| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 279335 | NA (NA) | 471 (1.220) | 156/184 | 0.1 | 98.1% | coding (252/339 nt) | b4505 | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | 370982 = | 9 (0.020) | coding (535/882 nt) | mhpC | 2‑hydroxy‑6‑ketonona‑2,4‑dienedioic acid hydrolase | |||||
Only 100 of 349 total aligned reads displayed.
CAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTGGAGACGGCGGATCTCGGCCTGAGCATCTGACTGTTCTTT > NC_000913/279245‑279427 | cAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTAcagc < 2:3823126/93‑1 (MQ=31)cAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTAcagc < 2:6952417/93‑1 (MQ=31)cAGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTAcagc < 2:5410929/93‑1 (MQ=31) aGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTAcagca < 2:8044055/93‑1 (MQ=32) aGCTAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTAcagca < 1:3053220/93‑1 (MQ=32) tAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGATAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCt < 2:6262132/93‑1 (MQ=21) tAAACAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCt < 1:3779115/93‑1 (MQ=34) aaaCAACAGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAAAACCGAAAGAGTTAATTGAAAGGGGGGTTGCATTGACAGATTGAATCTCCAGCAGCtt > 2:572902/1‑93 (MQ=11) caacaGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCttttt < 1:8852159/93‑1 (MQ=38) aacaGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCtttttt > 1:4678505/1‑93 (MQ=37) acaGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCttttttt < 2:4435095/93‑1 (MQ=38) caGACCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTa < 1:3396849/93‑1 (MQ=255) aCCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAata < 1:8216019/93‑1 (MQ=255) aCCGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAata < 2:8101041/93‑1 (MQ=255) ccGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAatat > 2:137146/1‑93 (MQ=255) cGAGAAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATg < 1:6993931/93‑1 (MQ=255) agaAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTc > 1:3665293/1‑93 (MQ=255) gaAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTcc > 2:2455352/1‑93 (MQ=255) gaAAGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTcc < 1:2479416/93‑1 (MQ=255) aaaGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTccc < 1:3520032/93‑1 (MQ=255) aaaGACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTccc < 2:6034393/93‑1 (MQ=255) gACACTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGtt > 1:5087123/1‑93 (MQ=255) cacTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGTGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcg < 1:1020194/93‑1 (MQ=255) cacTGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcg < 1:2793671/93‑1 (MQ=255) tGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtcg > 2:4726965/1‑93 (MQ=255) tGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtcg < 1:9219829/93‑1 (MQ=255) tGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtcg > 2:491228/1‑93 (MQ=255) tGAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTtcgtcg < 1:6022313/93‑1 (MQ=255) gAAGTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCgg < 1:2281687/93‑1 (MQ=255) gTTCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTaa < 1:2847038/93‑1 (MQ=255) ttCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAc < 1:5864869/93‑1 (MQ=255) tCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAcc > 2:3179974/1‑93 (MQ=255) tCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGCTCGTCGGTAAcc < 2:5845311/93‑1 (MQ=255) tCAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGGGTTGAATTGACAGATTGAATCTACAGCAGATTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGCTAAcc > 1:2541862/1‑93 (MQ=21) cAAAACACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAAccc < 2:8721399/93‑1 (MQ=255) aaaCACCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGt < 1:4009511/93‑1 (MQ=255) acacCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGttt < 2:4324486/93‑1 (MQ=255) cacCGAAAGAGATAATTGAAAGGTGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTc < 2:5526239/93‑1 (MQ=255) cacCGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTc < 2:3578501/93‑1 (MQ=255) ccGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAg > 2:1086786/1‑93 (MQ=255) cGAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGc > 2:7780105/1‑93 (MQ=255) gAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGct > 1:9110741/1‑93 (MQ=255) gAAAGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGct > 2:2039636/1‑93 (MQ=255) aaaGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGctc > 2:615449/1‑93 (MQ=255) aaGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGctct > 1:4915865/1‑93 (MQ=255) aaGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGctct < 2:5241384/93‑1 (MQ=255) aaGAGATAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGctct > 2:2954389/1‑93 (MQ=255) gagaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCttt < 2:3477477/93‑1 (MQ=255) agaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTc < 2:9129074/93‑1 (MQ=255) gaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCt < 2:4649082/93‑1 (MQ=255) gaTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCt > 2:652378/1‑93 (MQ=255) aTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTg > 1:9557680/1‑93 (MQ=255) aTAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTg > 1:9853465/1‑93 (MQ=255) tAATTGAAAGGGGTGTTGCATTGACAGATTGAATCTACAGCAGCTTTTTTTAATATGTCCCGTTCGTCGGTAACCCGTTTCAGCTCTTTCTgg > 1:1074976/1‑93 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |