Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,033,730 | C→T | I418I (ATC→ATT) | hyaB → | hydrogenase‑1 large subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,033,730 | 0 | C | T | 99.5% | 755.8 / ‑6.0 | 209 | I418I (ATC→ATT) | hyaB | hydrogenase‑1 large subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (107/101); total (107/102) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.88e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
GCTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATCGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAAC > NC_000913/1033640‑1033819 | gcTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGTCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGc > 2:5531018/1‑93 (MQ=255) cTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCt < 1:2727215/93‑1 (MQ=255) tgaatgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCtt > 1:1542349/1‑93 (MQ=255) tgaatgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCtt < 1:5634085/93‑1 (MQ=255) gaatgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTa > 2:962212/1‑93 (MQ=255) gaatgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTa > 1:4887784/1‑93 (MQ=255) aatgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTAt > 2:1992203/1‑93 (MQ=255) tgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATca < 2:9670481/93‑1 (MQ=255) tgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATca < 2:3838811/93‑1 (MQ=255) tgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATca > 2:1305670/1‑93 (MQ=255) tgaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATca < 2:6519844/93‑1 (MQ=255) gaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATcac > 1:3262194/1‑93 (MQ=255) gaaCAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATcac > 2:10031534/1‑93 (MQ=255) aCAGGAGCGCTACTCGTGGATCAAAGGGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACaa > 1:2383453/1‑93 (MQ=255) cAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACaaa > 2:7259192/1‑93 (MQ=255) cAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACaaa < 1:7700831/93‑1 (MQ=255) aGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAg < 2:3256915/93‑1 (MQ=255) ggAACGCTACTCGTGGATCAAATCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGCCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAgg < 2:1297487/93‑1 (MQ=255) ggAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAgg > 1:6048517/1‑93 (MQ=255) gAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGc < 1:4682229/93‑1 (MQ=255) aCGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGa > 1:9850348/1‑93 (MQ=255) cGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAt < 1:5341504/93‑1 (MQ=255) cTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAtgc < 2:7427204/93‑1 (MQ=255) tACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAtgct < 1:7603558/93‑1 (MQ=255) aCTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAtgctg > 1:1794489/1‑93 (MQ=255) cTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAtgctgc < 2:3672358/93‑1 (MQ=255) cTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGAtgctgc < 2:4650167/93‑1 (MQ=255) tCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCg > 1:3869654/1‑93 (MQ=255) cGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGa < 1:7386600/93‑1 (MQ=255) cGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGa > 2:5432679/1‑93 (MQ=255) cGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGa > 1:1236911/1‑93 (MQ=255) gTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGAc < 2:1687881/93‑1 (MQ=255) ggATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCg > 1:6843969/1‑93 (MQ=255) ggATCAAAGCGCCACGATGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCg < 1:8987469/93‑1 (MQ=255) gATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGt < 2:2988754/93‑1 (MQ=255) aTCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGtt > 2:9772359/1‑93 (MQ=255) cAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGa < 2:8995828/93‑1 (MQ=255) cAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGa < 2:6131400/93‑1 (MQ=255) aaaGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAg > 2:3134694/1‑93 (MQ=255) aaGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAgt < 1:5281010/93‑1 (MQ=255) aaGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAgt < 1:8263481/93‑1 (MQ=255) aaGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAgt > 2:8306970/1‑93 (MQ=255) aGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAgtc < 1:6705181/93‑1 (MQ=255) gcCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAgtcggt > 2:8504335/1‑93 (MQ=255) ccACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAgtcggtc < 2:3893895/93‑1 (MQ=255) cACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAgtcggtcg < 1:4260490/93‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGCCGGTCGa > 1:4037146/1‑93 (MQ=255) aCGCGGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGa < 2:7925517/93‑1 (MQ=255) cGCTGGCGCGGTAACGCGCTTGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGCTCATTGCTTAGCACAAAGCCGATGCGCTGACCGTTGAttcggccggc > 1:9936854/1‑91 (MQ=255) cGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGAt < 1:2858726/93‑1 (MQ=255) gCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATc < 1:7905175/93‑1 (MQ=255) cTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCg > 2:8670108/1‑93 (MQ=255) tGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGc < 1:8739185/93‑1 (MQ=255) tGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGc > 2:4782392/1‑93 (MQ=255) ggCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCa < 2:356276/93‑1 (MQ=255) ggCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCa > 1:745128/1‑93 (MQ=255) ggCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCa > 1:4394016/1‑93 (MQ=255) ggCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCa > 1:5236664/1‑93 (MQ=255) gcgGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCatga < 2:9030650/93‑1 (MQ=255) cgGTAACGCGATGGAAGGGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCatgat > 2:8449732/1‑93 (MQ=255) ggTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCatgatg > 2:5915841/1‑93 (MQ=255) ggTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCatgatg > 1:8564145/1‑93 (MQ=255) gTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGt < 1:8018174/93‑1 (MQ=255) aCGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCgg < 1:3556848/93‑1 (MQ=255) gATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGtt < 2:1590913/93‑1 (MQ=255) aTGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGAGCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTg > 1:6213511/1‑93 (MQ=255) gAAGTGGCGCCGCTGGGGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAAc < 2:170191/93‑1 (MQ=255) aaGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAAcc < 2:4229571/93‑1 (MQ=255) gTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTg > 2:6347173/1‑93 (MQ=255) tGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGc < 1:5542728/93‑1 (MQ=255) tGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGc < 1:6436856/93‑1 (MQ=255) tGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGc < 2:4338579/93‑1 (MQ=255) ggggCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGcc > 1:10024152/1‑93 (MQ=255) ggggCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGcc < 2:4078481/93‑1 (MQ=255) gggCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCg > 1:8381586/1‑93 (MQ=255) ggCCGCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGc < 2:2750290/93‑1 (MQ=255) gCTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTc > 1:1657505/1‑93 (MQ=255) cTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTcc > 1:5884296/1‑93 (MQ=255) cTGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTcc > 1:1765797/1‑93 (MQ=255) tGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCg > 1:3393744/1‑93 (MQ=255) tGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCg > 1:2905783/1‑93 (MQ=255) tGGCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCg > 2:7651928/1‑93 (MQ=255) ggCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCgg < 2:4619990/93‑1 (MQ=255) ggCGCGCACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCgg > 2:2176954/1‑93 (MQ=255) cgcACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATc < 1:1088315/93‑1 (MQ=255) cgcACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATc > 1:205720/1‑93 (MQ=255) cgcACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGCTGAGTCGGTCGACCGGATGATGCCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATc > 1:9098012/1‑93 (MQ=255) gcACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATcc > 1:3923808/1‑93 (MQ=255) gcACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATcc > 2:5107310/1‑93 (MQ=255) gcACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGCCGGCGATGAACCTGCCCCTTTCCGGtctct > 1:8591223/1‑92 (MQ=255) ccACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCTGTATcc < 2:2468238/92‑1 (MQ=255) cACGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCa > 2:877801/1‑93 (MQ=255) cGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGt < 1:37364/93‑1 (MQ=255) cGTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGt > 1:9401517/1‑93 (MQ=255) gTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTc < 1:3893319/93‑1 (MQ=255) gTTAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTc > 2:5698500/1‑93 (MQ=255) ttAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCa > 1:4962790/1‑93 (MQ=255) ttAATTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCa > 2:9152895/1‑93 (MQ=255) aaTTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAAc > 2:753945/1‑93 (MQ=255) aaTTGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAAc < 2:6915353/93‑1 (MQ=255) | GCTGAATGAACAGGAACGCTACTCGTGGATCAAAGCGCCACGCTGGCGCGGTAACGCGATGGAAGTGGGGCCGCTGGCGCGCACGTTAATCGCTTATCACAAAGGCGATGCTGCGACCGTTGAGTCGGTCGATCGCATGATGTCGGCGTTGAACCTGCCGCTTTCCGGTATCCAGTCAAC > NC_000913/1033640‑1033819 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |