| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,237,242 | +C | intergenic (+55/‑342) | ygjT → / → ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,237,240 | 1 | . | C | 99.1% | 698.0 / ‑1.5 | 225 | intergenic (+53/‑344) | ygjT/ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base C (169/54); total (170/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.30e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.51e-01 | |||||||||||
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
CTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CT‑C‑CT‑CT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCA > NC_000913/3237148‑3237325 | cTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑ct > 1:830567/1‑93 (MQ=255) tGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑ct‑c < 1:457969/93‑1 (MQ=255) tGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑ct‑c > 1:3309516/1‑93 (MQ=255) tGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑ct‑c > 2:3083000/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTATCGGCATGATAGGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑ct‑c‑c > 2:6447085/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑ct‑c‑c < 2:9128821/93‑1 (MQ=255) ggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑ct‑c‑cc < 2:5058220/93‑2 (MQ=255) ggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGAGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑ct‑c‑cc > 1:4919805/1‑92 (MQ=255) tGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑ct‑c‑cctc < 1:6919481/93‑4 (MQ=255) tGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑ct‑c‑cctc < 1:4211747/93‑4 (MQ=255) aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑ctcc‑ct‑ct‑cc < 2:1316451/93‑1 (MQ=255) ttATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGGACCGTTTT‑ctcc‑ct‑ct‑ccc > 1:9781746/1‑92 (MQ=255) ttATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑ctcc‑ct‑ct‑ccc > 1:89094/1‑92 (MQ=255) tATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑ctcc‑ct‑ct‑ccct > 1:8200550/1‑91 (MQ=255) tATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑ctcc‑ct‑ct‑ccct > 1:2470281/1‑91 (MQ=255) tATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑ctcc‑ct‑ct‑ccct < 2:2902510/93‑3 (MQ=255) tATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑ctcc‑ct‑ct‑ccct > 2:8814111/1‑91 (MQ=255) aTCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑ctcc‑ct‑ct‑ccctt < 2:6358102/93‑4 (MQ=255) aTCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑ctcc‑ct‑ct‑ccctt > 1:5387493/1‑90 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑ctcc‑ct‑ct‑cccttc > 2:6881181/1‑89 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCa < 2:5230014/93‑1 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCa > 1:5831772/1‑93 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCa < 1:4280194/93‑1 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCa > 2:6720171/1‑93 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAg < 1:6137314/93‑1 (MQ=255) cATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAgg > 2:7443962/1‑93 (MQ=255) cATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAgg < 2:3407479/93‑1 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGga > 2:1214226/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGga > 2:2499360/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGga < 1:1875939/93‑1 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGga > 1:2882154/1‑93 (MQ=255) gATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGgag < 1:8359531/93‑1 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGgagg > 2:9294753/1‑92 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGgaga > 2:1371230/1‑93 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGagag < 1:2589242/93‑1 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGagag < 2:194910/93‑1 (MQ=255) acagcagcGTGTTTGATAATTTTTAATCTGATTAAGCCTTGTACCCTGTCATTAATATGCGCGCCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTGCAGGGagag < 2:4070238/91‑1 (MQ=255) aaGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAgg < 1:8163090/93‑1 (MQ=255) aaGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAgg < 2:5966507/93‑1 (MQ=255) agcagcGGGGGGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAggg < 2:2613237/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 2:4788010/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 1:3247203/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 1:9152225/93‑1 (MQ=255) agcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATAAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCg < 2:4674434/93‑1 (MQ=255) gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgg < 1:1389619/93‑1 (MQ=255) cGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCggg < 1:1729397/93‑1 (MQ=255) cGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACACGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCggg < 2:4387357/93‑1 (MQ=255) ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTC‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgggg < 2:5620555/93‑1 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCggggg > 1:1028407/1‑92 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt < 2:9753658/93‑1 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTg > 2:2702016/1‑93 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGTCGTGTACCCTGGCATTAACATGAGCACCGTGTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGGCGGGGTgg > 2:8950622/1‑92 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa < 2:3537999/93‑1 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa > 1:3630580/1‑93 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa > 1:662962/1‑93 (MQ=255) tGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAg > 1:9536956/1‑93 (MQ=39) tGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CT‑CACT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAg > 2:9551355/1‑93 (MQ=255) ggATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAgg > 2:621738/1‑93 (MQ=39) aaTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTaa > 1:2139959/1‑93 (MQ=38) tttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtt > 2:7850556/1‑93 (MQ=38) ttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttt > 1:4092237/1‑93 (MQ=38) ttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttt > 1:7111511/1‑93 (MQ=38) tttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAtttt > 2:4614534/1‑93 (MQ=38) ttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGGGAGGGGAAttttt > 2:5449742/1‑93 (MQ=255) tAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTACTTTTTc > 2:4646966/1‑93 (MQ=38) tGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCAcc > 1:1673542/1‑93 (MQ=38) gCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCg > 1:9431909/1‑93 (MQ=38) gCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGGAATTTTTCGCACCg > 2:2400895/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATg > 2:5747494/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATg > 2:7893661/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGAGAGGGTAATTTTTCGCACCGATg > 1:6744023/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCAGGGGGAGGGCAATTTTTCGCAACGATg > 1:3039580/1‑93 (MQ=255) cGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGGGAAGGTAATTTTTCGCACCGCTGCCGGc > 1:157237/1‑93 (MQ=37) gtgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGcc > 1:5870717/1‑93 (MQ=37) gtgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGcc > 2:8153411/1‑93 (MQ=37) gtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTg > 2:4143256/1‑93 (MQ=37) gtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTg > 2:6601122/1‑93 (MQ=37) aCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGtt > 1:2131062/1‑93 (MQ=37) ccTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGtttc > 1:7301689/1‑91 (MQ=37) cTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTccc > 2:9867978/1‑93 (MQ=37) tacATTAACATGAGCCCCGTTTTCCC‑C‑CTCCC‑CCTTCCAGGGGGAGGGGCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCt < 1:1788437/91‑1 (MQ=18) gTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTtcccc > 1:7417961/1‑92 (MQ=37) tCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTcccccc > 1:9688002/1‑91 (MQ=25) cATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTccccccc > 2:7369104/1‑90 (MQ=25) ttAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTtcccctcccc > 1:9319313/1‑93 (MQ=25) ttAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTTAcc > 1:6361331/1‑93 (MQ=21) tAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAccc > 1:10004149/1‑93 (MQ=25) tAACATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCAccc > 2:1283680/1‑93 (MQ=21) aaCATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCATCCCCCt > 1:8633120/1‑93 (MQ=25) aCATGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCCCTCCCCCTa > 1:7969897/1‑93 (MQ=21) aTGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCcctcaccctcac > 1:8479909/1‑93 (MQ=21) aTGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAAc > 2:1546544/1‑93 (MQ=21) tGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCCCTCCCCCTAAcc > 2:3177005/1‑93 (MQ=21) tGAGCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAAcc > 2:1807336/1‑93 (MQ=21) gCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCaccctcaccctc > 1:8220962/1‑93 (MQ=18) gCACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCCCCCCAACCctc > 2:3052194/1‑93 (MQ=21) cACCGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCCTACCctct > 1:4800707/1‑93 (MQ=18) cGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTccc > 1:9947242/1‑93 (MQ=18) cGTTTT‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCCCCCCCCCACCCTCTccc > 2:9603087/1‑93 (MQ=18) tttt‑CTCC‑CT‑CTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTACCCCCACCCTCAAACACTccccc > 2:2523741/1‑92 (MQ=17) | CTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CT‑C‑CT‑CT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCA > NC_000913/3237148‑3237325 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |