| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,806,223 | A→G | I19M (ATA→ATG) | kdtA → | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic‑acid transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,806,223 | 0 | A | G | 98.7% | 1703.5 / 3.3 | 536 | I19M (ATA→ATG) | kdtA | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic‑acid transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (6/1); new base G (266/263); total (272/264) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.70e-01 | |||||||||||
Only 100 of 549 total aligned reads displayed.
AATCCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATACGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAGG > NC_000913/3806133‑3806312 | aaTCCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATTCg > 1:6243029/1‑93 (MQ=255)aaTCCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCg < 2:6604149/93‑1 (MQ=255) cccAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGctc < 1:487891/93‑1 (MQ=255) cccAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGctc < 1:1867188/93‑1 (MQ=255) ccAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGctct > 2:5399000/1‑93 (MQ=255) ccAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGctct > 1:7814396/1‑93 (MQ=255) ccAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGctct > 1:2969115/1‑93 (MQ=255) aGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTgg > 2:80300/1‑93 (MQ=255) gCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTggg > 2:2631071/1‑93 (MQ=255) gCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTggg > 1:5966077/1‑93 (MQ=255) gCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTggg > 1:8030638/1‑93 (MQ=255) gCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTggg > 2:3166554/1‑93 (MQ=255) cacaTCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGt < 1:3827911/93‑1 (MQ=255) caTCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTgc < 1:9258985/93‑1 (MQ=255) tCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTTGGTgcgc > 1:3096402/1‑93 (MQ=255) tCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTgcgt > 2:8196949/1‑92 (MQ=255) tCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTgcgc < 2:3291566/93‑1 (MQ=255) tCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTgcgc > 1:5425351/1‑93 (MQ=255) cATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCgg < 1:6146596/93‑1 (MQ=255) tAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGAc > 1:7563554/1‑93 (MQ=255) tAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCCCGCAc > 1:6350726/1‑93 (MQ=255) aGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGt > 1:2677350/1‑93 (MQ=255) gTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTa < 2:4866928/93‑1 (MQ=255) tCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTaa < 1:1674605/93‑1 (MQ=255) tCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTaa < 2:8674132/93‑1 (MQ=255) tCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTaa < 1:1443192/93‑1 (MQ=255) tCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTaa > 1:8876184/1‑93 (MQ=255) gcAGCTATTTACTAGCCTCGACTTGTTTTACCCCGCTCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTaa < 2:3895094/92‑1 (MQ=255) aGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAgg > 2:6069152/1‑93 (MQ=255) aGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAgg > 1:9362647/1‑93 (MQ=255) aGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATACGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAgg > 1:9861944/1‑93 (MQ=255) gCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGc < 1:8083817/93‑1 (MQ=255) gCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGc < 1:6537427/93‑1 (MQ=255) cTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCt > 2:2417356/1‑93 (MQ=255) tATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTc > 2:8461671/1‑93 (MQ=255) tATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTc > 1:2404527/1‑93 (MQ=255) aTTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTcc > 1:6656141/1‑93 (MQ=255) aTTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTcc < 2:3429973/93‑1 (MQ=255) aTTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTcc < 2:703292/93‑1 (MQ=255) aTTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATACGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTcc > 2:6999484/1‑93 (MQ=255) tttACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCg > 1:1203503/1‑93 (MQ=255) tACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGc > 2:1162106/1‑93 (MQ=255) aCTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGcc > 1:4754969/1‑93 (MQ=255) aCTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGcc < 1:7031375/93‑1 (MQ=255) cTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCt < 1:2063124/93‑1 (MQ=255) aTGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTAt > 2:5697242/1‑93 (MQ=255) aTGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATACGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTAt > 1:9059886/1‑93 (MQ=255) tGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATc > 2:4253965/1‑93 (MQ=255) tGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATc > 1:9622719/1‑93 (MQ=255) cTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATACGGCTCTGGGTGCGCGGACGTACGGCTCCGGCCTATCGa > 2:6424000/1‑93 (MQ=255) tCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGaa > 2:7162698/1‑93 (MQ=255) gAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGaaaa < 2:492339/93‑1 (MQ=255) gAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGaaaa < 1:2550127/93‑1 (MQ=255) gAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGaaaa < 1:1024737/93‑1 (MQ=255) aaTTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAAc < 1:6889586/93‑1 (MQ=255) aTTGCTTTACACCACCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACg > 2:6863013/1‑93 (MQ=255) ttGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGc < 2:9509569/93‑1 (MQ=255) cTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTgg < 2:1048935/93‑1 (MQ=255) ttACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTgggg < 2:305370/93‑1 (MQ=255) acacCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTg > 1:3986735/1‑93 (MQ=255) cacCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGa > 2:6818967/1‑93 (MQ=255) cacCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGa < 2:7398026/93‑1 (MQ=255) cGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACg < 2:3831709/93‑1 (MQ=255) gCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGt > 2:775363/1‑93 (MQ=255) cccTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGtt < 2:4719639/93‑1 (MQ=255) ccTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTa < 1:5056416/93‑1 (MQ=255) ttCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACg > 1:5251718/1‑93 (MQ=255) ttCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACg > 1:1942889/1‑93 (MQ=255) ctctACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGt < 1:7462949/93‑1 (MQ=255) tACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGtttt > 2:5321040/1‑93 (MQ=255) aCCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGttttt > 2:142342/1‑93 (MQ=255) cTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTAc < 1:1128228/93‑1 (MQ=255) cTTATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTAc < 1:1308965/93‑1 (MQ=255) ttATTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTAcc < 1:3341685/93‑1 (MQ=255) aTTCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGc > 1:838893/1‑93 (MQ=255) tCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACTCTGGGGTGAAAGTTACGGTTTTTACCGCCa > 1:2227894/1‑93 (MQ=255) tCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCa < 1:3452745/93‑1 (MQ=255) tCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCa > 1:8561806/1‑93 (MQ=255) tCAGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCa < 2:1584491/93‑1 (MQ=255) aGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATc < 1:8675206/93‑1 (MQ=255) aGCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGAGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATc < 1:56009/93‑1 (MQ=255) gCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAACCGCTGGGGGGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATcc > 1:8254096/1‑93 (MQ=255) gCCGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATcc > 2:586697/1‑93 (MQ=255) gCCGCGGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATcc < 2:2171623/93‑1 (MQ=255) cGCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGc > 1:5710623/1‑93 (MQ=255) gCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCt > 2:5105590/1‑93 (MQ=255) gCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCt < 2:4047692/93‑1 (MQ=255) gCTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCt < 2:3548550/93‑1 (MQ=255) cTGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTa > 2:1766963/1‑93 (MQ=255) cTGATCTGGATGCGGCTCTGAGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTa > 1:4595084/1‑93 (MQ=255) tGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTaa < 1:447051/93‑1 (MQ=255) tGATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTaa < 2:9213774/93‑1 (MQ=255) gATCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTaaa < 1:4274419/93‑1 (MQ=255) aTCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTaaaa < 1:7135983/93‑1 (MQ=255) tCTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAAc > 1:8820755/1‑93 (MQ=255) cTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAAcc < 2:4484172/93‑1 (MQ=255) cTGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAAcc < 2:228035/93‑1 (MQ=255) tGGATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCa < 2:2966245/93‑1 (MQ=255) gATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAgg < 2:7244169/93‑1 (MQ=255) gATGCGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAgg < 2:2741078/93‑1 (MQ=255) | AATCCCCAGCACATCCATAAGTCAGCTATTTACTATGCTCGAATTGCTTTACACCGCCCTTCTCTACCTTATTCAGCCGCTGATCTGGATACGGCTCTGGGTGCGCGGACGTAAGGCTCCGGCCTATCGAAAACGCTGGGGTGAACGTTACGGTTTTTACCGCCATCCGCTAAAACCAGG > NC_000913/3806133‑3806312 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |