| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 528,636 | T→C | intergenic (+282/+233) | b0501 → / ← b0502 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 528,636 | 0 | T | C | 99.8% | 1806.6 / ‑5.4 | 558 | intergenic (+282/+233) | b0501/b0502 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (240/317); total (241/317) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.80e-01 | |||||||||||
Only 100 of 577 total aligned reads displayed.
TCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGTGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCATTAG > NC_000913/528546‑528725 | tCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACgcgt > 2:772979/1‑93 (MQ=255)tCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACgcgt > 2:1631308/1‑93 (MQ=255)tCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACgcgt > 2:5315872/1‑93 (MQ=255)tCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACgcgt < 1:8514914/93‑1 (MQ=255) agagagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGttt > 1:9824005/1‑93 (MQ=255) agagagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGttt > 1:4328818/1‑93 (MQ=255) gagagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTa > 1:937565/1‑93 (MQ=255) agagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTaa < 2:6116465/93‑1 (MQ=255) gagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAt > 2:8612435/1‑93 (MQ=255) gagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAt > 1:8621561/1‑93 (MQ=255) gagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAt < 2:1844436/93‑1 (MQ=255) gagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAt < 1:3422211/93‑1 (MQ=255) gagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAt > 2:4780159/1‑93 (MQ=255) agTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAtg < 1:1313310/93‑1 (MQ=255) gTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTCCGCGTTTAAttg > 2:8732220/1‑91 (MQ=255) tttACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAtgtg > 1:2258599/1‑93 (MQ=255) tttACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAtgtg < 2:3010291/93‑1 (MQ=255) tttACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAtgtg > 2:8848698/1‑93 (MQ=255) ttACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGa < 1:5737455/93‑1 (MQ=255) ttACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGa < 2:4187925/93‑1 (MQ=255) tACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAtgtgcg > 2:2800858/1‑91 (MQ=255) tACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAg < 2:7569421/93‑1 (MQ=255) cATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTc > 1:9964462/1‑93 (MQ=255) gAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTa < 2:7233754/93‑1 (MQ=255) gAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTa < 1:5371940/93‑1 (MQ=255) gAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTa < 1:6911511/93‑1 (MQ=255) gAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTa > 1:7360465/1‑93 (MQ=255) aTTGCACTGGTCTTTGACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATc < 2:9314535/93‑1 (MQ=255) ttGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCt > 2:952506/1‑93 (MQ=255) ttGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCt < 1:2081641/93‑1 (MQ=255) ttGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCt < 2:3568278/93‑1 (MQ=255) aCTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGaaa > 2:2146675/1‑93 (MQ=255) aCTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGaaa > 1:7854573/1‑93 (MQ=255) aCTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGaaa < 2:9790307/93‑1 (MQ=255) cTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGaaaa < 2:4596622/93‑1 (MQ=255) cTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGaaaa > 1:6220350/1‑93 (MQ=255) tGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAaaat > 1:9560544/1‑93 (MQ=255) ggTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAaaata > 2:1542611/1‑93 (MQ=255) tCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGCTTAATGTGAGTCCCTATCTGAaaataaa > 2:8149070/1‑93 (MQ=255) ttttACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAaataaata > 1:5035738/1‑93 (MQ=255) ttttACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAaataaata < 2:6328339/93‑1 (MQ=255) tACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATc > 2:5105909/1‑93 (MQ=255) aCGATATCTTACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATcc < 1:4017528/93‑1 (MQ=255) cGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCt < 2:9011500/93‑1 (MQ=255) cGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCt < 2:747248/93‑1 (MQ=255) cGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCt > 1:3589324/1‑93 (MQ=255) gATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCtt > 2:6908889/1‑93 (MQ=255) gATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCtt < 2:447261/93‑1 (MQ=255) atatCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTc < 1:6727320/93‑1 (MQ=255) tatCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTcc > 1:2646515/1‑93 (MQ=255) tCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCgg < 1:6451115/93‑1 (MQ=255) cTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGa < 1:4149159/93‑1 (MQ=255) gACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGAtt < 2:1411664/93‑1 (MQ=255) aCATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTa > 1:7048035/1‑93 (MQ=255) aTTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTaaa > 1:3466336/1‑93 (MQ=255) aTTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTaaa > 1:2994370/1‑93 (MQ=255) aTTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTaaa < 2:4060049/93‑1 (MQ=255) aTTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTaaa > 1:1575262/1‑93 (MQ=255) tAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAaaataaat < 2:919404/93‑1 (MQ=255) tAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAaaataaat < 1:5266543/93‑1 (MQ=255) aaTACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAAtt < 2:4998268/93‑1 (MQ=255) aTACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTc > 2:9435946/1‑93 (MQ=255) aTACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCAGGATTAAAATAAATTc > 1:1635972/1‑93 (MQ=255) tACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCt < 2:5657791/93‑1 (MQ=255) aCATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCtt < 1:5835/93‑1 (MQ=255) aCATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCtt > 2:314961/1‑93 (MQ=255) cATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTg > 1:1257472/1‑93 (MQ=255) cATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTg < 1:324204/93‑1 (MQ=255) tatTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGcc < 1:2807117/93‑1 (MQ=255) atTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGcag < 1:1083428/93‑3 (MQ=255) atTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCg < 2:9079880/93‑1 (MQ=255) ttCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCgg > 1:8060847/1‑93 (MQ=255) aGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaa < 1:893943/93‑1 (MQ=255) gCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaa > 1:8271941/1‑93 (MQ=255) gCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaa > 2:6617637/1‑93 (MQ=255) cATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaaga < 1:3111440/93‑1 (MQ=255) aTGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaagaa < 1:9083641/93‑1 (MQ=255) tGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaagaaa > 2:7170837/1‑93 (MQ=255) gCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGaaagaaag > 2:2037268/1‑93 (MQ=255) cATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAaagaaaga < 2:1069324/93‑1 (MQ=255) aattaa‑taaAATGTTACTGCTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAagag < 1:9237507/92‑1 (MQ=255) attaattaAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAagag < 1:2465413/93‑1 (MQ=255) ttaattaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAgg < 2:6002436/93‑1 (MQ=255) aattaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGaa > 2:399202/1‑93 (MQ=255) aattaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGaa > 2:8354495/1‑93 (MQ=255) aattaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGaa > 1:5597415/1‑93 (MQ=255) attaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGaaa < 2:237335/93‑1 (MQ=255) ttaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAAt < 1:7170591/93‑1 (MQ=255) taaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATa < 2:380813/93‑1 (MQ=255) taaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATa < 2:7081890/93‑1 (MQ=255) aaaaTGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATaa < 2:5585742/93‑1 (MQ=255) aaaaTGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATaa > 1:4588637/1‑93 (MQ=255) aaaTGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATaaa < 2:1155085/93‑1 (MQ=255) aaaTGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATaaa > 2:6564441/1‑93 (MQ=255) aTGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAAcc < 2:330730/93‑1 (MQ=255) tGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCa < 1:7560234/93‑1 (MQ=255) gTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCAt > 2:1292981/1‑93 (MQ=255) gTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCAt < 2:2600831/93‑1 (MQ=255) ttACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCAtt < 1:3733589/93‑1 (MQ=255) ttACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCAtt < 1:1016406/93‑1 (MQ=255) | TCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGTGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCATTAG > NC_000913/528546‑528725 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |