Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,376,038 | 0 | A | G | 65.6% | 390.8 / inf | 410 | G83G (GGT→GGC) | rplM | 50S ribosomal subunit protein L13 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (72/69); new base G (129/140); total (201/209) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.03e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 451 total aligned reads displayed.
AGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGAACGATGATGTA > NC_000913/3375946‑3376130 | aGCGGGTCTTTTGGCAACATGCCTTTAACCGCTATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATa < 2:7134280/93‑1 (MQ=255) cGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATacc < 2:5159852/93‑1 (MQ=255) gggCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATgcca > 2:5247403/1‑93 (MQ=255) gggCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATacca < 2:2485595/93‑1 (MQ=255) ggCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATgccac < 1:119009/93‑1 (MQ=255) ggCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATgccac > 1:8414232/1‑93 (MQ=255) cTTTTGGCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGa > 1:9061141/1‑93 (MQ=255) ttttGGCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGAt > 2:805909/1‑93 (MQ=255) ttttGGCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGACACCGAt > 2:471066/1‑93 (MQ=255) tttGGCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGAtg < 2:9765698/93‑1 (MQ=255) ttGGCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGAtgt > 2:5428992/1‑93 (MQ=255) ttGGCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGAtgt > 1:5349980/1‑93 (MQ=255) tGGCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGAtgtg < 2:6524229/93‑1 (MQ=255) gCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGc < 2:7854920/93‑1 (MQ=255) gCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGc > 1:9432823/1‑93 (MQ=255) cAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGcc < 2:8754550/93‑1 (MQ=255) aaCATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCg > 2:62476/1‑93 (MQ=255) aaCATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCg > 2:4278822/1‑93 (MQ=255) aCATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCgg < 2:3544110/93‑1 (MQ=255) cATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGgt < 2:7406521/93‑1 (MQ=255) tGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGgtgt > 2:6195105/1‑93 (MQ=255) gCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGtgtg < 2:9580538/93‑1 (MQ=255) ccTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTgtgg > 2:1366545/1‑93 (MQ=255) cTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTgtggt < 1:4410833/93‑1 (MQ=255) cTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTgtggt > 1:8660513/1‑93 (MQ=255) ttAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGa < 2:2677010/93‑1 (MQ=255) aaCCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATa < 1:5090000/93‑1 (MQ=255) aaCCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATa < 1:9753566/93‑1 (MQ=255) cgcgATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTa < 1:6045826/93‑1 (MQ=255) cgATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTaca < 1:1025707/93‑1 (MQ=255) gATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTacac < 1:5796668/93‑1 (MQ=255) tttCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACtt < 1:1576582/93‑1 (MQ=255) ttCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACttt < 2:3361626/93‑1 (MQ=255) tCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTg < 1:1457147/93‑1 (MQ=255) aTCACACGCTCAGGACGTCGAGCAATCATCTCATCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCa < 1:7097365/93‑1 (MQ=255) aTCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCa < 2:5746759/93‑1 (MQ=255) aTCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCa < 2:9142775/93‑1 (MQ=255) tCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAg < 2:8289417/93‑1 (MQ=255) tCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAg > 2:993895/1‑93 (MQ=255) tCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAg > 1:237635/1‑93 (MQ=255) cacaCGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGt < 2:1271965/93‑1 (MQ=255) acacGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTa < 2:5576597/93‑1 (MQ=255) acGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACg > 2:2352777/1‑93 (MQ=255) cgcgCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGc < 2:699784/93‑1 (MQ=255) gCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCt > 1:3231022/1‑93 (MQ=255) cAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCttgt > 2:169298/1‑93 (MQ=255) ggACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCttgttg > 1:179779/1‑93 (MQ=255) ggACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCttgttg > 1:305457/1‑93 (MQ=255) aCGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGcc > 1:6176996/1‑93 (MQ=255) cGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCg < 1:8090366/93‑1 (MQ=255) ggCGAGCAATCATCTCTTCAAATGTCGCTTGTTTGAGCCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCgg < 1:4783686/93‑1 (MQ=255) ggCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCgg < 2:755852/93‑1 (MQ=255) gCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGt < 2:1427120/93‑1 (MQ=255) gCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGt > 1:8852624/1‑93 (MQ=255) cGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGtt < 2:894009/93‑1 (MQ=255) aGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTAc > 1:3945965/1‑93 (MQ=255) aGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGGGATAGTCGACTTTGTACGTACGCTTGTTGCCGGTTaa > 1:2155060/1‑92 (MQ=255) gCAATCATCTCTTCAAAGGTCGTTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTTTTGCCGGTTACa < 2:4855851/93‑1 (MQ=255) gCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACa > 1:4545571/1‑93 (MQ=255) aaTCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGGGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGc > 1:2552888/1‑93 (MQ=255) atcatcTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCa > 2:6864151/1‑93 (MQ=255) tcatcTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCaa > 1:9030287/1‑93 (MQ=255) acatcTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATTCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCaa < 2:7661616/92‑1 (MQ=255) catcTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGGGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGAAAc > 1:6665042/1‑93 (MQ=255) atcTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACt < 2:7791261/93‑1 (MQ=255) tctcTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACtt < 2:3900138/93‑1 (MQ=255) tctcTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACtt > 2:7686954/1‑93 (MQ=255) tctTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTg > 2:4407174/1‑93 (MQ=255) ttCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTc > 2:3185168/1‑93 (MQ=255) ttCAAAGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGGACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTc > 1:5183057/1‑93 (MQ=255) cAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAg > 1:9856681/1‑93 (MQ=255) aaaGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATACTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCCACTTTGTCAGc > 1:7524922/1‑93 (MQ=255) aGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGt > 2:3649634/1‑93 (MQ=255) aGGTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGt < 1:6285167/93‑1 (MQ=255) ggTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGtt > 1:2865384/1‑93 (MQ=255) ggTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGtt > 1:4170030/1‑93 (MQ=255) ggTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGtt > 2:1837922/1‑93 (MQ=255) gTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGTCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTc < 1:3411383/93‑1 (MQ=255) gTCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTc < 1:6788147/93‑1 (MQ=255) gTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCACCTTTGTCAGCGTTc < 2:8538238/93‑1 (MQ=255) gTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTc > 2:3758176/1‑93 (MQ=255) tCGCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCa > 1:7735107/1‑93 (MQ=255) gCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGa < 1:3514907/93‑1 (MQ=255) gCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGa < 2:5995685/93‑1 (MQ=255) gCTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGa > 1:4676075/1‑93 (MQ=255) cTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGaa > 2:6617218/1‑93 (MQ=255) cTTGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGaa < 1:8159451/93‑1 (MQ=255) tGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGAACg > 1:727511/1‑93 (MQ=255) tGTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGAACg > 1:4955574/1‑93 (MQ=255) gTTTGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGAACga < 1:4307894/93‑1 (MQ=255) gTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGAACga < 2:8362178/93‑1 (MQ=255) tttGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGAACgat < 2:20632/93‑1 (MQ=255) tGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGAACgatga > 1:2772072/1‑93 (MQ=255) tGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGAACgatga < 1:6491919/93‑1 (MQ=255) tGATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGAACgatga < 1:7913565/93‑1 (MQ=255) tGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACGTTGTCAGTACGCTTGTTACCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGAACgatga < 1:6375142/93‑1 (MQ=255) gATGCCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGAACgatgat > 2:8190027/1‑93 (MQ=255) gATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGAACgatgat < 1:5470134/93‑1 (MQ=255) tACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGAACGATGATGt > 1:7614930/1‑93 (MQ=255) tACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGAACGATGATGt < 2:7273199/93‑1 (MQ=255) | AGCGGGCCTTTTGGCAACATGCCTTTAACCGCGATTTCAATCACACGCTCAGGACGGCGAGCAATCATCTCTTCAAAGGTCGCTTGTTTGATACCACCGATGTGGCCGGTGTGGTGATAGTACACTTTGTCAGTACGCTTGTTGCCGGTTACAGCAACTTTGTCAGCGTTCAGAACGATGATGTA > NC_000913/3375946‑3376130 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |