| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,600,037 | (C)7→6 | coding (200/2019 nt) | hyfB → | hydrogenase 4 membrane subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,600,031 | 0 | C | . | 92.2% | 1068.9 / 69.6 | 282 | coding (194/2019 nt) | hyfB | hydrogenase 4 membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (14/8); new base . (129/131); total (143/139) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.35e-01 | |||||||||||
Only 100 of 306 total aligned reads displayed.
TTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTT > NC_000913/2599939‑2600119 | tCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGcc < 1:9952950/93‑1 (MQ=255) cGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGcccc < 2:4969903/93‑1 (MQ=255) cATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGcccccct < 2:8546759/93‑2 (MQ=255) cATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGcccccct > 1:9591066/1‑92 (MQ=255) tCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCttt > 1:7413142/1‑93 (MQ=255) tCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCCtt > 1:6308546/1‑93 (MQ=255) caTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGa > 1:7477437/1‑93 (MQ=255) caTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGa > 2:651639/1‑93 (MQ=255) aTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGaa > 1:2022772/1‑93 (MQ=255) aTCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGaa < 1:3763690/93‑1 (MQ=255) tCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAAt > 2:7985967/1‑93 (MQ=255) cGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAAtt < 1:1488244/93‑1 (MQ=255) gCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAAttg > 1:3577486/1‑92 (MQ=255) tggtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCCTTTTGAATTTg > 2:8340803/1‑93 (MQ=255) tggtggGCGGCGTGATAGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGc > 1:6612654/1‑93 (MQ=255) ggtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGcc > 2:369705/1‑93 (MQ=255) ggtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑ACCCCCTTTTGAATTTGcc > 2:256586/1‑93 (MQ=255) gtggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCg > 1:6575168/1‑93 (MQ=255) tggGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGa < 2:9121477/93‑1 (MQ=255) gggCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAt < 2:4914961/93‑1 (MQ=255) gggCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAt < 2:5099170/93‑1 (MQ=255) gggCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAt < 1:2588276/93‑1 (MQ=255) gggCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAt > 2:7470515/1‑93 (MQ=255) ggcggcGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAtt < 2:585683/93‑1 (MQ=255) ggcggcGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAtt < 1:59335/93‑1 (MQ=255) gcggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAttt < 2:4695258/93‑1 (MQ=255) gcggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAttt > 2:219760/1‑93 (MQ=255) gcggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACACAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGAttt < 1:5127425/93‑1 (MQ=255) cggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTa > 2:6414572/1‑93 (MQ=255) cggcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTa < 1:3680911/93‑1 (MQ=255) gcgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAc < 2:6942736/93‑1 (MQ=255) cgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAcc < 1:4599357/93‑1 (MQ=255) cgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAcc < 1:2062170/93‑1 (MQ=255) cgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAcc > 2:6565032/1‑93 (MQ=255) cgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAcc < 2:4874085/93‑1 (MQ=255) cgTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGACGCCCGTTTTG‑ACCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAcc > 1:9165450/1‑93 (MQ=255) gTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAccc < 2:7370620/93‑1 (MQ=255) tGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCt < 2:3558776/93‑1 (MQ=255) tGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCt > 1:215897/1‑93 (MQ=255) aTTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGc < 2:2523698/93‑1 (MQ=255) tGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGa > 2:845991/1‑93 (MQ=255) ggCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGa > 1:1272848/1‑93 (MQ=255) ggCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGaa > 1:4086090/1‑93 (MQ=255) catcatCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATg < 2:3914017/93‑1 (MQ=255) tcatcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGa > 2:3283999/1‑93 (MQ=255) tcatcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGa > 2:8597700/1‑93 (MQ=255) tcatcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGa > 2:6074255/1‑93 (MQ=255) tcatcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGa > 1:309398/1‑93 (MQ=255) catcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGAt < 2:422471/93‑1 (MQ=255) atcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATa < 1:1810029/93‑1 (MQ=255) tcaGCGGAATTACGCTATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAg > 1:9795715/1‑93 (MQ=255) tcaGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAg > 1:1760800/1‑93 (MQ=255) gCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCct < 2:2023441/93‑1 (MQ=255) ggAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCctct < 2:4308644/93‑1 (MQ=255) gAATTACGCAATTACATGCTGGTGTATCTTTAGTCGCCGGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCtctc < 2:6230682/93‑1 (MQ=255) gAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCctct < 1:7271335/93‑1 (MQ=255) gAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCtctc < 1:4780279/93‑1 (MQ=255) ttACGCAATTACATGCTGGTGTTCCTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACACTGCGCATGGCTAGCCTCTCgc > 1:4509720/1‑92 (MQ=255) ttACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGc > 1:9385287/1‑93 (MQ=255) ttACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGc > 2:6683136/1‑93 (MQ=255) aCGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCAt > 1:8943956/1‑93 (MQ=255) cAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTa < 1:1965889/93‑1 (MQ=255) aaTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTAt > 1:437972/1‑93 (MQ=255) aTTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATg > 2:5712672/1‑93 (MQ=255) ttACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATgg > 2:2335616/1‑93 (MQ=255) ttACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATgg < 2:5560984/93‑1 (MQ=255) ttACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCACCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATgg > 1:2900457/1‑93 (MQ=255) aTGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt > 2:8298060/1‑93 (MQ=255) aTGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt > 1:10011486/1‑93 (MQ=255) aTGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCt < 2:7926401/93‑1 (MQ=255) cTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGt < 1:7037165/93‑1 (MQ=255) cTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGt > 1:2323794/1‑93 (MQ=255) tGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGtt < 1:608751/93‑1 (MQ=255) tGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGtt < 2:1657440/93‑1 (MQ=255) ggTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTa > 2:7710398/1‑93 (MQ=255) ggTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCAGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTa < 2:279914/93‑1 (MQ=255) gtgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTAt > 2:939586/1‑93 (MQ=255) tgtATCTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTGTAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTAtc < 1:721677/93‑1 (MQ=255) tgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTAtc < 2:6361755/93‑1 (MQ=255) tgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTAtc < 2:8727719/93‑1 (MQ=255) tgtAACTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTAtc < 1:8667228/93‑1 (MQ=255) atcTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTcc < 2:5016143/91‑1 (MQ=255) aaCTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTcc > 1:4476075/1‑93 (MQ=255) aaCTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTcc > 2:7788284/1‑93 (MQ=255) aCTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCt < 2:724917/93‑1 (MQ=255) aCTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCt > 1:8109899/1‑93 (MQ=255) aCTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCt < 2:1095705/93‑1 (MQ=255) cTTTAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCtt < 1:5661839/93‑1 (MQ=255) tttAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTg < 2:3402426/93‑1 (MQ=255) ttAGTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGc < 1:8032552/93‑1 (MQ=255) gTCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtgg < 1:4985366/93‑1 (MQ=255) tCGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggt > 1:4292111/1‑93 (MQ=255) cGCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtg < 1:4921178/93‑1 (MQ=255) gCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtgg < 1:5828762/93‑1 (MQ=255) gCCCGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtgg < 2:1251744/93‑1 (MQ=255) cccGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggt < 2:685394/93‑1 (MQ=255) ccGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggtg > 1:8429667/1‑93 (MQ=255) cGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCtggtggggg > 1:7197584/1‑93 (MQ=255) cGTTTTG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAAACCTGCGAATGGATAGACTCTCGGCATTTCTGGTGCTGGTTCTCTCCTTGCtggtggtgt > 1:4167600/1‑92 (MQ=255) ttttG‑CCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGtt > 1:7711518/1‑93 (MQ=255) | TTCCGGCATCACATCGCTGGTGGGCGGCGTGATTGGCATCATCAGCGGAATTACGCAATTACATGCTGGTGTAACTTTAGTCGCCCGTTTTGCCCCCCCTTTTGAATTTGCCGATTTAACCCTGCGAATGGATAGCCTCTCGGCATTTATGGTGCTGGTTATCTCCTTGCTGGTGGTGGTT > NC_000913/2599939‑2600119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |