| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,819,792 | A→G | V20V (GTA→GTG) | rpoZ → | RNA polymerase omega subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,819,792 | 0 | A | G | 99.8% | 1867.8 / NA | 578 | V20V (GTA→GTG) | rpoZ | RNA polymerase omega subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (300/277); total (301/277) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 593 total aligned reads displayed.
GTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTACTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGC > NC_000913/3819702‑3819881 | tCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTg < 2:6459600/93‑1 (MQ=255) cATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGCGCTgg > 2:7076487/1‑93 (MQ=255) aTTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGt > 1:4926052/1‑93 (MQ=255) tttCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTc < 2:9521211/93‑1 (MQ=255) tttCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTc > 2:3368763/1‑93 (MQ=255) tttCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTc > 1:5502186/1‑93 (MQ=255) tttCTTCACCGGTGGAGCTGTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTc > 1:8946872/1‑93 (MQ=255) tcttcACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTcgc < 1:7997297/93‑1 (MQ=255) cttcACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTcgcc > 2:2288670/1‑93 (MQ=255) cACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCcgcg < 2:9846094/93‑1 (MQ=255) cACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCcgcg > 2:8610086/1‑93 (MQ=255) aCCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGAACTGGTGCTGGTCGCcgcgc > 2:6612406/1‑93 (MQ=255) ccTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCcgcgcg > 1:1141531/1‑93 (MQ=255) cTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGt < 1:6516726/93‑1 (MQ=255) gtgGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTcg > 2:8039708/1‑93 (MQ=255) tgGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTcgc < 1:3662792/93‑1 (MQ=255) gAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCgcgc > 1:4625161/1‑93 (MQ=255) gAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCgcgc > 1:2010058/1‑93 (MQ=255) cTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCg > 1:9890877/1‑93 (MQ=255) cTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCg > 1:1707335/1‑93 (MQ=255) tttttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGt < 1:7145645/93‑1 (MQ=255) ttttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGGCGCGCGTCGCGCTCGTc > 1:8224292/1‑93 (MQ=255) tttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCa < 2:3475140/93‑1 (MQ=255) tttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCa > 1:9523020/1‑93 (MQ=255) ttAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAg > 2:7318633/1‑93 (MQ=255) tAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGa > 2:3233132/1‑93 (MQ=255) aaGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGAt > 1:7558539/1‑93 (MQ=255) aGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATg > 1:1411512/1‑93 (MQ=255) aGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATg < 1:3806585/93‑1 (MQ=255) gTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGc < 1:5906364/93‑1 (MQ=255) tATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCa < 1:2209582/93‑1 (MQ=255) gaTGGCACGCGTATCTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGTCCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTAGTCAGATGCa < 2:1114714/92‑1 (MQ=255) tGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAgg > 2:1241947/1‑93 (MQ=255) tGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAgg < 1:6695088/93‑1 (MQ=255) gCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTa < 1:5674039/93‑1 (MQ=255) gCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTa < 1:627384/93‑1 (MQ=255) aCGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAgg < 2:1613221/93‑1 (MQ=255) aCGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAgg > 2:1848839/1‑93 (MQ=255) cgcgTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGc < 1:1894755/93‑1 (MQ=255) gcgTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCg > 2:7673404/1‑93 (MQ=255) tAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCggca > 1:2777957/1‑91 (MQ=255) tAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGaa < 1:7370493/93‑1 (MQ=255) tAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGaa > 1:9448515/1‑93 (MQ=255) tAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGaa > 2:4761846/1‑93 (MQ=255) tAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGaa > 1:6435384/1‑93 (MQ=255) tGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGa < 2:8283847/93‑1 (MQ=255) tGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGa > 1:4446915/1‑93 (MQ=255) tGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGa > 2:9181991/1‑93 (MQ=255) gTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGAt > 2:1180004/1‑93 (MQ=255) gTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGAt > 2:84752/1‑93 (MQ=255) ttCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATc > 1:1542744/1‑93 (MQ=255) ttCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATc < 1:3561270/93‑1 (MQ=255) tCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATcc < 2:8722778/93‑1 (MQ=255) tCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCAGCGCGTCGCGCGCGTCAGATGCAGGGAGGCGGAAAGGATcc > 1:2666694/1‑93 (MQ=255) aGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGc < 2:397566/93‑1 (MQ=255) ggACGCTGTAGAGAAAATTTGGAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGGAGGGGGAAAGGGTCCGCt > 1:8109649/1‑93 (MQ=255) ggACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCt > 1:9722567/1‑93 (MQ=255) aCGCTGTAGAGAAAATTGGTAACTGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTgg < 2:5541545/93‑1 (MQ=255) aCGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTgg < 1:1007435/93‑1 (MQ=255) aCGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTgg < 1:2936764/93‑1 (MQ=255) tGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTAcc > 2:58047/1‑93 (MQ=255) ggagagAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCTCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCg < 1:1249718/91‑1 (MQ=255) gTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCg > 2:2981632/1‑93 (MQ=255) gTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCg > 2:8850707/1‑93 (MQ=255) gTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCg > 1:321640/1‑93 (MQ=255) gTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTAGTACCg > 2:6819427/1‑93 (MQ=255) tAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCgg > 2:3788648/1‑93 (MQ=255) tAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCgg > 1:5151644/1‑93 (MQ=255) gagaAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGgaa > 1:8448620/1‑93 (MQ=255) gagaAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGgaa < 2:615680/93‑1 (MQ=255) agaAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGgaag < 1:3101011/93‑1 (MQ=255) gaAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGgaaga < 2:2114728/93‑1 (MQ=255) gaAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGgaaga < 1:3468307/93‑1 (MQ=255) aaaaTTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGgaagaa < 2:6896990/93‑1 (MQ=255) aaaTTGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGaaa < 2:4493875/93‑1 (MQ=255) ttGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACg > 1:4836540/1‑93 (MQ=255) tGGTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGa < 2:2507005/93‑1 (MQ=255) ggTAACCGTTTTGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGAt < 2:458643/93‑1 (MQ=255) 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ttttGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCAc < 2:6322314/93‑1 (MQ=255) tttgGACCTGGTGCTGGTCGCCCCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCAc < 1:8613095/93‑1 (MQ=255) tttGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACt < 1:9298632/93‑1 (MQ=255) ttGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTg < 2:5211337/93‑1 (MQ=255) tGACCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGt < 2:14234/93‑1 (MQ=255) tGACCGTGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGt < 1:6902680/93‑1 (MQ=255) gccTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTaa < 2:7383584/92‑1 (MQ=255) cccTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTaa < 2:7948595/92‑1 (MQ=255) aCCTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTaa > 1:2419489/1‑93 (MQ=255) ccTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAAt > 2:746340/1‑93 (MQ=255) ccTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAAt < 1:775489/93‑1 (MQ=255) ccTGGTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTATAAt > 2:5953501/1‑93 (MQ=255) ggTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATcgc > 1:52698/1‑93 (MQ=255) ggTGCTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATcgc > 1:3892226/1‑93 (MQ=255) | GTCATTTCTTCACCTGTGGAGCTTTTTAAGTATGGCACGCGTAACTGTTCAGGACGCTGTAGAGAAAATTGGTAACCGTTTTGACCTGGTACTGGTCGCCGCGCGTCGCGCTCGTCAGATGCAGGTAGGCGGAAAGGATCCGCTGGTACCGGAAGAAAACGATAAAACCACTGTAATCGC > NC_000913/3819702‑3819881 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |