| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,930,677 | +G | intergenic (+175/‑264) | kup → / → rbsD | low affinity potassium transport system/RbsD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,930,676 | 1 | . | G | 99.2% | 1520.2 / 2.0 | 473 | intergenic (+174/‑265) | kup/rbsD | low affinity potassium transport system/RbsD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/3); new base G (259/208); total (261/212) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.30e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 513 total aligned reads displayed.
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA > NC_000913/3930584‑3930763 | gTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTc < 2:3768400/93‑1 (MQ=255)gTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTc > 1:173074/1‑93 (MQ=255) agaagaAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑gg < 2:7846556/93‑2 (MQ=255) agaagaAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACATCCTTCTTTATGTCGCATGAGGCGCTGATCCTC‑gg > 2:4027990/1‑92 (MQ=255) gaagaaGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggc > 2:9614941/1‑91 (MQ=255) agaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑ggcaa < 1:5297174/93‑5 (MQ=255) agTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACg > 1:6901103/1‑93 (MQ=255) ttttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGcc < 2:2267397/93‑1 (MQ=255) tttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGccc > 1:6405674/1‑93 (MQ=255) tttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGccc < 2:3594755/93‑1 (MQ=255) ttCCCCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGACGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCg > 2:7229546/1‑93 (MQ=255) ttCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCg > 2:9067187/1‑93 (MQ=255) ccACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTg < 2:295842/93‑1 (MQ=255) ccACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTg < 2:8315252/93‑1 (MQ=255) ccACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTg < 1:6761209/93‑1 (MQ=255) cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTgg > 1:456765/1‑93 (MQ=255) aCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGt > 2:869092/1‑93 (MQ=255) aCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGt < 2:1672579/93‑1 (MQ=255) aCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGt > 1:3801149/1‑93 (MQ=255) cGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTAt < 1:9890571/93‑1 (MQ=255) gCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTAtt > 2:2624551/1‑93 (MQ=255) cTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGGAttt > 2:747684/1‑93 (MQ=255) gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGc < 1:7321513/93‑1 (MQ=255) ggTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGt > 1:7109037/1‑93 (MQ=255) gTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTc > 1:1434280/1‑93 (MQ=255) tCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCt > 1:8018814/1‑93 (MQ=255) cTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTg < 2:5384180/93‑1 (MQ=255) ggAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcg > 2:5810983/1‑93 (MQ=255) ggAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcg > 2:5689325/1‑93 (MQ=255) gAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcgc > 1:2910014/1‑93 (MQ=255) aaGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGcgcg > 2:5086839/1‑93 (MQ=255) ggATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGc > 1:70392/1‑93 (MQ=255) ggATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGc > 1:7867651/1‑93 (MQ=255) gATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCa < 1:7501094/93‑1 (MQ=255) aTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCaa > 2:1476707/1‑93 (MQ=255) aTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCaa > 2:4738676/1‑93 (MQ=255) ttAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAg > 2:7577309/1‑93 (MQ=255) tAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGc > 1:2698857/1‑93 (MQ=255) tAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGc > 2:8243204/1‑93 (MQ=255) aaGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCt < 1:1003216/93‑1 (MQ=255) gTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGt < 2:3404599/93‑1 (MQ=255) ttGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTa < 1:5674297/93‑1 (MQ=255) tGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc < 2:1998544/93‑1 (MQ=255) tGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc < 1:3760215/93‑1 (MQ=255) tGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc > 1:9782445/1‑93 (MQ=255) tGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc < 2:8547348/93‑1 (MQ=255) tGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc < 2:10009757/93‑1 (MQ=255) tccGGATGATGGAACCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACt < 2:6057394/92‑1 (MQ=255) gCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACt < 2:2693389/93‑1 (MQ=255) ccGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACtt > 1:4151482/1‑93 (MQ=255) cGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtg < 1:2298889/93‑1 (MQ=255) ggATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc > 2:6338978/1‑93 (MQ=255) ggATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc < 1:8253717/93‑1 (MQ=255) ggATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc < 2:8057576/93‑1 (MQ=255) gatgatGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgct < 2:8447779/93‑1 (MQ=255) gatgatGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgct > 1:7571325/1‑93 (MQ=255) gatgatGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgct > 1:5928977/1‑93 (MQ=255) tgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgc < 1:5002869/93‑1 (MQ=255) tgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgc < 1:8699501/93‑1 (MQ=255) gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑AAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgct > 1:2444061/1‑93 (MQ=255) ggAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa > 1:6141938/1‑93 (MQ=255) ggAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa > 1:5446424/1‑93 (MQ=255) aaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGGCCGTGGCATTTGGGTCTGGGAGGCAAGCTGTACTTGCTACTGCAACg > 1:8461142/1‑93 (MQ=255) aaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACg < 1:4754925/93‑1 (MQ=255) aCCTCCTTCTTTAGGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑GTCAACCGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGt < 2:8944368/93‑1 (MQ=255) ctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTaa < 1:4464108/93‑1 (MQ=255) ctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTaa > 2:3728277/1‑93 (MQ=255) cctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATg < 1:1080552/93‑1 (MQ=255) cttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgc < 1:2173857/93‑1 (MQ=255) ttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcg > 2:765625/1‑93 (MQ=255) ttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcg < 2:6480111/93‑1 (MQ=255) tcttCATGTCGCATGAGTCGGTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTCCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTCCTGCACCGTAATgcgc < 2:5005592/93‑1 (MQ=255) cttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCt < 1:1998167/93‑1 (MQ=255) cttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCt < 2:704755/93‑1 (MQ=255) cttTATGTCGAATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCt > 2:1102734/1‑93 (MQ=255) ttATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGc < 1:9164879/93‑1 (MQ=255) tATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCg > 2:9851725/1‑93 (MQ=255) tATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCg > 1:121953/1‑93 (MQ=255) aTGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGt > 2:5744672/1‑93 (MQ=255) tGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTg > 2:6689385/1‑93 (MQ=255) gTCGCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgct > 2:1283643/1‑72 (MQ=255) gCATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAcc < 2:2514736/93‑1 (MQ=255) gCATGAGTCGTTGATCCTC‑GTCAAACGCCCGTGGAATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAGCGGAATGCGCTGCGTGCAcc > 2:4403063/1‑93 (MQ=255) cATGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCa < 2:1897875/93‑1 (MQ=255) aTGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAg < 2:7359174/93‑1 (MQ=255) aTGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAg > 1:3382252/1‑93 (MQ=255) tGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGa < 2:9147988/93‑1 (MQ=255) tGAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGa > 1:9537170/1‑93 (MQ=255) gAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAt < 1:1768949/93‑1 (MQ=255) gAGTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAt > 1:3515980/1‑93 (MQ=255) gTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCa < 2:3256967/93‑1 (MQ=255) gTCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCa > 1:8995998/1‑93 (MQ=255) tCGTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCat > 2:2788419/1‑92 (MQ=255) gTTGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAtt > 1:9355017/1‑93 (MQ=255) ttGATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAttt > 1:7797000/1‑93 (MQ=255) taTCCTC‑GTCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGa < 1:4859183/92‑1 (MQ=255) gATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGa > 1:4286993/1‑93 (MQ=255) gATCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGa > 1:3195589/1‑93 (MQ=255) tCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGaaa > 1:6571756/1‑93 (MQ=255) tCCTCGG‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGaaa > 2:9282685/1‑93 (MQ=255) | GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTC‑G‑CAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA > NC_000913/3930584‑3930763 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |