| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,433,368 | T→C | E92E (GAA→GAG) | ynaF ← | putative filament protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,433,368 | 0 | T | C | 99.7% | 933.0 / ‑4.9 | 291 | E92E (GAA→GAG) | ynaF | putative filament protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (163/127); total (164/127) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.37e-01 | |||||||||||
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
AGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTC > NC_000913/1433278‑1433457 | aGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTc < 1:10043574/93‑1 (MQ=255) gtggtgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTcc > 2:9537238/1‑93 (MQ=255) ggtgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCctcctc < 2:7084188/93‑1 (MQ=255) ggtgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCctcctc < 1:6380420/93‑1 (MQ=255) gtgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTGCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCa > 1:4260335/1‑93 (MQ=255) tgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCaa > 2:7495495/1‑93 (MQ=255) tgATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCaa > 2:4767363/1‑93 (MQ=255) atatCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCTAGCCCTCCTCAACa < 2:525301/93‑1 (MQ=255) atatCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACa < 1:5101823/93‑1 (MQ=255) atCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATg > 1:7907747/1‑93 (MQ=255) atCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATg > 1:9139106/1‑93 (MQ=255) tCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATgg > 1:9801338/1‑93 (MQ=255) tCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATgg > 2:7780328/1‑93 (MQ=255) ggTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACa > 2:2485958/1‑93 (MQ=255) ggTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACa < 2:4323355/93‑1 (MQ=255) ggTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACa < 2:5884448/93‑1 (MQ=255) ggTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACa < 1:6764661/93‑1 (MQ=255) ggTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACa < 2:8658638/93‑1 (MQ=255) gTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACAt < 2:2208804/93‑1 (MQ=255) gATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCa > 1:4893283/1‑93 (MQ=255) aTGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCAc > 2:2891582/1‑93 (MQ=255) gggAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCActc < 2:5474571/93‑1 (MQ=255) gggAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCActc < 2:4091614/93‑1 (MQ=255) ggAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCATCATGGACATGCActct < 2:8962384/93‑1 (MQ=255) aaGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGt < 1:7053481/93‑1 (MQ=255) aaGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGt < 2:2285546/93‑1 (MQ=255) aaGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGt < 2:2708707/93‑1 (MQ=255) gCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCg < 1:3186581/93‑1 (MQ=255) aaTGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCANNATGGACATGCACTCTGTCNGt > 1:1220526/1‑93 (MQ=255) atgatgATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGtt < 2:3253841/93‑1 (MQ=255) atgatgATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGtt > 2:5039334/1‑93 (MQ=255) atgatgATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGtt < 2:6115401/93‑1 (MQ=255) gatgatCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTgg > 1:6076055/1‑93 (MQ=255) gatgatCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTgg > 2:5999153/1‑93 (MQ=255) gatgatCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTgg > 2:8371942/1‑93 (MQ=255) tgatCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCa < 1:4283274/93‑1 (MQ=255) tgatCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCa < 2:6972158/93‑1 (MQ=255) tgatCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCa < 2:798787/93‑1 (MQ=255) tgatCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCa < 1:8526863/93‑1 (MQ=255) gatCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAg > 1:8965308/1‑93 (MQ=255) gatCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAg > 1:8391544/1‑93 (MQ=255) tCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGtt > 1:986319/1‑93 (MQ=255) tCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGtt > 1:2245944/1‑93 (MQ=255) cATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGttt > 1:3539768/1‑93 (MQ=255) cATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGttt > 2:3713647/1‑93 (MQ=255) cATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGttt < 1:621133/93‑1 (MQ=255) atatGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTa > 2:7670807/1‑93 (MQ=255) tatGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGGGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTaa < 2:3805281/93‑1 (MQ=255) tatGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTaa > 2:6794222/1‑93 (MQ=255) tatGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTaa < 2:8542782/93‑1 (MQ=255) atGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTaaa < 1:871914/93‑1 (MQ=255) tGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAAt > 1:3380137/1‑93 (MQ=255) cGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAAttttt > 2:2001483/1‑93 (MQ=255) ggggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTTTCGGTTGGCAGTTTAAAtttttt > 2:5561650/1‑93 (MQ=255) ggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTaa < 2:1460494/93‑1 (MQ=255) ggATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTaa < 1:1305828/93‑1 (MQ=255) gATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCTCTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAAt < 1:2542979/93‑1 (MQ=255) gATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAAt < 2:8146192/93‑1 (MQ=255) aTCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATg > 1:2370415/1‑93 (MQ=255) aTCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATg < 2:6352484/93‑1 (MQ=255) aTCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATg > 2:5103106/1‑93 (MQ=255) tcttctTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGa > 1:5219521/1‑93 (MQ=255) cttcttCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAt > 1:6623995/1‑93 (MQ=255) cttcttCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTCAAATTTTTTAATGAt > 1:49596/1‑93 (MQ=255) ttcttcGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtc < 1:3761933/93‑1 (MQ=255) tcttcGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtct > 1:7964054/1‑93 (MQ=255) tcttcGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGAtct > 1:7492063/1‑93 (MQ=255) tcttcGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATCAtct > 1:9585101/1‑93 (MQ=255) cGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTc < 1:2783794/93‑1 (MQ=255) cGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTc > 1:7615810/1‑93 (MQ=255) ccAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCa > 1:1739356/1‑93 (MQ=255) cAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAg > 2:8789004/1‑93 (MQ=255) cAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAg > 1:48372/1‑93 (MQ=255) aaTTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCATTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGt < 1:5389515/93‑1 (MQ=255) aaTTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGt > 1:3994613/1‑93 (MQ=255) tCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGc < 1:603104/93‑1 (MQ=255) ccAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCg > 2:1775023/1‑93 (MQ=255) aGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGAt > 2:330259/1‑93 (MQ=255) gAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGAtt > 1:2631741/1‑93 (MQ=255) aaTGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGAttt < 2:458425/93‑1 (MQ=255) aaTGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGAttt < 2:1268429/93‑1 (MQ=255) aTGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTg > 2:538314/1‑93 (MQ=255) aTGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTg < 1:1836204/93‑1 (MQ=255) tGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTgg > 1:3246531/1‑93 (MQ=255) tGCGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTgg < 1:9353415/93‑1 (MQ=255) cGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCt > 1:8091841/1‑93 (MQ=255) cGGTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCt < 1:8855729/93‑1 (MQ=255) ggTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCtt > 1:1421957/1‑93 (MQ=255) ggTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCtt > 2:663328/1‑93 (MQ=255) ggTCTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCtt > 1:4359716/1‑93 (MQ=255) cTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCg < 1:5577603/93‑1 (MQ=255) cTTTGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCg > 2:1606105/1‑93 (MQ=255) tttGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGc > 1:2009835/1‑93 (MQ=255) tttGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGc < 2:4522241/93‑1 (MQ=255) tGGGCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCtt > 2:3921322/1‑93 (MQ=255) ggCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTc < 2:1069187/93‑1 (MQ=255) gCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCa < 2:9861404/93‑1 (MQ=255) gCGAGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCa < 1:7100308/93‑1 (MQ=255) aGCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGt < 2:9406892/93‑1 (MQ=255) gCCCTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTc > 2:4631492/1‑93 (MQ=255) | AGTGGTGATATCCGGTCGATGGGAAGCAATGATGATCATATGAGCGGGGATCTTCTTCGCCAATTCCAGAATGCGGTCTTTGGGCGAGCCTTCCTCAACATGGACATGCACTCTGTCGGTTGGCAGTTTAAATTTTTTAATGATCTCTTCCAGTTGCGATTTGGCTTCCGCTTTCAGGTC > NC_000913/1433278‑1433457 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |