Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,315,907 | +A | coding (436/759 nt) | phnK ← | ATP‑binding component of phosphonate transport |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,315,903 | 1 | . | A | 99.6% | 915.7 / ‑3.8 | 246 | coding (440/759 nt) | phnK | ATP‑binding component of phosphonate transport |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base A (123/122); total (123/123) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.01e-01 |
Only 100 of 279 total aligned reads displayed.
CATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑AAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCGT > NC_000913/4315811‑4315990 | aTCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCAGCAGGTTGCCGGCAATCTGCAAACGCCGCTGCATACCGCCGG‑a > 2:5266185/1‑93 (MQ=255) aGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaa < 1:7098185/93‑2 (MQ=255) aGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaa > 2:159608/1‑92 (MQ=255) gCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaag > 2:2499073/1‑91 (MQ=255) gCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaag < 2:1777780/93‑3 (MQ=255) gCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaag > 1:3248278/1‑91 (MQ=255) gCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaag > 2:3663029/1‑91 (MQ=255) cccGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaagg < 1:8449905/93‑4 (MQ=255) ccgccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaaggt < 1:6425338/93‑5 (MQ=255) ccgccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑aaaaaggt < 1:8146432/93‑5 (MQ=255) ccgccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTCCATACCGCCGG‑aaaaaggg > 1:382823/1‑89 (MQ=255) gccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAggtgg > 2:3857402/1‑93 (MQ=255) cggtcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTc < 1:8865283/93‑1 (MQ=255) cggtcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTc < 2:3303896/93‑1 (MQ=255) ggtcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCg > 2:3953824/1‑93 (MQ=255) tcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGc < 2:7138109/93‑1 (MQ=255) tcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACACTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGCCGGc > 1:1412147/1‑93 (MQ=255) cggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCa < 2:3007987/93‑1 (MQ=255) ggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAg > 2:4766877/1‑93 (MQ=255) ggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAg < 1:9811104/93‑1 (MQ=255) gtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAgg > 1:2045354/1‑93 (MQ=255) ttCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGgt > 2:6113890/1‑93 (MQ=255) ttCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGgt > 1:4139822/1‑93 (MQ=255) cATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGgtcg < 2:3574242/93‑1 (MQ=255) cATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGgtcg > 1:1881618/1‑93 (MQ=255) cATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGgtcg > 1:4550306/1‑93 (MQ=255) tCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCACTCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGgtcgtg > 2:8539841/1‑92 (MQ=255) tCCATAAACACCAGCTTCGGATGCATCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGTTGCATACCGCCGGAAAAAGCTGGTCGGCAGctcgtc > 1:445185/1‑93 (MQ=255) cATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGa > 1:4332503/1‑93 (MQ=255) cATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGa < 1:3282378/93‑1 (MQ=255) tAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATc < 1:5501414/93‑1 (MQ=255) aaaaCACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATc < 2:8715284/92‑1 (MQ=255) aaaCACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATGCCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATcc < 2:4574501/93‑1 (MQ=255) aaCACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCg > 2:2688169/1‑93 (MQ=255) acCATCCTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGCGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑AAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTg < 1:9530501/93‑1 (MQ=255) acCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGtt < 1:6805691/93‑1 (MQ=255) aGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGc > 1:4314832/1‑93 (MQ=255) cGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGaa < 1:5175371/93‑1 (MQ=255) gATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtc < 1:5206131/93‑1 (MQ=255) gATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtc > 1:517959/1‑93 (MQ=255) gATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtc > 1:832581/1‑93 (MQ=255) gCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTcc > 2:1406063/1‑93 (MQ=255) cGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCGGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCa < 1:1073900/93‑1 (MQ=255) cGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCa < 2:6003087/93‑1 (MQ=255) gTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCAc > 1:1022422/1‑93 (MQ=255) gTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCAc > 1:1618958/1‑93 (MQ=255) tCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCAcc > 2:4200725/1‑93 (MQ=255) cACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACct > 1:9922398/1‑93 (MQ=255) cACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACct > 2:8271485/1‑93 (MQ=255) aCCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctc > 2:2960814/1‑93 (MQ=255) aCCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctc < 1:5948199/93‑1 (MQ=255) ccAGGGTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctct < 1:1548625/93‑1 (MQ=255) aGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTc < 1:9996809/93‑1 (MQ=255) ggTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTcc < 2:8848801/93‑1 (MQ=255) ggTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTcc < 2:2103534/93‑1 (MQ=255) gtggCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTCCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCa < 2:3761355/90‑1 (MQ=255) gTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGGATCTCCACCTCTTCCa > 1:6183969/1‑93 (MQ=255) gTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCa > 2:4335675/1‑93 (MQ=255) gTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCa > 2:8156574/1‑93 (MQ=255) gTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCa > 1:7629136/1‑93 (MQ=255) gTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCa > 1:2077664/1‑93 (MQ=255) cGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCa < 1:7506938/93‑1 (MQ=255) gggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCAc > 2:7915634/1‑93 (MQ=255) cAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTc < 2:96676/93‑1 (MQ=255) cAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTc < 1:4276484/93‑1 (MQ=255) cAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGGTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTc > 2:7756986/1‑93 (MQ=255) aaTCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCt < 2:6280831/93‑1 (MQ=255) aaTCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCt > 1:8018352/1‑93 (MQ=255) tCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTgc > 1:3176541/1‑93 (MQ=255) tCTGCAAACGCGGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTgc < 2:4280302/93‑1 (MQ=255) tGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTgcgc > 2:6848402/1‑93 (MQ=255) gCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGcgcg > 1:658603/1‑93 (MQ=255) gCAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGcgcg < 1:8693476/93‑1 (MQ=255) cAAACGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCgg < 1:4765802/93‑1 (MQ=255) aaaCGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCggg > 2:9279306/1‑92 (MQ=255) aaaCGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGt > 2:9085029/1‑93 (MQ=255) aaaCGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGt > 2:5142965/1‑93 (MQ=255) aaaCGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGt < 2:1214557/93‑1 (MQ=255) aaCGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTg > 1:2690989/1‑93 (MQ=255) aaCGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTg > 2:7397513/1‑93 (MQ=255) aaCGCTGCTGCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTCCTGCGCGGTg < 2:6548287/93‑1 (MQ=255) ctgctgCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCAc > 2:7685947/1‑93 (MQ=255) ctgctgCATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCAc > 2:4664397/1‑93 (MQ=255) tgctgcATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGACACTTCTGCGCGGTGGCACg > 1:254856/1‑93 (MQ=255) gctgcATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGa > 2:4922476/1‑93 (MQ=255) ctgcATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGaa < 1:2859978/93‑1 (MQ=255) gcATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAata < 2:3471270/93‑1 (MQ=255) gcATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAata > 1:2956718/1‑93 (MQ=255) gcATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAata > 2:8052832/1‑93 (MQ=255) cATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAatat < 1:9442273/93‑1 (MQ=255) cATACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAatat > 2:3279208/1‑93 (MQ=255) aTACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATc < 2:6993314/93‑1 (MQ=255) aTACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATc > 2:349193/1‑93 (MQ=255) aTACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATc < 1:5796214/93‑1 (MQ=255) aTACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGGCGTCGATCCGGGTGGCGGGAATCTGCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGCGGCACCCATATc > 2:550046/1‑93 (MQ=255) tACCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCg < 1:2289895/93‑1 (MQ=255) aCCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGc < 1:9114343/93‑1 (MQ=255) aCCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGc < 2:522968/93‑1 (MQ=255) aCCGCCGGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGc > 2:9402303/1‑93 (MQ=255) gccgGAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGGATATCGCCGt > 2:200520/1‑93 (MQ=255) | CATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCGG‑AAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCGT > NC_000913/4315811‑4315990 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |