Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,237,781 | A→G | T330A (ACG→GCG) | dadA → | D‑amino acid dehydrogenase subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,237,781 | 0 | A | G | 99.2% | 780.3 / ‑2.9 | 247 | T330A (ACG→GCG) | dadA | D‑amino acid dehydrogenase subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/2); new base G (112/133); total (112/135) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.02e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.56e-01 |
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
GCCATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAACGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTCTGCGCCCGATGACGCCA > NC_000913/1237691‑1237870 | gCCATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCg > 2:7946786/1‑93 (MQ=255) cATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCt > 1:9198859/1‑93 (MQ=255) cATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCt < 1:9170511/93‑1 (MQ=255) cATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCt < 2:1925306/93‑1 (MQ=255) cATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCt < 2:2538830/93‑1 (MQ=255) cATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCt < 1:1581504/93‑1 (MQ=255) aTTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTg > 1:2175283/1‑93 (MQ=255) aTTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTg > 2:2153200/1‑93 (MQ=255) aTTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTg > 1:3880395/1‑93 (MQ=255) ttACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGCGCTGTTGCAACCGCGTCGCGAAGCCCTgg > 1:3279527/1‑93 (MQ=255) ttACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTgg > 1:428254/1‑93 (MQ=255) tACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGga < 1:7872984/93‑1 (MQ=255) cccGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGgaga < 2:9734413/93‑1 (MQ=255) ccGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGAt < 1:510884/93‑1 (MQ=255) ccGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGAt < 1:7638684/93‑1 (MQ=255) cGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGAtg < 1:8997700/93‑1 (MQ=255) tttCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGAtggt > 2:1810882/1‑93 (MQ=255) tttCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGAtggt > 1:2416506/1‑93 (MQ=255) tttCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGAtggt < 1:8026935/93‑1 (MQ=255) ttCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGAtggtg < 1:2630098/93‑1 (MQ=255) tCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTCCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGAtggtag < 2:5701289/93‑3 (MQ=255) gATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGtt > 2:6403646/1‑93 (MQ=255) aTAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGttg > 1:4888725/1‑92 (MQ=255) aTAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTc > 2:3718141/1‑93 (MQ=255) aTAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTc > 2:357094/1‑93 (MQ=255) aaCCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTcgc < 1:1412113/93‑1 (MQ=255) ccGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGa < 2:8420492/93‑1 (MQ=255) cGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGAt < 2:3271108/93‑1 (MQ=255) gCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGagc > 2:506983/1‑91 (MQ=255) gCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGAtc < 2:9165451/93‑1 (MQ=255) gCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGAtc > 1:8459128/1‑93 (MQ=255) cATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGAtct > 1:3709778/1‑93 (MQ=255) aTTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGAtctc > 1:6625214/1‑93 (MQ=255) aTTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGAtctc < 1:9554127/93‑1 (MQ=255) ttCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATctct > 1:7266726/1‑93 (MQ=255) cGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTAt < 2:3348277/93‑1 (MQ=255) gtgtTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATc < 2:5861926/93‑1 (MQ=255) tgtTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATcc < 2:5765188/93‑1 (MQ=255) gtTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCTAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCa < 2:716190/93‑1 (MQ=255) ggCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTGTGAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCAcgc < 1:9615277/93‑1 (MQ=255) cGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACgcgg < 2:428254/93‑1 (MQ=255) ggAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACgcggc < 2:2938859/93‑1 (MQ=255) ggAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACgcggc < 2:4871855/93‑1 (MQ=255) ggAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACgcggc < 1:4504900/93‑1 (MQ=255) gAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACgcggcg < 2:8322434/93‑1 (MQ=255) aTGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGt > 1:4658022/1‑93 (MQ=255) aTGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGt > 2:231998/1‑93 (MQ=255) ggCGTAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCa < 1:708282/93‑1 (MQ=255) ggCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCa > 1:5491737/1‑93 (MQ=255) ggCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCa < 2:2444530/93‑1 (MQ=255) gCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCAt < 1:3482075/93‑1 (MQ=255) gCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCAt > 1:557051/1‑93 (MQ=255) gCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCAt < 1:7802540/93‑1 (MQ=255) gCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCAt > 1:5771286/1‑93 (MQ=255) gagaTTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTc < 2:9566807/93‑1 (MQ=255) gagaTTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTc > 2:2652541/1‑93 (MQ=255) agaTTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCg < 1:5960071/93‑1 (MQ=255) gaTTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGa < 1:8207302/93‑1 (MQ=255) gaTTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGa > 2:6818353/1‑93 (MQ=255) gaTTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGa > 2:6033720/1‑93 (MQ=255) gaTTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGa > 1:6579070/1‑93 (MQ=255) tgttgGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCa < 2:416920/93‑1 (MQ=255) gttgGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAg < 1:6513242/93‑1 (MQ=255) tgGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGc < 1:9710352/93‑1 (MQ=255) ttttAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGAc > 1:8688418/1‑93 (MQ=255) tttAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACt < 2:2815456/93‑1 (MQ=255) tttAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGCCGGCATTGTCGAGCAGGCGACt > 1:7293611/1‑93 (MQ=255) tAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACttt > 1:2961666/1‑93 (MQ=255) aaTACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTc < 2:3445611/93‑1 (MQ=255) aTACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCt > 1:6761883/1‑93 (MQ=255) aTACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCt < 2:9065972/93‑1 (MQ=255) tACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTg > 2:7346532/1‑93 (MQ=255) aCCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTgg > 2:4239950/1‑93 (MQ=255) ccGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGa < 2:7857931/93‑1 (MQ=255) ccGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGa > 1:9922866/1‑93 (MQ=255) ccGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTATATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGa > 1:1309911/1‑93 (MQ=255) cGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGAc < 2:3861648/93‑1 (MQ=255) cGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGAc < 1:8069115/93‑1 (MQ=255) cGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGAc < 1:10045763/93‑1 (MQ=255) aGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTg < 1:708427/93‑1 (MQ=255) gCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTgg < 1:3096032/93‑1 (MQ=255) cTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCTAGCAGGCGACTTTCTGGCCTGGt > 2:5537638/1‑93 (MQ=255) cTGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGt > 2:9010233/1‑93 (MQ=255) tGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTc > 2:5424836/1‑93 (MQ=255) tGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTc > 1:1834734/1‑93 (MQ=255) tGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTc < 1:6214789/93‑1 (MQ=255) tGTTGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTc < 2:3391104/93‑1 (MQ=255) ttGCAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTCTg > 2:7342643/1‑93 (MQ=255) tctcAACCGCGTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTCTg > 2:1562371/4‑93 (MQ=255) cacccGCGTCGTGCAGCGCTGGAGCTGGTGGTTCGCGATCTCTATCCCCGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGCCTTTCTGGCCTGGTCTgcgc < 2:9263711/90‑1 (MQ=255) cgcgTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGTGACTTTCTGGACTGGTCTGCGCCCGa < 1:1121045/93‑1 (MQ=255) gcgTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTCTGCGCCCGAt > 2:4185974/1‑93 (MQ=255) gcgTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTCTGCGCCCGAt < 2:961801/93‑1 (MQ=255) gcgTCGTGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTCTGCGCCCGAt > 1:9112801/1‑93 (MQ=255) gcgTCGTGAAGCGCTGGAGATGGAGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTCTGCGCCCGAt > 2:2341055/1‑93 (MQ=255) gtcgtGAAACGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTCTGCGCCCGATGa < 2:6964988/93‑1 (MQ=255) cgtGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTCTGCGCCCGATGACg < 2:8565110/93‑1 (MQ=255) gtGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTCTGCGCCCGATGACGc > 2:1362709/1‑93 (MQ=255) gtGAAGAGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGCCTTTCTGGACTGGTCTGCCCCCGATGAAGc > 2:1113459/1‑93 (MQ=255) tGAAGCGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTCTGCGCCCGATGACGcc > 2:1697034/1‑93 (MQ=255) | GCCATTACCCGTTTCGATAACCGCATTCGTGTTGGCGGAATGGCGGAGATTGTTGGTTTTAATACCGAGCTGTTGCAACCGCGTCGTGAAACGCTGGAGATGGTGGTTCGCGATCTCTATCCACGCGGCGGTCATGTCGAGCAGGCGACTTTCTGGACTGGTCTGCGCCCGATGACGCCA > NC_000913/1237691‑1237870 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |