Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 515,263 | C→T | P41S (CCT→TCT) | ybbL → | putative ATP‑binding component of a transport system |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 515,263 | 0 | C | T | 99.8% | 1763.0 / ‑6.2 | 502 | P41S (CCT→TCT) | ybbL | putative ATP‑binding component of a transport system |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (209/291); total (210/292) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 |
Only 100 of 515 total aligned reads displayed.
CAAAACGTAGGATATCTGGCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTCCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGTGAGGAT > NC_000913/515173‑515352 | cAAAACGTAGGATATCTGGCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCt > 2:902071/1‑93 (MQ=255) aaaaCGTAGGATATCTGGCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCtt < 1:4596031/93‑1 (MQ=255) aaaaCGTAGGATATCTGGCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCtt < 2:5306517/93‑1 (MQ=255) aaaCGTAGGATATCTGGCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGttcttc < 1:2326465/93‑1 (MQ=255) aaCGTAGGATATCTGGCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTtcttct < 1:1009830/93‑1 (MQ=255) tAGGATATCTGGCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGtt > 1:19200/1‑93 (MQ=255) ggATATCTGGCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTtgt > 1:9582835/1‑93 (MQ=255) ggATATCTGGCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTtgt > 2:1076866/1‑93 (MQ=255) gATATCTGGCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTtgtg < 1:6716034/93‑1 (MQ=255) atatCTGGCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTgg < 1:6391491/93‑1 (MQ=255) atCTGGCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCa < 2:9719978/93‑1 (MQ=255) tGGCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCaaaa < 1:2226977/93‑1 (MQ=255) tGGCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCaaaa > 2:1618221/1‑93 (MQ=255) ggCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAg < 2:9522254/93‑1 (MQ=255) cGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTa < 1:7183971/93‑1 (MQ=255) cGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTa > 2:9231469/1‑93 (MQ=255) gTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACgc > 2:2533219/1‑93 (MQ=255) gTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTATGGTTGTGGCAAAAGTACgc < 1:9452844/93‑1 (MQ=255) tGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACgct < 1:6950174/93‑1 (MQ=255) gATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACgctg < 2:8643142/93‑1 (MQ=255) tGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACgctgct > 2:3563210/1‑93 (MQ=255) tGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACgctgct < 1:2409129/93‑1 (MQ=255) gCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTa < 2:3730289/93‑1 (MQ=255) gATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAAt > 1:3411963/1‑93 (MQ=255) aTTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATa > 1:5600210/1‑93 (MQ=255) ttCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAg > 2:4483510/1‑93 (MQ=255) ttCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAg < 2:6644398/93‑1 (MQ=255) ttCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAg > 2:7728429/1‑93 (MQ=255) tCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGt > 1:9201410/1‑93 (MQ=255) cTTAATAACATCAATTTGTCGCTGCGTGCTAGCGAATTTAGGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGtt < 2:1443364/93‑1 (MQ=255) ttAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTg > 2:837143/1‑93 (MQ=255) ttAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTg < 2:7605243/93‑1 (MQ=255) ttAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTg < 2:3316626/93‑1 (MQ=255) ttAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTg > 2:6483626/1‑93 (MQ=255) taataaCATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGc < 1:4863139/93‑1 (MQ=255) taataaCATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGc > 1:726516/1‑93 (MQ=255) aataaCATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCt > 1:3324865/1‑93 (MQ=255) aataaCATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGCTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCt > 2:8502068/1‑93 (MQ=255) ataaCATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCtt < 1:1494690/93‑1 (MQ=255) taaCATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTc < 1:1649193/93‑1 (MQ=255) aCATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCAt < 1:5706714/93‑1 (MQ=255) aCATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCAt < 2:8309349/93‑1 (MQ=255) aCATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCAt < 1:212986/93‑1 (MQ=255) cATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATGACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCAtt < 2:4960613/93‑1 (MQ=255) aTCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTg < 2:1836452/93‑1 (MQ=255) cAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGAt > 2:7495333/1‑93 (MQ=255) cAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGAt > 1:14388/1‑93 (MQ=255) aaTTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATc < 2:1745213/93‑1 (MQ=255) aTTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCa < 2:6793024/93‑1 (MQ=255) ttttCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGc < 1:5266309/93‑1 (MQ=255) tttCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGcc < 2:8097567/93‑1 (MQ=255) ttCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGccc < 1:8284259/93‑1 (MQ=255) gCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAAc < 2:9843989/93‑1 (MQ=255) gCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAAc < 2:6193233/93‑1 (MQ=255) gCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAAc < 2:2813673/93‑1 (MQ=255) gCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAAc < 2:2187055/93‑1 (MQ=255) gCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAAc > 1:6147713/1‑93 (MQ=255) cTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTCATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAAcc < 2:5507882/93‑1 (MQ=255) cTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAAcc < 2:5913090/93‑1 (MQ=255) gCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAg > 1:4439291/1‑93 (MQ=255) gCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAg < 1:1728822/93‑1 (MQ=255) gTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCg > 1:139243/1‑93 (MQ=255) tGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCgg > 2:8794724/1‑93 (MQ=255) cTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGaa < 1:7951407/93‑1 (MQ=255) cTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGaa < 2:9428509/93‑1 (MQ=255) cTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGaa < 1:2828299/93‑1 (MQ=255) cTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGaa < 1:300975/93‑1 (MQ=255) tGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAAc > 1:5386337/1‑93 (MQ=255) tGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAAc > 1:7732947/1‑93 (MQ=255) tGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAAc > 2:6249863/1‑93 (MQ=255) tGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAAc > 2:4633995/1‑93 (MQ=255) ggCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACg > 1:8068670/1‑93 (MQ=255) ggCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACg < 2:716256/93‑1 (MQ=255) ggCGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACg > 1:5072740/1‑93 (MQ=255) cGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGtt > 2:3378882/1‑93 (MQ=255) cGAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGtt > 1:7875838/1‑93 (MQ=255) gAATTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTa > 1:8492756/1‑93 (MQ=255) aaTTTAAGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGTCCAACCAGCGGAACGTTAc > 1:3068062/1‑93 (MQ=255) aGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTg < 2:4564362/93‑1 (MQ=255) aGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTg < 2:6873212/93‑1 (MQ=255) aGTTAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTg < 1:2472232/93‑1 (MQ=255) gTTAATTACCGGATCTTATGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGATGCTTCATTGATCAGCACAACCCGCGGAACGTTACTGGTTGa > 2:5389030/1‑93 (MQ=255) gtAATTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGaa < 1:1143586/92‑1 (MQ=255) aaTTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAgg > 1:8783518/1‑93 (MQ=255) aTTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGt < 2:5437972/93‑1 (MQ=255) aTTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGt < 1:3702502/93‑1 (MQ=255) aTTACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGt < 1:5772645/93‑1 (MQ=255) ttACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGTg < 1:9689723/93‑1 (MQ=255) tACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGTGa > 2:3232630/1‑93 (MQ=255) tACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGTGa < 2:2293293/93‑1 (MQ=255) tACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGTGa < 1:6618641/93‑1 (MQ=255) tACCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGTGa < 1:7457297/93‑1 (MQ=255) aCCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGTGAg > 1:3563998/1‑93 (MQ=255) aCCGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTAATCAGCCCAACCACCGGAAGGTTACTGTTGGAAGGTGAg > 1:4341618/1‑93 (MQ=255) ccGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGTGAgg < 1:4102147/93‑1 (MQ=255) ccGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGTGAgg < 2:4343230/93‑1 (MQ=255) cGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGTGAGGa < 1:9935440/93‑1 (MQ=255) cGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGTGAGGa < 1:3816332/93‑1 (MQ=255) cGGTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGTGAGGa < 2:2008986/93‑1 (MQ=255) ggTTCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGTTCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGTGAGGAt < 2:1244743/93‑1 (MQ=255) | CAAAACGTAGGATATCTGGCGGGTGATGCGAAGATTCTTAATAACATCAATTTTTCGCTGCGTGCTGGCGAATTTAAGTTAATTACCGGTCCTTCTGGTTGTGGCAAAAGTACGCTGCTAAAAATAGTTGCTTCATTGATCAGCCCAACCAGCGGAACGTTACTGTTTGAAGGTGAGGAT > NC_000913/515173‑515352 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |