| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,568,848 | C→T | A408T (GCC→ACC) | gadB ← | glutamate decarboxylase isozyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,568,848 | 0 | C | T | 99.1% | 268.8 / ‑5.2 | 110 | A408T (GCC→ACC) | gadB | glutamate decarboxylase isozyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (45/64); total (45/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.24e-01 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
ATAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGCCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGAAGCAA > NC_000913/1568799‑1568936 | aTAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCa < 2:6003636/93‑1 (MQ=14)aTAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCa > 1:9626662/1‑93 (MQ=14)aTAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCa > 1:8429621/1‑93 (MQ=14)aTAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGAAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCa > 1:9863297/1‑93 (MQ=9)aTAATGCGCACCACCACGATGGCGTGGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCa < 2:7394228/93‑1 (MQ=11) tAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCAt < 1:9457174/93‑1 (MQ=17) aaTGGGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATa < 2:6890469/93‑1 (MQ=16) aaTGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATa > 1:3965633/1‑93 (MQ=18) tGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACa < 1:4871538/93‑1 (MQ=18) tGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACa < 1:6157719/93‑1 (MQ=18) tGCGCATCACCACAATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGACCCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACa < 2:8659245/93‑1 (MQ=255) gcgcATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAg < 2:6606356/93‑1 (MQ=21) gcgcATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAg < 1:8365309/93‑1 (MQ=21) cgcATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAgg < 1:9630565/93‑1 (MQ=18) cgcATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAgg < 2:2544513/93‑1 (MQ=21) cgcATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAgg < 2:6001358/93‑1 (MQ=21) gcATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAggg < 2:8534412/93‑1 (MQ=21) gcATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAggg < 1:291125/93‑1 (MQ=21) gcATCACCACGATGTCGGTGCCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAggg < 2:4409471/93‑1 (MQ=255) gcATCACCACGATGGCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAggg < 2:8193144/93‑1 (MQ=255) cATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGgt < 1:6275541/93‑1 (MQ=21) cATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGgt < 1:5789677/93‑1 (MQ=21) cATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGgt > 1:5421852/1‑93 (MQ=18) aTCCCCCCGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGgtg < 2:156085/93‑1 (MQ=255) aTCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGgtg > 1:2394635/1‑93 (MQ=18) tCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGgtgt > 2:9023740/1‑93 (MQ=18) tCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGACTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGgtgt < 1:8061962/93‑1 (MQ=16) caccacGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTa < 1:578798/93‑1 (MQ=21) caccacGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTa < 2:9401058/93‑1 (MQ=21) caccacGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTa > 1:3847026/1‑93 (MQ=18) caccacGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTa < 1:4510115/93‑1 (MQ=21) ccacGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATc > 1:7507568/1‑93 (MQ=18) cacGATGTGGTTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATcc < 2:1182239/93‑1 (MQ=255) cacGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATcc < 1:4712746/93‑1 (MQ=21) acGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCATAGAGGTCATACAGGGGGTATccc > 2:5588292/1‑93 (MQ=255) acGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATccc < 2:1749430/93‑1 (MQ=18) acGATGTCGGGGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATccc < 2:8426651/93‑1 (MQ=255) cGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCg < 2:5289683/93‑1 (MQ=21) cGATGTAGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGCCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGAGTGTCACCCg < 2:8983791/93‑1 (MQ=11) cGATGGCGGTGGCGTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCg < 1:3118788/93‑1 (MQ=255) gATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCgg > 1:1525224/1‑93 (MQ=18) gATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCgg > 1:7806587/1‑93 (MQ=18) gATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCgg > 2:1239607/1‑93 (MQ=18) aTGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGa < 2:9344159/93‑1 (MQ=21) aTGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGa > 2:3657000/1‑93 (MQ=18) tGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGAt < 1:4247710/93‑1 (MQ=21) tGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGAt < 2:3588584/93‑1 (MQ=21) ttCGGTGGCTTCCCCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATc < 1:3752991/92‑1 (MQ=255) gTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATc < 2:1694473/93‑1 (MQ=21) gTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATc > 2:236317/1‑93 (MQ=18) gTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATc > 2:2220156/1‑93 (MQ=18) tCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCt < 1:9420771/93‑1 (MQ=21) tCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCt > 2:8257035/1‑93 (MQ=18) cGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCtt < 1:6961561/93‑1 (MQ=21) ggTGGCTTCACCTCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTc > 1:2770933/1‑93 (MQ=16) ggTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTc < 1:136480/93‑1 (MQ=21) ggTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTc < 1:9194922/93‑1 (MQ=21) ggTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTc > 2:8142635/1‑93 (MQ=18) ggTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTc > 2:4214570/1‑93 (MQ=18) ggTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAACGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTc > 1:1965518/1‑93 (MQ=16) ggTGCCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGTACCCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTc < 1:9194917/93‑1 (MQ=11) gttgCTTCCCCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCa < 1:2628875/90‑1 (MQ=255) gTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGACCCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCa < 1:9065464/93‑1 (MQ=16) gTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCa < 1:5268667/93‑1 (MQ=21) gTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCa > 2:2103630/1‑93 (MQ=18) gggCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCAc < 1:564023/92‑1 (MQ=21) ggCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCAcc > 2:7968966/1‑93 (MQ=18) gCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCa < 2:924083/93‑1 (MQ=21) gCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCa > 1:8176530/1‑93 (MQ=18) cTTCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCAt < 2:8399306/93‑1 (MQ=18) ttCCCCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATc < 2:1918758/93‑1 (MQ=255) ttCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGCGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATc > 1:647518/1‑93 (MQ=16) tCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCt > 1:8902431/1‑93 (MQ=18) tCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCt > 2:3443970/1‑93 (MQ=18) tCACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCt < 2:1436494/93‑1 (MQ=18) cACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCtt > 1:1582628/1‑93 (MQ=18) cACCGCCGAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCtt < 1:3361486/93‑1 (MQ=21) ccgccgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTc > 2:9388815/1‑93 (MQ=18) ccgccgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATACCGGATCTTCACCATCTTTc > 2:3714677/1‑93 (MQ=16) cgccgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCa > 1:3895399/1‑93 (MQ=18) gccgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAg > 2:6405153/1‑93 (MQ=18) ccgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGt < 2:9666887/93‑1 (MQ=18) ccgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGt > 2:2058332/1‑93 (MQ=18) ccgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGt < 1:6366060/93‑1 (MQ=18) cgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCATACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGtt > 1:6886165/1‑93 (MQ=16) cgAGAGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGtt < 1:6205740/93‑1 (MQ=18) gagaGTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGttt > 1:7970611/1‑93 (MQ=18) agagTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTg > 1:353452/1‑93 (MQ=18) agTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGaa < 1:1739714/93‑1 (MQ=18) agTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGaa > 1:4096009/1‑93 (MQ=18) agTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGaa < 2:9047545/93‑1 (MQ=18) agTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGaa < 1:974904/93‑1 (MQ=21) agTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGaa < 2:2293900/93‑1 (MQ=21) agTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGaa < 2:3259450/93‑1 (MQ=18) agTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCAGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGaa < 1:4181750/93‑1 (MQ=255) gTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGAAg < 2:1504628/93‑1 (MQ=18) gTGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGAAg < 2:5104118/93‑1 (MQ=18) tGAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGAAGc > 2:9322114/1‑93 (MQ=18) gAAGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGAAGCa > 1:1981433/1‑93 (MQ=18) aaGGTCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGAAGCaa < 2:81453/93‑1 (MQ=21) | ATAATGCGCATCACCACGATGTCGGTGGCTTCACCGCCGAGAGTGAAGGCCGGAACCTGCCAGCCGCGCAGACGCAGACGTTCAGAGAGGTCATACAGGGTGTATCCCGGATCTTCACCATCTTTCAGTTTGAAGCAA > NC_000913/1568799‑1568936 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |