| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,450,334 | G→A | A64T (GCT→ACT) | ytfT → | putative transport system permease protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,450,334 | 0 | G | A | 98.9% | 943.5 / ‑5.1 | 273 | A64T (GCT→ACT) | ytfT | putative transport system permease protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/3); new base A (135/134); total (135/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.47e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
GTCGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC > NC_000913/4450244‑4450423 | cGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTcc < 2:9180320/93‑1 (MQ=255) gATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTccc > 2:873527/1‑93 (MQ=255) aTAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCg > 1:5499621/1‑93 (MQ=255) aTAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCCTGCAACTCCCg > 2:9644636/1‑93 (MQ=255) tAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGt > 1:8373343/1‑93 (MQ=255) tAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGt > 2:7154158/1‑93 (MQ=255) aGCCTTGTAGCCCCGCATTGCTGGCAGGTGGTGCGTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGtt < 2:8446616/93‑1 (MQ=255) aGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGtt < 2:1211259/93‑1 (MQ=255) aGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGtt > 1:625241/1‑93 (MQ=255) aGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGtt < 1:7319457/93‑1 (MQ=255) gCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTg > 1:461969/1‑93 (MQ=255) cTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTCACCGTGCAACTCCCGTTGCg > 2:5782424/1‑93 (MQ=255) cTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCg < 2:746158/93‑1 (MQ=255) cTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCg > 2:333036/1‑93 (MQ=255) tAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTAc < 1:9180118/93‑1 (MQ=255) tAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTAc < 1:1150668/93‑1 (MQ=255) gCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTg < 2:1126129/93‑1 (MQ=255) ccccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTgg < 2:4120625/93‑1 (MQ=255) cccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGc < 1:9290637/93‑1 (MQ=255) cccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGAAATTCTTAACCGTGCAACTCACGTTGCGTTACTGGc > 2:6125902/1‑93 (MQ=255) ccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCg > 1:3757903/1‑93 (MQ=255) ccGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCg > 1:5271307/1‑93 (MQ=255) cGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGTGATACTGGCGa > 2:7000180/1‑93 (MQ=255) gCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTACCCGTGCACCTCCCGTTGCGTTACTGGCGAt < 2:2354023/93‑1 (MQ=255) gCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGAt > 2:262207/1‑93 (MQ=255) gCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGAt < 2:1235448/93‑1 (MQ=255) cATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGAtt > 2:633269/1‑93 (MQ=255) cATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGAtt < 1:10000467/93‑1 (MQ=255) cATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGAtt > 2:8125226/1‑93 (MQ=255) cATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGAtt > 1:3063161/1‑93 (MQ=255) cATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGAtt > 2:5416671/1‑93 (MQ=255) tttCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTgg > 2:206956/1‑93 (MQ=255) tttCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTgg > 2:606924/1‑93 (MQ=255) tCTGGCAGGTGTTGCTTCAGTATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGGCATTCTTAACCGTGCACCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCa < 2:8630612/93‑1 (MQ=255) tCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCa < 2:6807914/93‑1 (MQ=255) tCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCa < 1:3428939/93‑1 (MQ=255) tCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCa < 1:7833133/93‑1 (MQ=255) tCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCa < 1:7232669/93‑1 (MQ=255) tGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATg > 1:5080740/1‑93 (MQ=255) ggCAGGTGGTGCTGCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGa < 1:4242374/93‑1 (MQ=255) gCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGAc > 1:3514131/1‑93 (MQ=255) gCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGAc < 2:5336655/93‑1 (MQ=255) cAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACg < 1:5403331/93‑1 (MQ=255) aGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGc > 1:7758593/1‑93 (MQ=255) ggtggtGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCt < 1:1407363/93‑1 (MQ=255) ggtggtGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCt > 1:6539593/1‑93 (MQ=255) gtggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTg > 2:10033038/1‑93 (MQ=255) gtggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTg < 2:5486715/93‑1 (MQ=255) ggtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGt < 2:2307970/93‑1 (MQ=255) gtgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTg > 1:2848083/1‑93 (MQ=255) tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGAGGCTGGTGa > 1:8777822/1‑93 (MQ=255) tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGa < 2:5943483/93‑1 (MQ=255) tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGa < 1:8587313/93‑1 (MQ=255) tgCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGa < 1:1604950/93‑1 (MQ=255) gCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAt < 1:7909130/93‑1 (MQ=255) gCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGAt < 1:9865469/93‑1 (MQ=255) aGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCa > 1:9589457/1‑93 (MQ=255) ggATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCAc < 1:4820176/93‑1 (MQ=255) gATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGAGATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCAcc > 2:6223218/1‑93 (MQ=255) aTGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCg < 1:9994093/93‑1 (MQ=255) tGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCgg > 2:8908080/1‑93 (MQ=255) ggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTg < 1:263839/93‑1 (MQ=255) ggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTg > 1:7403253/1‑93 (MQ=255) ggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTg < 1:9723176/93‑1 (MQ=255) ggCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTg > 2:5218581/1‑93 (MQ=255) gCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTgg > 2:3853920/1‑93 (MQ=255) cGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTggg < 1:6811986/93‑1 (MQ=255) tttGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGAt > 2:1471842/1‑93 (MQ=255) tttGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGAt > 2:349554/1‑93 (MQ=255) tGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCAGGTGATCGCCACCGGTGGGATTg > 2:7224852/1‑93 (MQ=255) ttCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAt > 2:9004208/1‑93 (MQ=255) cGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCACCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtct < 2:4433574/93‑1 (MQ=255) ggTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctc < 2:4581425/93‑1 (MQ=255) gTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctct > 2:249673/1‑93 (MQ=255) gTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctct < 1:3901964/93‑1 (MQ=255) tAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGAtctctc < 1:8054142/93‑1 (MQ=255) aGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTcc > 1:5832949/1‑93 (MQ=255) aGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTcc > 1:2737709/1‑93 (MQ=255) gCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCg > 2:2834068/1‑93 (MQ=255) cccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTa < 2:3137773/93‑1 (MQ=255) ccATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAg > 1:2404340/1‑93 (MQ=255) cATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgg > 1:7655976/1‑93 (MQ=255) cATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgg < 1:6031769/93‑1 (MQ=255) cATAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgg > 1:3305437/1‑93 (MQ=255) aTAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAggg < 2:3059596/93‑1 (MQ=255) tAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgggg < 2:3717828/93‑1 (MQ=255) tAGACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCCGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAgggg > 1:8909957/1‑93 (MQ=255) gACATTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCg < 1:2193055/93‑1 (MQ=255) aTTCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTg > 1:2073887/1‑93 (MQ=255) ttCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGa > 2:1177678/1‑93 (MQ=255) ttCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGa > 2:6470146/1‑93 (MQ=255) ttCTTAACCATGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGa > 2:2516827/1‑93 (MQ=255) tCTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGAt < 2:7827791/93‑1 (MQ=255) cTTAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATg < 1:2954/93‑1 (MQ=255) ttAACCGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATgg > 2:7993757/1‑93 (MQ=255) ccGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCGCCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTAt < 2:4917020/93‑1 (MQ=255) cGTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATc < 1:100559/93‑1 (MQ=255) gTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGCTGGCTATCg > 1:8681449/1‑93 (MQ=255) gTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCg > 1:5709057/1‑93 (MQ=255) gTGCAACTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCg > 1:5990440/1‑93 (MQ=255) | GTCGATAGCCTGGTAGCCCCGCATTTCTGGCAGGTGGTGCTTCAGGATGGGCGTTTGTTCGGTAGCCCCATAGACATTCTTAACCGTGCAGCTCCCGTTGCGTTACTGGCGATTGGCATGACGCTGGTGATCGCCACCGGTGGGATTGATCTCTCCGTAGGGGCGGTGATGGCTATCGCC > NC_000913/4450244‑4450423 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |