| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,369,184 | T→C | C315C (TGT→TGC) | ycjM → | putative polysaccharide hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,369,184 | 0 | T | C | 98.3% | 903.1 / 2.7 | 288 | C315C (TGT→TGC) | ycjM | putative polysaccharide hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/1); new base C (146/137); total (150/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.31e-02 | |||||||||||
Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
AGGCGATGACGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGTGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCGGGCTAAACCCGC > NC_000913/1369094‑1369272 | aGGCGATGACGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTgcgc > 1:5576688/1‑93 (MQ=255)aGGCGATGACGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTgcgc > 1:5265336/1‑93 (MQ=255)aGGCGATGACGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTgcgc > 2:9159259/1‑93 (MQ=255)aGGCGATGACGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTgcgc > 1:21909/1‑93 (MQ=255) ggCGATGACGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGcgcg < 2:8080304/93‑1 (MQ=255) ggCGATGACGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGcgcg < 1:10011251/93‑1 (MQ=255) gATGACGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTgg > 2:4609230/1‑93 (MQ=255) gATGACGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTgg > 2:5285918/1‑93 (MQ=255) gATGACGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTgg > 1:3824232/1‑93 (MQ=255) aTGACGAAGCACATCTGGTGGACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTggg < 1:5123211/93‑1 (MQ=255) aTGACGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTTCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTggg > 2:7090816/1‑93 (MQ=255) aTGACGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTggg < 1:6784360/93‑1 (MQ=255) gACGAAGCACATATGGTGTACCCGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGAGCTTTGACCGTGGgca > 1:9860279/1‑92 (MQ=255) aCGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGgcgc > 1:7442404/1‑93 (MQ=255) aCGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGgcgc > 1:5749921/1‑93 (MQ=255) cGAAACACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTCCCGCCACTGGTGCTGAATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGTCGCTTTGCGAGTGGGCGCa < 2:5426232/93‑1 (MQ=255) aaGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAACAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCaaa > 1:8289641/1‑93 (MQ=255) aGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCaaaa < 1:9585327/93‑1 (MQ=255) acaTATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCt < 2:1288401/93‑1 (MQ=255) caTATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTg < 1:425557/93‑1 (MQ=255) caTATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTg < 1:9176044/93‑1 (MQ=255) atatGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGa < 1:6592472/93‑1 (MQ=255) tatGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAATAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGAGGGCGCAAAACCTGac > 2:4944071/1‑93 (MQ=255) tatGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGac > 2:2595734/1‑93 (MQ=255) tatGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGac > 1:2568906/1‑93 (MQ=255) tatGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGac > 1:6312467/1‑93 (MQ=255) tGGTGTACCAGTTTTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACTTGacac > 2:8976517/1‑93 (MQ=255) ggTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGTGCGTGGGCGCAAAACCTGACACt < 2:6959935/93‑1 (MQ=255) gtACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTAcc > 2:8011390/1‑93 (MQ=255) gtACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTAcc < 2:6398185/93‑1 (MQ=255) gtACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGCGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACAGTAca > 1:4740153/1‑92 (MQ=255) tACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCt < 1:2054199/93‑1 (MQ=255) ccAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTc < 2:4299893/93‑1 (MQ=255) cAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTcc > 1:5996136/1‑93 (MQ=255) cAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTcc < 2:8609451/93‑1 (MQ=255) gTTCTCGCTGACGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAg > 2:6547536/1‑93 (MQ=255) ttCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGc > 2:7917972/1‑93 (MQ=255) ttCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGc > 1:9632722/1‑93 (MQ=255) ttCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGc > 2:8421651/1‑93 (MQ=255) ttCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGc > 2:5565165/1‑93 (MQ=255) ctcGCTGCCGCCGCTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCaa < 2:3571682/93‑1 (MQ=255) tcGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCCac > 1:713056/1‑93 (MQ=255) tcGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAac > 1:4161904/1‑93 (MQ=255) cGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAaca < 1:618630/93‑1 (MQ=255) cGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAaca < 2:7808809/93‑1 (MQ=255) cTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAAcacc > 1:1707945/1‑93 (MQ=255) cTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAAcacc > 2:5243967/1‑93 (MQ=255) gccgccACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAAcaccac > 2:7452227/1‑93 (MQ=255) ccgccACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACaccacc < 1:7907875/93‑1 (MQ=255) ccgccACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACaccacc < 2:3486544/93‑1 (MQ=255) ccgccACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACaccacc > 2:248632/1‑93 (MQ=255) cACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGt > 2:3834960/1‑93 (MQ=255) aCTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGtt > 1:8804236/1‑93 (MQ=255) ggTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTaa > 1:8970776/1‑93 (MQ=255) ggTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTaa < 1:6879766/93‑1 (MQ=255) tgcATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTcc < 1:9217504/93‑1 (MQ=255) tgcATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTcc < 1:9434694/93‑1 (MQ=255) tgcATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTcc > 2:3027666/1‑93 (MQ=255) gcATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCt > 2:9652475/1‑93 (MQ=255) gcATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCt < 2:6000407/93‑1 (MQ=255) gcATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCt < 1:1209931/93‑1 (MQ=255) gcATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCt > 1:779105/1‑93 (MQ=255) gaTGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTc < 1:8194710/92‑1 (MQ=255) cATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGTGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTc > 1:5669680/1‑93 (MQ=255) cATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTc > 2:1628524/1‑93 (MQ=255) tGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGc < 2:4780669/93‑1 (MQ=255) gCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGcc > 1:281514/1‑93 (MQ=255) gCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGcc < 2:3378006/93‑1 (MQ=255) gCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGcc > 2:4918233/1‑93 (MQ=255) cGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCct < 2:6177042/93‑1 (MQ=255) ggTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCctc < 2:3316791/93‑1 (MQ=255) ggTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCctc < 1:7300567/93‑1 (MQ=255) gTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCctct < 2:1869000/93‑1 (MQ=255) gCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCa < 2:7206626/93‑1 (MQ=255) aaaaCAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGa > 1:6455311/1‑93 (MQ=255) aaaCAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGAt > 1:7695873/1‑93 (MQ=255) aaaCAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGAt > 1:6154269/1‑93 (MQ=255) aaaCAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGAt < 2:2208063/93‑1 (MQ=255) aaCAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATg < 2:8297030/93‑1 (MQ=255) aaCAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATg > 1:4653351/1‑93 (MQ=255) aaCAGAACGTGGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATg < 2:4039281/93‑1 (MQ=255) aCAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATgg < 1:4447907/93‑1 (MQ=255) aCAGAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATgg > 1:5435562/1‑93 (MQ=255) gAACGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCAt < 1:1326143/93‑1 (MQ=255) aaCGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATc < 2:8820695/93‑1 (MQ=255) aaCGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATc < 2:1541993/93‑1 (MQ=255) aaCGTTGAGGCGCTTTGCGCGGGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATc < 1:8743848/93‑1 (MQ=255) cGTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCgg < 1:8474823/93‑1 (MQ=255) gTTGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCggg > 1:3630601/1‑93 (MQ=255) ttGAGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCGGGc < 1:904481/93‑1 (MQ=255) ggtcgcTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCGGGCTaa < 1:3943357/90‑1 (MQ=255) aGGCGCTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCGGGCTaa < 2:9047691/93‑1 (MQ=255) ggggcTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCGGGCTaaa < 2:2448654/90‑1 (MQ=255) cgcTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCGGGCTAAAcc > 1:2891671/1‑93 (MQ=255) cgcTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCGGGCTAAAcc < 1:2387425/93‑1 (MQ=255) cgcTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCGGGCTAAAcc < 2:9829354/93‑1 (MQ=255) gcTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCGGGCTAAAccc < 1:798321/93‑1 (MQ=255) ccTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCGGGCTAAAccc < 2:9261026/92‑1 (MQ=255) cTTTGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCGGGCTAAACCCg > 1:3529215/1‑93 (MQ=255) tttGCGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCGGGCTAAACCCGc < 2:440836/93‑1 (MQ=255) | AGGCGATGACGAAGCACATATGGTGTACCAGTTCTCGCTGCCGCCACTGGTGCTGCATGCGGTGCAAAAACAGAACGTTGAGGCGCTTTGTGCGTGGGCGCAAAACCTGACACTACCTTCCAGCAACACCACCTGGTTTAACTTCCTCGCCTCTCACGATGGCATCGGGCTAAACCCGC > NC_000913/1369094‑1369272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |