Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,143,530 | T→C | L748P (CTG→CCG) | yegE → | putative sensor‑type protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,143,530 | 0 | T | C | 99.6% | 818.8 / ‑5.2 | 255 | L748P (CTG→CCG) | yegE | putative sensor‑type protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (114/140); total (114/141) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.44e-01 |
Only 100 of 265 total aligned reads displayed.
TTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGC > NC_000913/2143440‑2143619 | ttATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGCACTGGCGTCGTTAATGCCGa > 1:1037678/1‑93 (MQ=255) ttATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGa > 1:6753823/1‑93 (MQ=255) ttATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGa < 2:5943926/93‑1 (MQ=255) tATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGATGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAg > 1:3472295/1‑93 (MQ=255) tATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAg > 2:5681239/1‑93 (MQ=255) tATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAg > 2:3544903/1‑93 (MQ=255) aTCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGt < 2:1013007/93‑1 (MQ=255) tCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTa < 1:2524289/93‑1 (MQ=255) tCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTa < 2:7283063/93‑1 (MQ=255) tCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTa > 2:7408253/1‑93 (MQ=255) tCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTa < 1:4439922/93‑1 (MQ=255) gATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtg > 2:7466400/1‑93 (MQ=255) gATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtg > 1:3861981/1‑93 (MQ=255) aTCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgc < 2:5241373/93‑1 (MQ=255) tCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGTCGAGTAtgct > 2:46348/1‑93 (MQ=255) tCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgct > 2:669296/1‑93 (MQ=255) tCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgct > 1:4048725/1‑93 (MQ=255) tCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTAtgct < 2:3354459/93‑1 (MQ=255) gATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCTGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGGATGCTGCGt > 1:3395273/1‑93 (MQ=255) gATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGt > 1:1810781/1‑93 (MQ=255) aTCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGtt > 2:2762717/1‑93 (MQ=255) tCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTc > 2:2312006/1‑93 (MQ=255) cGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTcc > 2:6700919/1‑93 (MQ=255) gCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCa > 2:1610529/1‑93 (MQ=255) cTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAg < 2:6437096/93‑1 (MQ=255) tttAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGc < 2:7945481/93‑1 (MQ=255) tAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGa > 1:7329556/1‑93 (MQ=255) tAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGa < 1:7904596/93‑1 (MQ=255) aaaGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGAc < 2:6344797/93‑1 (MQ=255) aaaGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGAc > 1:4233129/1‑93 (MQ=255) aaGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACg < 1:2684165/93‑1 (MQ=255) aGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACgg > 1:5385663/1‑92 (MQ=255) gCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTg > 2:9043297/1‑93 (MQ=255) gCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTg > 1:5023858/1‑93 (MQ=255) cGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGc < 2:9758465/93‑1 (MQ=255) ggTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCt < 1:9344039/93‑1 (MQ=255) gTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTg < 1:6941459/93‑1 (MQ=255) tGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTgg > 1:8563116/1‑93 (MQ=255) aaTGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGgcg < 1:9222925/93‑1 (MQ=255) aaTGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGgcg > 1:3526371/1‑93 (MQ=255) tGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGcgcg > 2:3810475/1‑93 (MQ=255) gACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGcgcgc > 1:7923362/1‑92 (MQ=255) aCAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCTAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGAc > 2:5116927/1‑93 (MQ=255) aCAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGAc < 2:2092180/93‑1 (MQ=255) aGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTc < 2:3973041/93‑1 (MQ=255) gcgcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCg > 2:4352420/1‑93 (MQ=255) gcgcCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGACGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCg < 2:8879894/93‑1 (MQ=255) ccGGTCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTg < 2:5746506/93‑1 (MQ=255) ccGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTg < 2:704544/93‑1 (MQ=255) gggCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTgtg > 2:3855946/1‑91 (MQ=255) gggCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGCGCTGGCGAGACTCGGTggg > 2:6564419/1‑93 (MQ=255) ggCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTgggg > 1:7795059/1‑93 (MQ=255) ggCAGGCGGCGGGTGACGCCGTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTGAATGCCGAGCACGCTGCGGTCCAGCGACGGGCTGGCGCGACTCGgggggg > 2:7719895/1‑93 (MQ=255) cATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGAt < 1:4926955/93‑1 (MQ=255) aTGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATg > 1:6517832/1‑93 (MQ=255) tGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGCCTCGGTGGGGATGa > 2:6048289/1‑93 (MQ=255) cggcggGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGGTGAAt > 2:1246823/1‑93 (MQ=255) ggcggGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAAtt > 2:1796964/1‑93 (MQ=255) ggcggGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAAtt > 1:5154360/1‑93 (MQ=255) gcggGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAAttt < 1:190232/93‑1 (MQ=255) gcggGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAAttt < 2:4128886/93‑1 (MQ=255) gggTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTgg > 2:3564988/1‑93 (MQ=255) ggTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGt < 2:8289697/93‑1 (MQ=255) gTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTc < 2:2669024/93‑1 (MQ=255) gTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTc < 1:4734235/93‑1 (MQ=255) tGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTct > 1:1583193/1‑93 (MQ=255) gACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctg > 2:7802830/1‑93 (MQ=255) aCGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctgc < 2:8414609/93‑1 (MQ=255) aCGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctgc > 1:9927262/1‑93 (MQ=255) cGCTTTGCTGCGCGTACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctgct < 1:8396184/93‑1 (MQ=255) cGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTctgct < 2:7130883/93‑1 (MQ=255) cTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCtgctgc < 2:2034081/93‑1 (MQ=255) tttGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTgctgct > 2:3702379/1‑93 (MQ=255) ttGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTa < 1:9988419/93‑1 (MQ=255) tgctgcGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTAc > 1:2929807/1‑93 (MQ=255) gctgcGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTAcc < 1:7422682/93‑1 (MQ=255) ctgcGCGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCa < 1:1387863/93‑1 (MQ=255) gcgcGAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACACGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAgc > 1:683911/1‑92 (MQ=255) cgcgAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGAc < 2:213601/93‑1 (MQ=255) cgcgAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGAc < 2:7699745/93‑1 (MQ=255) gcgAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACt < 1:8754198/93‑1 (MQ=255) cgAACTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTg > 2:3646173/1‑93 (MQ=255) aCTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTaa < 2:8237467/93‑1 (MQ=255) aCTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTaa < 2:1556847/93‑1 (MQ=255) cTGGCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAAt < 1:4506357/93‑1 (MQ=255) ggCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTGTGCTGCTACCAGACTGTAATGt < 1:9415188/93‑1 (MQ=255) ggCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGt > 2:5506628/1‑93 (MQ=255) gCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGtt < 1:7338119/93‑1 (MQ=255) gCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGtt < 1:9498278/93‑1 (MQ=255) gCGTCGTTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGtt < 2:1990170/93‑1 (MQ=255) gtcgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGa > 1:797549/1‑93 (MQ=255) gtcatTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGa < 1:5593033/93‑1 (MQ=255) tcgtTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGaa < 1:3172473/93‑1 (MQ=255) tcgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGaa > 2:429086/1‑93 (MQ=255) cgtTAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGaaa > 2:2210313/1‑93 (MQ=255) ttAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAgc < 1:1706180/93‑1 (MQ=255) ttAATGCCGAGTATGCAGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAgc > 1:2213599/1‑93 (MQ=255) tAATGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAgcg < 2:5905200/93‑1 (MQ=255) aTGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAgcgcg < 2:6873749/93‑1 (MQ=255) tGCCGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAgcgcgc < 1:7093775/93‑1 (MQ=255) | TTATCGATCTTGATCGCTTTAAAGCGGTGAATGACAGCGCCGGGCATGCGGCGGGTGACGCTTTGCTGCGCGAACTGGCGTCGTTAATGCTGAGTATGCTGCGTTCCAGCGACGTGCTGGCGCGACTCGGTGGGGATGAATTTGGTCTGCTGCTACCAGACTGTAATGTTGAAAGCGCGC > NC_000913/2143440‑2143619 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |