCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATa > 2:2585784/1‑93 (MQ=255) gCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATAc > 2:729423/1‑93 (MQ=255) cTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATAcc > 2:2917537/1‑93 (MQ=255) tACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGTGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCt < 2:5146657/93‑1 (MQ=255) ggTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCaa < 1:1601318/93‑1 (MQ=255) aaCAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAagag < 2:6162778/93‑1 (MQ=255) aaCAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAagag > 1:70389/1‑93 (MQ=255) aCAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGt < 1:1502969/93‑1 (MQ=255) aCAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGt < 1:1270312/93‑1 (MQ=255) cAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTg > 2:1839220/1‑93 (MQ=255) cAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTg > 1:5017038/1‑93 (MQ=255) cAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTg < 1:6336841/93‑1 (MQ=255) aaGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGc > 1:954890/1‑93 (MQ=255) aaGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGc < 2:5042384/93‑1 (MQ=255) aGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCg > 1:3503307/1‑93 (MQ=255) gCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGt > 1:2028480/1‑93 (MQ=255) gCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGt < 2:5444067/93‑1 (MQ=255) gCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGt > 1:2522452/1‑93 (MQ=255) gATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGa > 1:3380843/1‑93 (MQ=255) gATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGa > 1:6164700/1‑93 (MQ=255) ttCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAag > 1:5076915/1‑93 (MQ=255) tCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAaga < 1:1405321/93‑1 (MQ=255) tCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAaga < 1:6497165/93‑1 (MQ=255) cTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAagag < 2:6491506/93‑1 (MQ=255) tttGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGt < 1:2331039/93‑1 (MQ=255) ttGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGTGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTg > 2:3199402/1‑93 (MQ=255) ttGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTg < 1:2703657/93‑1 (MQ=255) gggTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGaaa > 2:1922785/1‑93 (MQ=255) gggTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGaaa < 1:683887/93‑1 (MQ=255) gggTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGaaa < 2:4496346/93‑1 (MQ=255) ggTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGTGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAg < 1:5437931/93‑1 (MQ=255) ggTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGTGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAg > 2:4829410/1‑93 (MQ=255) ggTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAg < 2:342582/93‑1 (MQ=255) ggTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAg < 2:836577/93‑1 (MQ=255) ggTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAg > 1:4816698/1‑93 (MQ=255) gTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAATCGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGTGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAgg < 2:439037/93‑1 (MQ=255) gTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAgg > 1:5961279/1‑93 (MQ=255) gTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAgg < 1:5206356/93‑1 (MQ=255) ttAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAggg < 2:347167/93‑1 (MQ=255) ttAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAggg < 1:1253833/93‑1 (MQ=255) ttAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAggg > 2:1948700/1‑93 (MQ=255) ttAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAggg < 1:3099663/93‑1 (MQ=255) aaaTTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGt > 1:3352656/1‑93 (MQ=255) aaTTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTc > 2:3692746/1‑93 (MQ=255) aTTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTcc < 1:2234701/93‑1 (MQ=255) aTTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTcc < 1:603221/93‑1 (MQ=255) aTTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTcc > 2:4062782/1‑93 (MQ=255) ttCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCg > 2:3152854/1‑93 (MQ=255) cATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCa > 2:5848938/1‑93 (MQ=255) atatGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCAt > 2:5098637/1‑93 (MQ=255) tatGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATc > 1:1366194/1‑93 (MQ=255) tGCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCcg > 1:4603171/1‑93 (MQ=255) gCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCcgc > 1:2084201/1‑93 (MQ=255) gCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCcgc < 2:2951036/93‑1 (MQ=255) gCCACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCcgc > 1:3686778/1‑93 (MQ=255) ccccTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATCCCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCcgcg < 1:5158393/90‑1 (MQ=255) cACTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGAGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGa > 2:4558122/1‑93 (MQ=255) cTATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGc < 2:2394223/93‑1 (MQ=255) tATCGTAACAAACGCCATGTGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGcc < 2:177513/93‑1 (MQ=255) tATCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGcc > 2:1344979/1‑93 (MQ=255) aTCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCg > 2:4881004/1‑93 (MQ=255) tCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGc > 2:6568362/1‑93 (MQ=255) tCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGc > 2:4932367/1‑93 (MQ=255) tCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGc > 1:2809008/1‑93 (MQ=255) tCGTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGc > 1:2925602/1‑93 (MQ=255) gTAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCaa > 2:6428598/1‑93 (MQ=255) tAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCAat > 1:4242341/1‑93 (MQ=255) tAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCAat > 1:5485898/1‑93 (MQ=255) tAACAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCAat > 2:4375562/1‑93 (MQ=255) aCAAACGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCAatat > 2:2870872/1‑93 (MQ=255) aaaCGCCATGTGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCAATATAc > 1:4158298/1‑93 (MQ=255) aaCGCCATGCGCTTCCCCTGGCGTCAGGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGAAAAGGGGTCCGCACCCGCGAGCCGCAATATACg < 2:5640185/93‑1 (MQ=255) aaCGCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCAATATACg > 1:2576085/1‑93 (MQ=255) aCGCCATGTGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCAATATACGc > 1:4072786/1‑93 (MQ=255) cGCCATGTGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCAATATACGCa > 2:3545721/1‑93 (MQ=255) gCCATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCAATATACGCAg > 2:1872396/1‑93 (MQ=255) cccATGCGCTTCCCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCAATATACGCAg < 1:4305853/92‑1 (MQ=255) ccATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATCCCTGAAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCAATATACGCAgg < 2:668676/93‑1 (MQ=255) cATGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCAATATACGCAggg > 2:5796092/1‑93 (MQ=255) aTGCGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCAATATACGCAGGGc > 1:173656/1‑93 (MQ=255) | GAACGCAGTCCACGGGCTAAATACCCGGCTACGGGTAACAAGCGATTCTTTGAGGGTTAAATTCATATGCCACTATCGTAACAAACGCCATGTGCTTACCCTGGCGTCAAGGGTCAATACCTGCAAGAGTGCGTGAAGAGTGGAAAGGGGTCCGCATCCGCGAGCCGCAATATACGCAGGGCTG > NC_000913/851755‑851938 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |