| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 629,933 | T→C | W273R (TGG→CGG) | cstA → | carbon starvation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 629,933 | 0 | T | C | 99.5% | 606.7 / ‑4.8 | 198 | W273R (TGG→CGG) | cstA | carbon starvation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (75/122); total (75/123) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
CCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGC > NC_000913/629843‑630022 | cGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGt < 2:9780104/93‑1 (MQ=255) cGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGt < 2:3335605/93‑1 (MQ=255) gccTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTa < 1:2709042/92‑1 (MQ=255) aCCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTa < 2:9951172/93‑1 (MQ=255) ccTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTAc < 1:1946216/93‑1 (MQ=255) ccTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTAc < 2:843420/93‑1 (MQ=255) ccTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGCGGTTAc > 1:4432022/1‑93 (MQ=255) cTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTAct > 1:1820981/1‑93 (MQ=255) cTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTAct < 2:8524463/93‑1 (MQ=255) cTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGGTAct > 2:2845144/1‑93 (MQ=255) gggCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTActgc < 1:9470976/93‑1 (MQ=255) gggCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTActgc > 2:4642268/1‑93 (MQ=255) gggCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTActgc > 2:7034111/1‑93 (MQ=255) gggCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTActgc > 2:795164/1‑93 (MQ=255) ggCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTActgct < 1:3352488/93‑1 (MQ=255) ggCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGCGGTTActgct > 1:9924510/1‑93 (MQ=255) cACCGTACTTTGACTTTACCGGCATGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTgg < 2:5527326/93‑1 (MQ=255) aCCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGAGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGc > 1:9672872/1‑93 (MQ=255) cGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGccc < 2:3988621/93‑1 (MQ=255) tACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCcg > 2:1153008/1‑93 (MQ=255) tACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGTGCGGTTACTGCCGGGCCcg > 2:6241887/1‑93 (MQ=255) tACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATACTAGTGGGTTACGATTTTGAGGCGGCGGTGCTGCCAGTGCGGTTACTGCTGGcacca < 2:8942711/93‑2 (MQ=255) tcTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCcgc < 2:7215483/92‑1 (MQ=255) aCTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCcgc < 1:5694709/93‑1 (MQ=255) tGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGa < 1:4557797/93‑1 (MQ=255) gACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGAc < 2:2686648/93‑1 (MQ=255) gACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGAc < 2:8907652/93‑1 (MQ=255) aCTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGTGCGGTTACTGGTGGTCCCGCGTGACt > 1:392985/1‑93 (MQ=255) aCTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGTGCGGGTACTGCTGGCCCCGCGTGACt > 1:136937/1‑93 (MQ=255) cTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTa < 1:2967589/93‑1 (MQ=255) ttACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTAcc < 2:2271211/93‑1 (MQ=255) aCCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGGGACTTCctc > 2:5943046/1‑93 (MQ=255) aCCGACGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACctc > 2:6016747/1‑93 (MQ=255) cGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACctctc < 1:7322922/93‑1 (MQ=255) ggCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACctctct < 2:8733449/93‑1 (MQ=255) gCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACctctctc > 2:3026880/1‑92 (MQ=255) cGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTAc < 2:3698047/93‑1 (MQ=255) gTGCAGTTGGCCTGGATGCTGGTGGGTTCCGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTAcc < 2:3099408/93‑1 (MQ=255) gTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTAcc > 1:804464/1‑93 (MQ=255) gTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTAcc > 2:8166488/1‑93 (MQ=255) tGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGACCGCCGTGAGTACCTCTCTACCt > 1:3508347/1‑93 (MQ=255) tGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTGACTGCTGGCCCCGCATCACTACCTGTCTatgt > 2:5319543/1‑90 (MQ=255) tGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGGTACTGCTGGGCCCGCGTGACTACCTCTCTACCt > 2:252615/1‑93 (MQ=255) tGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGGGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCt > 2:4178124/1‑93 (MQ=255) aGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTcc < 2:5835703/93‑1 (MQ=255) gTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGGCCCGCGCGACTACCTCTCTCCCTTCCt > 1:912351/1‑93 (MQ=255) gTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCt < 2:5138196/93‑1 (MQ=255) ttGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTg > 1:5366803/1‑93 (MQ=255) ttGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTg > 2:7855026/1‑93 (MQ=255) aCCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGaaa > 2:7107206/1‑93 (MQ=255) aCCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGGTACTGCTGGCCCCGCGGGACTACCGCTCTAGCTTCCTGaaa > 2:6318888/1‑93 (MQ=255) ccTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGaaaa > 1:5433073/1‑93 (MQ=255) tGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATc < 1:9622336/93‑1 (MQ=255) tGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATc > 1:646333/1‑93 (MQ=255) cggATGCTCGTGGGTTACGGTGTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATc < 2:6586896/92‑1 (MQ=255) ggATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCg > 1:126888/1‑93 (MQ=255) aTGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCggg < 1:6100732/93‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTATACCTTCCTGAAAATCGGGa > 2:3588731/1‑93 (MQ=255) gCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGAc < 1:4154893/93‑1 (MQ=255) gCTGGTAGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGAc < 1:5927861/93‑1 (MQ=255) tggtggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTa < 2:8049504/93‑1 (MQ=255) ggtggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAt > 1:7720751/1‑93 (MQ=255) gtggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtc > 1:4540992/1‑93 (MQ=255) gtggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGAGCTGCCGGTGCGGTTACTGCCGGCCCCGGGTGGCTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtc > 2:8397178/1‑93 (MQ=255) tggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcg < 1:8951627/93‑1 (MQ=255) tggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcg > 1:5071074/1‑93 (MQ=255) tggGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCCGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcg > 2:9452764/1‑93 (MQ=255) tggTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcgt < 1:1875532/92‑1 (MQ=255) gggTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcgt < 1:3103003/93‑1 (MQ=255) gggTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcgt < 2:9520294/93‑1 (MQ=255) gggTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcgt < 1:6749384/93‑1 (MQ=255) ggTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcgtc < 1:8162497/93‑1 (MQ=255) ggTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTAtcgtc < 2:3455741/93‑1 (MQ=255) ttACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCgg < 2:5680627/93‑1 (MQ=255) tACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGt > 1:6230424/1‑93 (MQ=255) cGGTTTTGTGGCGTCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCt < 2:2514596/93‑1 (MQ=255) cGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCt < 2:6515511/93‑1 (MQ=255) ggTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGCCGGGCTg > 2:64194/1‑93 (MQ=255) ttttGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGc > 2:6891884/1‑93 (MQ=255) tttGTGGCGGCGGTGCTGCCGGGGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATAGGGACTATCGTCGGTCTGGCg > 1:2377793/1‑93 (MQ=255) gtgGCGGCGGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGtg > 1:2786100/1‑92 (MQ=255) gcggcgGTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGc < 1:6892822/93‑1 (MQ=255) gggcggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCa < 2:4480945/92‑1 (MQ=255) cggcggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCa < 2:1446579/93‑1 (MQ=255) gcggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAtt < 2:6176377/93‑1 (MQ=255) cggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAttt < 1:9405044/93‑1 (MQ=255) ggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAtttt < 1:658628/93‑1 (MQ=255) ggTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCAtttt > 1:873116/1‑93 (MQ=255) gTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTg > 1:7406151/1‑93 (MQ=255) gTGCTGCCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGAATTTTg > 2:1577697/1‑93 (MQ=255) tgtcGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTa < 2:4975870/90‑1 (MQ=255) tgcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTa < 2:5396066/93‑1 (MQ=255) tgcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGGAGGCATTTTGATTa > 1:3818487/1‑93 (MQ=255) gcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTAt > 1:1942432/1‑93 (MQ=255) gcCGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTAt < 2:7242375/93‑1 (MQ=255) ccGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATg < 1:213260/93‑1 (MQ=255) ccGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATg < 1:3210044/93‑1 (MQ=255) cGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATgc < 2:864323/93‑1 (MQ=255) cGGTGCGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATgc < 1:102661/93‑1 (MQ=255) gtgcGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATgcgc > 1:4325362/1‑93 (MQ=255) | CCGACCTGGGCACCGTACTTTGACTTTACCGGCGTGCAGTTGACCTGGATGCTGGTGGGTTACGGTTTTGTGGCGGCGGTGCTGCCGGTGTGGTTACTGCTGGCCCCGCGTGACTACCTCTCTACCTTCCTGAAAATCGGGACTATCGTCGGTCTGGCGGTAGGCATTTTGATTATGCGC > NC_000913/629843‑630022 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |