Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,088,609 | T→C | P132P (CCT→CCC) | hisG → | ATP phosphoribosyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,088,609 | 0 | T | C | 99.5% | 704.6 / ‑4.7 | 219 | P132P (CCT→CCC) | hisG | ATP phosphoribosyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (112/106); total (113/106) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.05e-01 |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
CGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCTCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGCCGG > NC_000913/2088519‑2088698 | ggcTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCAc > 1:4854967/1‑93 (MQ=255) gcTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCAcc < 2:5674962/93‑1 (MQ=255) tcgtcTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCt > 1:1564532/1‑93 (MQ=255) tcgtcTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCt > 2:9166017/1‑93 (MQ=255) ctgcTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTc < 2:7404102/90‑1 (MQ=255) gtcTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCa > 2:70745/1‑93 (MQ=255) tcTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCaa > 1:2517698/1‑93 (MQ=255) tcTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATAGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCaa > 2:7221592/1‑93 (MQ=255) cTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAg < 1:9280965/93‑1 (MQ=255) tttCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGc > 2:9335205/1‑93 (MQ=255) tttCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGc < 1:8584409/93‑1 (MQ=255) ttCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCg > 2:6242387/1‑93 (MQ=255) ttCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCg > 2:3582328/1‑93 (MQ=255) tCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGt < 1:7215896/93‑1 (MQ=255) tCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGt < 2:682395/93‑1 (MQ=255) tCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGt < 1:4745388/93‑1 (MQ=255) tCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGt < 2:6762782/93‑1 (MQ=255) cTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTAt < 2:580018/93‑1 (MQ=255) cTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTAt > 2:1826649/1‑93 (MQ=255) ggCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCCAGCGTTAtcc > 2:2940513/1‑92 (MQ=255) ggCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTAtct > 2:147104/1‑93 (MQ=255) aCGCCGGTTGATGGAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAACCGGTAACCGTATCGCCCCCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGAc < 2:8026162/93‑1 (MQ=255) cGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGAcc < 1:9266074/93‑1 (MQ=255) cGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGAcc < 1:7776811/93‑1 (MQ=255) ccGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAg < 1:4433793/93‑1 (MQ=255) cGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGa > 2:7006773/1‑93 (MQ=255) cGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGa > 2:10037631/1‑93 (MQ=255) cGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGa < 2:4288204/93‑1 (MQ=255) gTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGaaa > 1:9596972/1‑93 (MQ=255) gTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGaaa > 1:9596970/1‑93 (MQ=255) gTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTAGACCAGaaa > 2:4531293/1‑93 (MQ=255) ttGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTAGCCCCACCTGCTCAAGCTTTATCTCGACCAGAAAg < 1:1436772/93‑1 (MQ=255) gatgaAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGc > 2:4070118/1‑93 (MQ=255) atgaAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCa < 2:5573368/93‑1 (MQ=255) tgaAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCAt > 2:4846640/1‑93 (MQ=255) tgaAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCAt < 1:6946956/93‑1 (MQ=255) gaAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCAtc > 1:8132878/1‑93 (MQ=255) aaGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCAtct > 2:5339952/1‑93 (MQ=255) ccTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCtt > 2:6154077/1‑93 (MQ=255) cTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCttt < 2:5797161/93‑1 (MQ=255) cTGGAACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCttt < 2:902270/93‑1 (MQ=255) tGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGCACAGAAAGGCATCTCtttt > 1:598544/1‑93 (MQ=255) gggACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTa < 1:8989712/93‑1 (MQ=255) gggACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTa > 1:3131945/1‑93 (MQ=255) gggACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTa > 1:7886135/1‑93 (MQ=255) gACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTaaa < 2:646699/93‑1 (MQ=255) gTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCt < 2:2445142/93‑1 (MQ=255) gTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCt < 2:9399256/93‑1 (MQ=255) gTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCt > 1:6023179/1‑93 (MQ=255) gTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCt > 1:7079603/1‑93 (MQ=255) gTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCt < 1:7032216/93‑1 (MQ=255) tCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTg < 2:6848361/93‑1 (MQ=255) ccGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGc > 2:8345071/1‑93 (MQ=255) gCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCtt > 2:2830251/1‑93 (MQ=255) gCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCtt > 1:843053/1‑93 (MQ=255) gCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCtt > 1:4005758/1‑93 (MQ=255) ctctCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTa < 1:2640595/93‑1 (MQ=255) ctctCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTa > 2:3760044/1‑93 (MQ=255) ctctCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTa < 2:6572093/93‑1 (MQ=255) ctctCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTa < 1:7648120/93‑1 (MQ=255) ctcCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACt > 1:2786299/1‑93 (MQ=255) ctcCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACt > 1:3154149/1‑93 (MQ=255) cTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGaa < 2:1703979/93‑1 (MQ=255) cTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGaa < 1:4312579/93‑1 (MQ=255) cTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGaa < 1:5165510/93‑1 (MQ=255) ttAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGaag > 1:3425299/1‑92 (MQ=255) tAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACg > 2:4635171/1‑93 (MQ=255) tAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACg > 1:2256529/1‑93 (MQ=255) aaaCGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATGTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACgg < 2:5047739/93‑1 (MQ=255) aaaCGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACgg > 1:387399/1‑93 (MQ=255) aaaCGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACgg < 1:5037735/93‑1 (MQ=255) aaCGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGt < 2:3165274/93‑1 (MQ=255) cGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTc > 2:4251456/1‑93 (MQ=255) ggTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCt < 1:10018942/93‑1 (MQ=255) gTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGATCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTg < 1:6434148/93‑1 (MQ=255) aaCGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTg < 2:7848761/93‑1 (MQ=255) aaCGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTg > 2:1051734/1‑93 (MQ=255) aCGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGa < 2:3705692/93‑1 (MQ=255) aCGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGa < 2:1983362/93‑1 (MQ=255) aCGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGa < 2:8575828/93‑1 (MQ=255) aCGTATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGa < 2:5928014/93‑1 (MQ=255) tATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGt < 2:691002/93‑1 (MQ=255) tATCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGt > 1:4704924/1‑93 (MQ=255) aTCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTc < 2:493427/93‑1 (MQ=255) aTCGCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTc > 2:2253360/1‑93 (MQ=255) gCCACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGCTGAAGTCGcc < 2:3126044/93‑1 (MQ=255) ccACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGccc > 1:5413192/1‑93 (MQ=255) ccACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGccc > 1:4940607/1‑93 (MQ=255) cACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGcccc > 1:6261925/1‑93 (MQ=255) cACCTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGcccc > 2:8542785/1‑93 (MQ=255) ccTCTTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCcgc > 1:9734882/1‑93 (MQ=255) ctctTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCcgcg < 1:8021702/93‑1 (MQ=255) ctctTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCcgcg < 2:8200336/93‑1 (MQ=255) ctctTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCcgcg > 2:9121111/1‑93 (MQ=255) ctctTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCcgcg > 1:8499477/1‑93 (MQ=255) tctTATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGt > 2:8300522/1‑93 (MQ=255) ttATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGc < 1:5572483/93‑1 (MQ=255) tATCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGcc < 2:8503107/93‑1 (MQ=255) aTCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGCCg > 2:411838/1‑93 (MQ=255) aTCCCCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGCCg > 1:7290685/1‑93 (MQ=255) | CGGCTGTCGTCTTTCGCTGGCAACGCCGGTTGATGAAGCCTGGGACGGTCCGCTCTCCTTAAACGGTAAACGTATCGCCACCTCTTATCCTCACCTGCTCAAGCGTTATCTCGACCAGAAAGGCATCTCTTTTAAATCCTGCTTACTGAACGGTTCTGTTGAAGTCGCCCCGCGTGCCGG > NC_000913/2088519‑2088698 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |