| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,979,546 | Δ1 bp | coding (1047/1386 nt) | yifK → | putative amino acid/amine transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,979,545 | 0 | G | . | 99.8% | 2080.6 / ‑3.9 | 459 | coding (1046/1386 nt) | yifK | putative amino acid/amine transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base . (254/203); total (255/204) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 487 total aligned reads displayed.
TTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TT‑G‑CTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATA > NC_000913/3979454‑3979633 | ttACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCTg > 2:8674883/1‑93 (MQ=255)ttACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCTg > 2:165575/1‑93 (MQ=255)ttACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCTg > 1:2217465/1‑93 (MQ=255)ttACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TT‑GTCTCATGCCTg > 1:3072933/1‑93 (MQ=255) tACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCTga < 2:9329041/93‑2 (MQ=255) ccGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCTgaac < 1:4113390/93‑4 (MQ=255) gcggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTAc > 1:4815310/1‑93 (MQ=255) cggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTAca < 1:6080303/93‑1 (MQ=255) ggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCGT‑GAACTAcat > 2:8246924/1‑93 (MQ=255) ggcAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTAcat > 1:8383792/1‑93 (MQ=255) aTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCAtt > 2:4438277/1‑93 (MQ=255) aTGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCAtt < 1:3029056/93‑1 (MQ=255) tGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTc > 2:208824/1‑93 (MQ=255) tGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTc < 2:6492712/93‑1 (MQ=255) cGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCa < 2:3072126/93‑1 (MQ=255) aGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATcc < 1:8116974/93‑1 (MQ=255) gTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAATTT‑G‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCg < 2:8422105/93‑1 (MQ=255) ttCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCa < 2:1330622/93‑1 (MQ=255) ccGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCg > 2:4688009/1‑93 (MQ=255) cGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgt < 1:6987904/93‑1 (MQ=255) tCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgt > 1:1650235/1‑93 (MQ=255) tCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgg > 2:2436787/1‑92 (MQ=255) aCGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgtgt > 2:315454/1‑93 (MQ=255) aCGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCgtgtgt < 2:9799475/93‑1 (MQ=255) cGGCGTCCCGCTTGCGGGTGGGGCAGTACCAATTGCTATCCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGtt < 2:416023/93‑1 (MQ=255) cGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGtt < 1:5710886/93‑1 (MQ=255) cGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGtt < 1:3634938/93‑1 (MQ=255) ggCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGttt > 1:9955192/1‑93 (MQ=255) ggCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGttt > 1:2862304/1‑93 (MQ=255) ggCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGttt < 1:7212869/93‑1 (MQ=255) gCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTg > 1:7586550/1‑93 (MQ=255) cGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgt < 2:7056473/93‑1 (MQ=255) cGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgt < 2:85058/93‑1 (MQ=255) gTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtc < 2:3762646/93‑1 (MQ=255) gTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtc < 1:1049052/93‑1 (MQ=255) gTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtc < 1:8801672/93‑1 (MQ=255) aCCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtcta < 1:2738970/93‑1 (MQ=255) ccGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctac < 1:6708848/93‑1 (MQ=255) ccGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctac > 1:1860192/1‑93 (MQ=255) cGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacg < 2:4664871/93‑1 (MQ=255) cGGTCGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacg < 1:4221094/93‑1 (MQ=255) gTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtc > 2:2601101/1‑93 (MQ=255) gTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtc > 1:9685640/1‑93 (MQ=255) ttGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtct < 1:136186/93‑1 (MQ=255) gCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTgtctacgtctac > 1:5833940/1‑93 (MQ=255) cGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACa < 1:7941577/93‑1 (MQ=255) gggTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAg < 1:3898496/93‑1 (MQ=255) gggTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAg > 2:7857550/1‑93 (MQ=255) ggTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGt > 2:9155017/1‑93 (MQ=255) tgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCa > 1:1188308/1‑93 (MQ=255) tgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCa < 1:2477108/93‑1 (MQ=255) tgGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCa < 2:1889585/93‑1 (MQ=255) ggCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAg > 2:515680/1‑93 (MQ=255) gCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGc > 2:1033283/1‑93 (MQ=255) gCAGGATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCCTGCCT‑GAACTACCTCGTTCCCCATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGGCTACAGGGcacag > 2:5047434/1‑89 (MQ=255) gTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTg > 1:10009527/1‑93 (MQ=255) gTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTg > 2:7590185/1‑93 (MQ=255) gTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTg > 1:8462640/1‑93 (MQ=255) gTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTg > 2:6362431/1‑93 (MQ=255) aTCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCt > 2:390601/1‑93 (MQ=255) aTCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCt > 1:7299545/1‑93 (MQ=255) aTCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCt > 2:5633265/1‑93 (MQ=255) aTCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACGACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCt < 2:1129435/93‑1 (MQ=255) tCTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCtt > 2:7952651/1‑93 (MQ=255) cTATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTc < 2:5729796/93‑1 (MQ=255) tATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTcc > 2:2997869/1‑93 (MQ=255) tATTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTcc > 2:3571715/1‑93 (MQ=255) aTTGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCg < 1:196583/93‑1 (MQ=255) ttGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCgg > 2:7196282/1‑93 (MQ=255) ttGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCAGGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCgg < 2:5506378/93‑1 (MQ=255) tGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTTCATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCggg > 1:3719070/1‑93 (MQ=255) tGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCggg < 2:6086815/93‑1 (MQ=255) tGCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCggg > 2:5400595/1‑93 (MQ=255) gCTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCgggg > 1:6318349/1‑93 (MQ=255) cTATTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGa > 1:4504682/1‑93 (MQ=255) aTTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATg < 1:9353908/93‑1 (MQ=255) aTTCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATg > 2:6576045/1‑93 (MQ=255) ttCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATgg < 1:8932578/93‑1 (MQ=255) ttCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATgg < 2:675258/93‑1 (MQ=255) tCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGt > 2:4292870/1‑93 (MQ=255) tCTGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGt > 2:6988467/1‑93 (MQ=255) tGCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGc > 2:9596022/1‑93 (MQ=255) gCTAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGcc > 2:8942434/1‑93 (MQ=255) tAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCag > 1:3263380/1‑92 (MQ=255) tAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAt < 1:9101408/93‑1 (MQ=255) tAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAt < 1:5037133/93‑1 (MQ=255) tAA‑TTGG‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCAt < 1:6234238/93‑1 (MQ=255) ttgg‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCTGGGATGGTGCCATGGt > 2:8149047/4‑93 (MQ=255) ttgg‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGt > 1:5131970/4‑93 (MQ=255) ttgg‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGt < 1:5393039/90‑1 (MQ=255) tgg‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGtt < 1:4557417/91‑1 (MQ=255) gg‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGttt < 2:5895665/92‑1 (MQ=255) gg‑CTCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCAGCAGCGTGTGTTTTTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGttt > 2:1550682/2‑93 (MQ=255) tCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTtgtg < 1:4422028/93‑1 (MQ=255) tCATGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTtgtg < 2:1754400/93‑1 (MQ=255) aTGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGat > 2:4785191/1‑93 (MQ=255) aTGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGat > 1:6516035/1‑93 (MQ=255) aTGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGat > 1:5285299/1‑93 (MQ=255) tGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTCata > 2:2657578/1‑93 (MQ=255) tGCCT‑GAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGCGCTTCGCGCGTTGGTGCCATGGTTTGTGagt > 1:7744553/1‑91 (MQ=255) | TTACCGGCGGCAATGGCGAAAGTTTCCCGTCACGGCGTACCGGTTGCGGGTGTGGCAGTATCTATTGCTATTCTGCTAA‑TT‑G‑CTCATGCCTGGAACTACATCATTCCCAATCCGCAGCGTGTGTTTGTCTACGTCTACAGTGCCAGCGTGCTTCCGGGGATGGTGCCATGGTTTGTGATA > NC_000913/3979454‑3979633 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |