Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,066,300 | T→C | intergenic (‑957/‑330) | trs56 ← / → b1995 | IS5 transposase/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,066,300 | 0 | T | C | 99.7% | 1196.0 / ‑7.2 | 362 | intergenic (‑957/‑330) | trs56/b1995 | IS5 transposase/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (129/232); total (130/232) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.59e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 365 total aligned reads displayed.
TCTGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGTCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGAC > NC_000913/2066210‑2066389 | tctGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCt < 2:3131719/93‑1 (MQ=255) ctGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCtt > 2:1179147/1‑93 (MQ=255) ggCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTAc < 1:727689/93‑1 (MQ=255) ggCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTAc > 1:4927378/1‑93 (MQ=255) ggCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTAc < 1:1853158/93‑1 (MQ=255) ggCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTAc < 1:3872205/93‑1 (MQ=255) gCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTAcc > 2:9116384/1‑93 (MQ=255) gCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTAcc > 2:2879220/1‑93 (MQ=255) cATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGc < 2:3595042/93‑1 (MQ=255) aTTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCa < 2:4146446/93‑1 (MQ=255) ttAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCat > 1:7017533/1‑93 (MQ=255) agagTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCatat < 2:4904237/93‑1 (MQ=255) gagTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCAtata < 2:6868432/93‑1 (MQ=255) gagTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCAtata < 1:8799796/93‑1 (MQ=255) gagTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCAtata > 1:4957310/1‑93 (MQ=255) gagTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCAtata > 1:9350151/1‑93 (MQ=255) tAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGGTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACgg > 1:5505003/1‑93 (MQ=255) aaCCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGt < 2:9896432/93‑1 (MQ=255) aCCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTc > 2:2702409/1‑93 (MQ=255) ccTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGGCCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCa < 1:8306247/93‑1 (MQ=255) ttCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAAt > 2:5285241/1‑93 (MQ=255) ttCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAAt > 2:6388823/1‑93 (MQ=255) tCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAAtt < 2:7190306/93‑1 (MQ=255) tCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAAtt > 1:6106227/1‑93 (MQ=255) tCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAAtt < 1:7646194/93‑1 (MQ=255) tGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTc > 2:9595934/1‑93 (MQ=255) tGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTc < 2:6501391/93‑1 (MQ=255) gCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCa < 2:2267625/93‑1 (MQ=255) cATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAg > 2:9534411/1‑93 (MQ=255) aTTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGc > 1:6637233/1‑93 (MQ=255) aTTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGc > 1:1699123/1‑93 (MQ=255) aTTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGc < 1:4526260/93‑1 (MQ=255) ttCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCa > 1:1113697/1‑93 (MQ=255) ttCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCa < 1:4344212/93‑1 (MQ=255) cATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCaat < 2:2514756/93‑1 (MQ=255) cATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCaat < 2:4389601/93‑1 (MQ=255) aTCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCaatt < 1:5654222/93‑1 (MQ=255) tCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCaatta < 2:7780910/93‑1 (MQ=255) ttttGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCaattaatt < 2:467987/93‑1 (MQ=255) ttttGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCaattaatt > 2:3372528/1‑93 (MQ=255) tttGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAattaatta < 1:148139/93‑1 (MQ=255) tttGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAattaatta > 2:2962522/1‑93 (MQ=255) tGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACa < 2:511971/93‑1 (MQ=255) tGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACa > 2:1680002/1‑93 (MQ=255) tGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACa < 1:7358966/93‑1 (MQ=255) gTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACAt < 2:34798/93‑1 (MQ=255) tAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACAtt < 1:3425549/93‑1 (MQ=255) aaaaaGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTa > 2:9413341/1‑93 (MQ=255) aaaaGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTAt < 2:3949738/93‑1 (MQ=255) aGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCa < 2:9474902/93‑1 (MQ=255) aGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCa < 1:7994057/93‑1 (MQ=255) gTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCAc < 1:6323135/93‑1 (MQ=255) ttATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGc > 2:2150879/1‑93 (MQ=255) ttATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGc < 1:3721619/93‑1 (MQ=255) ttATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGc < 2:6246860/93‑1 (MQ=255) ttATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGc < 2:7844222/93‑1 (MQ=255) ttATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGc < 2:811781/93‑1 (MQ=255) tataTTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGcc > 2:5781843/1‑93 (MQ=255) tatTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCaa > 2:7827737/1‑93 (MQ=255) tatTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCaa < 2:8500388/93‑1 (MQ=255) tatTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCaa > 2:4088367/1‑93 (MQ=255) atTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCaaa > 2:6609573/1‑93 (MQ=255) ttAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAg < 1:2526548/93‑1 (MQ=255) aGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTa < 1:8081989/93‑1 (MQ=255) aGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTa < 1:3323320/93‑1 (MQ=255) gTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTAt < 1:8247045/93‑1 (MQ=255) gTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTAt < 1:10008955/93‑1 (MQ=255) tATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTAtt < 2:3286912/93‑1 (MQ=255) tATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTAtt < 2:7861608/93‑1 (MQ=255) tATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTAtt < 2:2385661/93‑1 (MQ=255) tATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTAtt < 1:2288927/93‑1 (MQ=255) aTCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTAttt < 1:5902013/93‑1 (MQ=255) tCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTg < 2:9018630/93‑1 (MQ=255) cAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGt < 1:8598514/93‑1 (MQ=255) aGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGtc > 2:10027673/1‑93 (MQ=255) gCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGtca < 1:2680792/93‑1 (MQ=255) aaTTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGtcatc < 2:3853262/93‑1 (MQ=255) aTTAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGtcatca < 2:5557351/93‑1 (MQ=255) ttAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATcac < 1:6200803/93‑1 (MQ=255) tAACCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATcaca < 2:4005097/93‑1 (MQ=255) aaCCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACaa < 2:364510/93‑1 (MQ=255) aaCCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACaa < 2:6145404/93‑1 (MQ=255) aCCGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAat < 2:8539677/93‑1 (MQ=255) ccGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAatg < 1:6814480/93‑1 (MQ=255) ccGGACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAatg > 1:7425908/1‑93 (MQ=255) cGGACCTGATACTGATATGATCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAatga < 1:1551237/93‑1 (MQ=255) ggACCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAatgat < 2:5036534/93‑1 (MQ=255) aCCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATgg > 2:7883289/1‑93 (MQ=255) aCCTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATgg < 1:5210535/93‑1 (MQ=255) ccTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGt < 1:8999780/93‑1 (MQ=255) ccTGATACTGATATGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGt < 1:8480426/93‑1 (MQ=255) tgatactgataTGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTAc < 2:6771413/93‑1 (MQ=255) gatactgataTGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTAcc < 2:7581641/93‑1 (MQ=255) gatactgataTGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTAcc < 1:3192660/93‑1 (MQ=255) atactgataTGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACct > 1:9623626/1‑93 (MQ=255) actgataTGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACcttc < 2:1938668/93‑1 (MQ=255) tgataTGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACcttctt < 2:7423754/93‑1 (MQ=255) gataTGAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCttt < 1:4078867/93‑1 (MQ=255) gAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGac < 2:1086282/93‑1 (MQ=255) gAGCCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGac < 1:2011534/93‑1 (MQ=255) | TCTGGCCATTAGAGTAACCTTCTGCATTCATCCTTTTGTAAAAAGTTTATATTAGTATCAGCAATTAACCGGACCTGATACTGATATGAGTCTTACCGCATATACGGTCAATTTCAGCAATTAATTACATTATCCACGCCAAAGTATTTGTCATCACAATGATGGTACCTTCTTTCAGAC > NC_000913/2066210‑2066389 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |