BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	1,479,655	T→C	C241C (TGT→TGC)	ynbD →	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	1,479,655	0	T	C	100.0%	586.9 / NA	180	C241C (TGT→TGC)	ynbD	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (94/86); total (94/86)

Only 100 of 185 total aligned reads displayed.

AGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACC  >  NC_000913/1479565‑1479744

aGCACTTCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTg                                                                                         <  1:2323123/93‑1 (MQ=255)

    cTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGCTATGCTGGCCa                                                                                     >  2:9270259/1‑93 (MQ=255)

     tGCCCTATGTCGTAGGCGCGTGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATAATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCCGGCCAg                                                                                    >  2:3553631/1‑93 (MQ=255)

     tGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAg                                                                                    >  2:6885417/1‑93 (MQ=255)

      gCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGt                                                                                   >  1:5971806/1‑93 (MQ=255)

       cccTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGta                                                                                  <  1:2668597/93‑1 (MQ=255)

        ccTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtat                                                                                 >  1:6229348/1‑93 (MQ=255)

          tATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatta                                                                               <  1:367412/93‑1 (MQ=255)

           aTGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtattat                                                                              <  2:6599809/93‑1 (MQ=255)

           aTGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtattat                                                                              <  1:9145541/93‑1 (MQ=255)

            tGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATc                                                                             >  2:4140089/1‑93 (MQ=255)

            tGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATc                                                                             <  2:4189969/93‑1 (MQ=255)

              tCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGc                                                                           <  2:4406841/93‑1 (MQ=255)

                gTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTa                                                                         >  1:1672557/1‑93 (MQ=255)

                gTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTa                                                                         >  2:1857034/1‑93 (MQ=255)

                 tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc                                                                        <  1:5882191/93‑1 (MQ=255)

                 tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc                                                                        >  2:6036291/1‑93 (MQ=255)

                 tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc                                                                        <  1:4820049/93‑1 (MQ=255)

                 tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc                                                                        >  2:7375809/1‑93 (MQ=255)

                  tggCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACt                                                                       <  1:2838711/92‑1 (MQ=255)

                  aGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACt                                                                       >  2:580795/1‑93 (MQ=255)

                   ggCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTc                                                                      >  1:5514077/1‑93 (MQ=255)

                    gcgcGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCa                                                                     >  2:110870/1‑93 (MQ=255)

                     cgcgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCAt                                                                    <  1:5424630/93‑1 (MQ=255)

                      gcgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATa                                                                   >  1:5225343/1‑93 (MQ=255)

                        gggCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAAt                                                                 <  1:8855938/93‑1 (MQ=255)

                         ggCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAAtt                                                                >  1:3754443/1‑93 (MQ=255)

                           cTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTgg                                                              >  2:3940445/1‑93 (MQ=255)

                             cGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGcc                                                            >  1:4997037/1‑93 (MQ=255)

                              gTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCg                                                           <  1:10016523/93‑1 (MQ=255)

                               tGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGt                                                          >  1:9407915/1‑93 (MQ=255)

                                gCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTg                                                         <  1:6400582/93‑1 (MQ=255)

                                gCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTg                                                         >  2:1163767/1‑93 (MQ=255)

                                  aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg                                                       <  1:6604487/93‑1 (MQ=255)

                                  aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg                                                       <  1:306988/93‑1 (MQ=255)

                                  aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg                                                       >  2:7720916/1‑93 (MQ=255)

                                   ttGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGt                                                      >  2:1211200/1‑93 (MQ=255)

                                    tGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTa                                                     <  1:7969379/93‑1 (MQ=255)

                                    tGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTa                                                     >  1:8422498/1‑93 (MQ=255)

                                    tGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTa                                                     >  2:2629889/1‑93 (MQ=255)

                                     gTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAc                                                    <  1:3195613/93‑1 (MQ=255)

                                       aTTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACgg                                                  >  2:9356472/1‑93 (MQ=255)

                                        ttGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGt                                                 >  2:6980307/1‑93 (MQ=255)

                                        ttGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGt                                                 <  2:8607563/93‑1 (MQ=255)

                                        ttGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGCCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACggg                                                 >  2:2789058/1‑92 (MQ=255)

                                          gATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTgg                                               <  2:366406/93‑1 (MQ=255)

                                          gATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTgg                                               >  2:9574110/1‑93 (MQ=255)

                                            tGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGc                                             >  1:1539188/1‑93 (MQ=255)

                                              gAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCtt                                           >  2:8895529/1‑93 (MQ=255)

                                              gAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCtt                                           <  1:8787552/93‑1 (MQ=255)

                                              gAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGAGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGACGTGGGTACGGTGGGCtt                                           >  1:839941/1‑93 (MQ=255)

                                               aGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTg                                          <  1:9188272/93‑1 (MQ=255)

                                               aGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTg                                          <  2:5495135/93‑1 (MQ=255)

                                                gCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTgg                                         <  1:6782774/93‑1 (MQ=255)

                                                   aaTGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgcgc                                      >  2:2419755/1‑93 (MQ=255)

                                                     tgatgatgaTTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGa                                    <  1:7132528/93‑1 (MQ=255)

                                                      tatgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGAt                                   <  1:1060979/92‑1 (MQ=255)

                                                      gatgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGAt                                   <  1:380222/93‑1 (MQ=255)

                                                      gatgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGAt                                   >  2:6100466/1‑93 (MQ=255)

                                                       atgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATa                                  >  1:7602905/1‑93 (MQ=255)

                                                        tgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaa                                 >  2:1058972/1‑93 (MQ=255)

                                                        tgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaa                                 >  1:9437399/1‑93 (MQ=255)

                                                        tgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaa                                 <  2:7991267/93‑1 (MQ=255)

                                                        tgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaa                                 <  1:4472862/93‑1 (MQ=255)

                                                          atgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaaca                               <  1:9738123/93‑1 (MQ=255)

                                                           tgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaacaa                              >  2:9881483/1‑93 (MQ=255)

                                                             atTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTCCTCATAATTGGCAGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAacaaca                            <  2:6369816/93‑1 (MQ=255)

                                                             atTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAacaaca                            <  1:2043799/93‑1 (MQ=255)

                                                              ttCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAg                           >  2:2649617/1‑93 (MQ=255)

                                                               tCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAgg                          <  2:8393373/93‑1 (MQ=255)

                                                                cAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAggg                         <  1:8632912/93‑1 (MQ=255)

                                                                 aGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGa                        >  2:1636320/1‑93 (MQ=255)

                                                                 aGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGa                        <  1:5520029/93‑1 (MQ=255)

                                                                   ttATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGaga                      >  1:7052675/1‑91 (MQ=255)

                                                                   ttATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGaaa                      >  1:9379059/1‑93 (MQ=255)

                                                                   ttATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGaaa                      >  2:7679424/1‑93 (MQ=255)

                                                                     aTGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGa                    >  1:6316653/1‑93 (MQ=255)

                                                                     aTGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGa                    <  1:2180800/93‑1 (MQ=255)

                                                                          ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAgga               >  1:6245122/1‑91 (MQ=255)

                                                                          ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc               <  2:7526937/93‑1 (MQ=255)

                                                                          ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAAATGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc               <  2:8238459/93‑1 (MQ=255)

                                                                          ggtCAGTCTGGTTATGCAGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCATGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc               <  2:6859656/93‑1 (MQ=255)

                                                                           gtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTGCGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCa              <  1:6125880/93‑1 (MQ=255)

                                                                           gtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCa              >  1:769899/1‑93 (MQ=255)

                                                                            tCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAg             <  2:4888553/93‑1 (MQ=255)

                                                                             cAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgg            <  1:1196904/93‑1 (MQ=255)

                                                                               gTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgggg          >  1:9252453/1‑93 (MQ=255)

                                                                               gTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgggg          <  2:3102649/93‑1 (MQ=255)

                                                                               gTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgggg          >  2:7163595/1‑93 (MQ=255)

                                                                                tCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGTGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGa         <  2:9674703/93‑1 (MQ=255)

                                                                                 cTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaa        >  2:8984032/1‑93 (MQ=255)

                                                                                 cTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaa        >  1:1982075/1‑93 (MQ=255)

                                                                                 cTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaa        <  1:4248044/93‑1 (MQ=255)

                                                                                  tGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaaa       >  1:736105/1‑93 (MQ=255)

                                                                                  tGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaaa       >  2:448693/1‑93 (MQ=255)

                                                                                  tGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaaa       >  1:8971775/1‑93 (MQ=255)

                                                                                    gTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACt     >  2:8207533/1‑93 (MQ=255)

                                                                                       aTGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAcc  <  2:7721986/93‑1 (MQ=255)

                                                                                       aTGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAcc  <  1:4663682/93‑1 (MQ=255)

                                                                                       aTGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAcc  >  2:3420638/1‑93 (MQ=255)

AGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACC  >  NC_000913/1479565‑1479744

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 23 ≤` `ATCG/ATCG` `< 30 ≤` `ATCG/ATCG` `< 34 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`