| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,448,541 | +C | intergenic (+46/‑92) | ytfQ → / → ytfR | putative LACI‑type transcriptional regulator/YtfR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,448,541 | 1 | . | C | 99.7% | 855.7 / ‑4.3 | 300 | intergenic (+46/‑92) | ytfQ/ytfR | putative LACI‑type transcriptional regulator/YtfR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (181/118); total (181/119) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.97e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 | |||||||||||
Only 100 of 343 total aligned reads displayed.
ATACCGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CG‑‑G‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCG > NC_000913/4448449‑4448623 | aTACCGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑Cg > 2:8392696/1‑93 (MQ=255)aTACCGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑Cg < 1:4597231/93‑1 (MQ=255)aTACCGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑Cg > 2:5742602/1‑93 (MQ=255) tACCGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑Cgc > 1:6672509/1‑92 (MQ=255) aCCGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑Cgcg > 1:9781603/1‑91 (MQ=255) cGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑Cgcgcc < 1:635484/93‑5 (MQ=255) cGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑Cgcgcc < 2:3241506/93‑5 (MQ=255) aagaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCgg > 1:2538922/1‑93 (MQ=37) agaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGc > 1:2355283/1‑93 (MQ=37) agaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGc > 1:2813434/1‑93 (MQ=37) gaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCg > 1:1325683/1‑93 (MQ=37) aaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGa > 2:4352547/1‑93 (MQ=37) tAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATgg < 1:2094958/93‑1 (MQ=37) agaagaagaAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGc > 1:2940119/1‑93 (MQ=37) gaagaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCa > 2:1961317/1‑93 (MQ=37) aaagaagaaAAATATGGGGTATTGAGGTTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCa < 2:9510314/92‑1 (MQ=25) aagaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCAc < 2:6515650/93‑1 (MQ=37) aagaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCAc > 1:6874220/1‑93 (MQ=37) gaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTg > 1:8808108/1‑93 (MQ=37) gaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAg > 1:2226950/1‑93 (MQ=37) aaaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGc > 1:7670259/1‑93 (MQ=37) aaaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGc > 1:5628889/1‑93 (MQ=37) aaaaTGGGGGGTATGGAGGTTTGCTATCCCTGATGCCGTTTCGTAGGCGGAATAGGGC‑G‑CT‑‑CGCCC‑CGCACCCGGCGATGGTGCACTGAAGcc < 2:8885362/93‑1 (MQ=255) aaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCt > 1:3519161/1‑93 (MQ=37) aaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCt > 1:9087546/1‑93 (MQ=37) aaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTg < 1:8129230/93‑1 (MQ=37) atatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGa > 1:9141066/1‑93 (MQ=37) tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt < 2:1385219/93‑1 (MQ=37) tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCCAGCGTGCACTGAAGCCTGAt > 2:6927829/1‑93 (MQ=21) atGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATg > 2:4569079/1‑93 (MQ=25) atGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATg > 1:7107645/1‑93 (MQ=25) tGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGc > 2:1742064/1‑93 (MQ=25) tGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGc < 2:8638426/93‑1 (MQ=25) ggggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATggg > 2:5498141/1‑91 (MQ=25) ggggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCg > 2:583762/1‑93 (MQ=25) ggggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCg < 1:5110511/93‑1 (MQ=25) ggggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCg < 2:6981722/93‑1 (MQ=25) ggggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCg < 1:4711224/93‑1 (MQ=25) gTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACg > 2:5030327/1‑93 (MQ=25) gTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGATGCACTGAAGCCTGATGCGACg > 1:4995832/1‑93 (MQ=25) tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc < 1:7367567/93‑1 (MQ=25) aTTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCt > 2:4995518/1‑93 (MQ=25) aTTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCt > 1:8629868/1‑93 (MQ=25) ttGAGGGTTGCTATGCCTGCTGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATACGGCGATGGCGCACTGAAGCCTGATGcgccgcgt > 1:3981002/1‑91 (MQ=21) ttGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCtt > 2:2156911/1‑93 (MQ=25) gAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTAc > 1:3422852/1‑93 (MQ=25) gggCTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAATGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCCCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCATGATGTGAGGCTTAcct > 2:8749405/1‑92 (MQ=21) ggTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcgc > 1:3225891/1‑93 (MQ=25) gTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcgcg > 1:5981957/1‑93 (MQ=25) tGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTc < 1:3039433/93‑1 (MQ=21) tGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTc > 1:5526847/1‑93 (MQ=25) tATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTa > 2:9079273/1‑93 (MQ=25) tATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTa > 2:3671850/1‑93 (MQ=25) tATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTa > 2:3603049/1‑93 (MQ=25) tATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTa < 2:5204080/93‑1 (MQ=25) tATGCCTGATGCCGATTCGTAGCCGGAATAGGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTa < 1:6739217/93‑1 (MQ=21) tGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATc > 2:9320579/1‑93 (MQ=21) gCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCa < 2:2641439/93‑1 (MQ=21) gCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCa < 2:4123429/93‑1 (MQ=25) gCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCa < 1:4154316/93‑1 (MQ=21) gCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCa < 1:1774938/93‑1 (MQ=21) ccTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCAt < 1:6567824/93‑1 (MQ=21) cTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGACGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATg > 1:9700446/1‑93 (MQ=21) cTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATg < 2:10018038/93‑1 (MQ=21) cTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATg > 1:6535060/1‑93 (MQ=21) tGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGc > 1:1131293/1‑93 (MQ=21) tGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGc > 1:5589025/1‑93 (MQ=21) ggtGCCGGTGCGTAGGCCGGATAAGTCTGTCG‑‑CG‑‑C‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc < 1:497544/91‑1 (MQ=17) gATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCCTCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc > 2:920810/1‑93 (MQ=21) gATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc < 2:2175914/93‑1 (MQ=21) gATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc < 2:6783768/93‑1 (MQ=21) gATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc > 2:2900988/1‑93 (MQ=21) tGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTa > 2:7486533/1‑93 (MQ=21) gCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTAc > 1:3780261/1‑93 (MQ=21) ccGATTCGTAGGCGGGATAAGGC‑G‑CTGGCG‑‑C‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACt < 1:4417351/93‑1 (MQ=21) cGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTg > 2:1695307/1‑93 (MQ=18) gATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTgg > 1:9463776/1‑93 (MQ=21) aTTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTggg > 2:3334726/1‑93 (MQ=21) aTTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTggg > 1:7505848/1‑93 (MQ=18) ttCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGa > 1:1543417/1‑93 (MQ=21) tCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAg < 2:9774410/93‑1 (MQ=18) tAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCAc < 1:6789153/93‑1 (MQ=21) aGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACg < 1:9259924/93‑1 (MQ=21) ggCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGc > 1:5346203/1‑93 (MQ=21) tccGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATTCGGCGATGGTGCACTGTATCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATTATGCCTACTGGGAGCACGCt > 2:7714773/2‑93 (MQ=21) gCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCt > 2:605807/1‑93 (MQ=21) ccGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCtt < 1:617915/93‑1 (MQ=21) cGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCttt < 1:8343800/93‑1 (MQ=21) ggATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTa < 1:9404807/93‑1 (MQ=21) ggATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTa > 2:4106076/1‑93 (MQ=21) ggATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTa < 1:4413206/93‑1 (MQ=21) gATAAGGC‑T‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTac < 2:1021101/93‑1 (MQ=21) gATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTac > 1:785501/1‑93 (MQ=21) gATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTac > 2:731761/1‑93 (MQ=21) gATAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTac > 1:3105371/1‑93 (MQ=21) aTAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCGCTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTaca < 1:1396515/93‑1 (MQ=21) aTAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTacc > 2:8174995/1‑92 (MQ=21) aTAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTaca < 2:8009366/93‑1 (MQ=25) aTAAGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTaca < 2:4687789/93‑1 (MQ=25) aaGGC‑G‑CT‑‑CGC‑GCCGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACAcc < 1:5733029/93‑1 (MQ=25) | ATACCGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGC‑G‑CT‑‑CG‑‑G‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCG > NC_000913/4448449‑4448623 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |