| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,712,211 | A→G | V473V (GTA→GTG) | ydgR → | putative transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,712,211 | 0 | A | G | 99.6% | 719.4 / ‑5.1 | 220 | V473V (GTA→GTG) | ydgR | putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (136/83); total (136/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.82e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
GCCGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTACTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAATTCA > NC_000913/1712121‑1712301 | gCCGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCt > 2:2762217/1‑93 (MQ=255) ccGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTg > 1:4575646/1‑93 (MQ=255) cGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGa < 1:6224645/93‑1 (MQ=255) cGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGa < 2:4026431/93‑1 (MQ=255) ggATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGAt < 1:847308/93‑1 (MQ=255) aTAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGAtgc > 1:6491651/1‑93 (MQ=255) aaCGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGAtgctg > 1:2272084/1‑93 (MQ=255) gTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGctgctg > 2:8147248/1‑93 (MQ=255) gTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGctgctg > 2:5684477/1‑93 (MQ=255) ttACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGa > 2:5563972/1‑93 (MQ=255) ttACCGATCCGCTGATGTCACTAGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGa > 1:1489451/1‑93 (MQ=255) tACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGAc > 1:4028792/1‑93 (MQ=255) tACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGAc > 2:1455270/1‑93 (MQ=255) tACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGAc < 2:9161647/93‑1 (MQ=255) cGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACcgc > 1:6623383/1‑93 (MQ=255) cGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACcgc > 2:4761172/1‑93 (MQ=255) gATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACcgcg > 2:9522077/1‑93 (MQ=255) gATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACcgcg > 1:2765407/1‑93 (MQ=255) tCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGcc < 2:1271762/93‑1 (MQ=255) ccGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCg > 2:9255797/1‑93 (MQ=255) gCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGaa > 2:8357604/1‑93 (MQ=255) tGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGc < 1:3774937/93‑1 (MQ=255) gTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCa > 2:6237718/1‑93 (MQ=255) tCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCAc > 1:2502696/1‑93 (MQ=255) tCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCAc < 1:1282464/93‑1 (MQ=255) tCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCAc > 2:3432262/1‑93 (MQ=255) tCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCAc > 1:8153501/1‑93 (MQ=255) taCTGGAAGGCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATNGGAGTCGCTACTGCCGTTATTGCANTGCTGATGCNGCTGACCGCGCCGAAACTGCAcc < 2:8707174/92‑1 (MQ=255) aCTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCg > 2:4591903/1‑93 (MQ=255) aCTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCg > 2:5124106/1‑93 (MQ=255) cTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATCCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGc > 2:2491386/1‑93 (MQ=255) tGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCa < 1:688081/93‑1 (MQ=255) aaGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGa > 1:1028459/1‑93 (MQ=255) aaGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGa > 2:6676716/1‑93 (MQ=255) aaGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGa < 1:3010089/93‑1 (MQ=255) aGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGAc > 2:7744224/1‑93 (MQ=255) aGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGAc > 1:2574516/1‑93 (MQ=255) gTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACg > 1:3467587/1‑93 (MQ=255) tCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGc > 1:3383748/1‑93 (MQ=255) tCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGc < 1:7294820/93‑1 (MQ=255) cTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCa < 2:2718110/93‑1 (MQ=255) tATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAg < 1:6260901/93‑1 (MQ=255) tATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAg > 1:4376309/1‑93 (MQ=255) tATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGATGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAg < 2:4520579/93‑1 (MQ=255) tGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGa < 2:7638844/93‑1 (MQ=255) tGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGa > 1:9502835/1‑93 (MQ=255) tGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGa < 1:2203244/93‑1 (MQ=255) ggTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGAt < 1:5975851/93‑1 (MQ=255) tCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGTTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAAGTGCACCGCATGACGCGGGATGa > 1:2891769/1‑93 (MQ=255) tCGCATATGCTTACAGATAGGTGGCTCTACTGCGGTTATTGCAGTGCTGAAGCGGCTGACCGTGTCGAAACGGCACCGCATGACGCAGCATGa < 2:5798759/93‑1 (MQ=255) cgcgTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGAc > 1:8107100/1‑93 (MQ=255) gcgTATTCGTGCAGATTGGTGTCGCTGCTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGCCCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACg < 1:3605183/93‑1 (MQ=255) cgTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGc > 1:7753619/1‑93 (MQ=255) cgTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGc > 2:4030931/1‑93 (MQ=255) cgTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGc < 2:1036362/93‑1 (MQ=255) tATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTg > 2:9665893/1‑93 (MQ=255) aTTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGc > 2:5342881/1‑93 (MQ=255) aTTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGc > 2:3939091/1‑93 (MQ=255) aTTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGc < 2:3099372/93‑1 (MQ=255) ttCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCa < 1:7259743/93‑1 (MQ=255) ttCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCa > 2:3296269/1‑93 (MQ=255) ttCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACAGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCa > 2:289135/1‑93 (MQ=255) ttGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGAc < 1:5516940/93‑1 (MQ=255) tGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACa < 1:9283389/93‑1 (MQ=255) cAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACaaa > 1:1944590/1‑93 (MQ=255) aGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAg < 2:10047476/93‑1 (MQ=255) aGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAg > 2:7884682/1‑93 (MQ=255) gATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAgc > 2:305955/1‑93 (MQ=255) gATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAgc < 2:2084687/93‑1 (MQ=255) gATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAgc < 2:9586196/93‑1 (MQ=255) gATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAgc < 1:9952309/93‑1 (MQ=255) ttGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAgcgg > 1:1249008/1‑93 (MQ=255) ggTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAgcggcg > 1:5077925/1‑93 (MQ=255) ggTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAgcggcg > 1:667876/1‑93 (MQ=255) gtgtCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGa > 2:7092937/1‑93 (MQ=255) gtCGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGaaa < 1:4205536/93‑1 (MQ=255) cGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACTGCATGACGCAGGCTGCAGCTGAAGACAACGCGGCGAAagc > 1:6279685/1‑93 (MQ=255) cGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAagc < 1:9791929/93‑1 (MQ=255) cGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAagc < 1:5944795/93‑1 (MQ=255) cGCTACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAagc < 2:1582723/93‑1 (MQ=255) tACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAagcagc > 1:6600238/1‑93 (MQ=255) tACTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAagcagc < 2:2369431/93‑1 (MQ=255) aCTGCCGTTATTGCAGTACTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGcc < 2:2465710/93‑1 (MQ=255) cTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCg > 1:3363637/1‑93 (MQ=255) cTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCg > 2:1368174/1‑93 (MQ=255) cTGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCg < 2:3740479/93‑1 (MQ=255) tGCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGt > 1:2921040/1‑93 (MQ=255) gCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTa > 1:2103610/1‑93 (MQ=255) gCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTa > 2:1676399/1‑93 (MQ=255) gCCGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCAAAAGCAGCCGTa < 1:8575173/93‑1 (MQ=255) cGTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGc < 1:6939694/93‑1 (MQ=255) gTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCg > 1:5658427/1‑93 (MQ=255) gTTATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCg > 2:7732327/1‑93 (MQ=255) tATTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTa > 1:8345702/1‑93 (MQ=255) aTTGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTaa > 1:10012192/1‑93 (MQ=255) ttGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTaaa > 2:6877320/1‑93 (MQ=255) ttGCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTaaa > 1:1676931/1‑93 (MQ=255) gCAGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAAt < 1:4842165/93‑1 (MQ=255) aGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGTAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAATTc < 1:7131143/93‑1 (MQ=255) aGTGCTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAATTc > 1:6232128/1‑93 (MQ=255) | GCCGGATAACGTTACCGATCCGCTGATGTCACTGGAAGTCTATGGTCGCGTATTCTTGCAGATTGGTGTCGCTACTGCCGTTATTGCAGTACTGATGCTGCTGACCGCGCCGAAACTGCACCGCATGACGCAGGATGACGCTGCAGACAAAGCGGCGAAAGCAGCCGTAGCGTAAAATTCA > NC_000913/1712121‑1712301 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |