| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,556,088 | G→A | R204R (CGC→CGT) | b2441 ← | ethanolamine ammonia‑lyase, heavy chain |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,556,088 | 0 | G | A | 99.6% | 836.0 / NA | 235 | R204R (CGC→CGT) | b2441 | ethanolamine ammonia‑lyase, heavy chain |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (131/102); total (131/104) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
GCTTCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACGCGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTGCGC > NC_000913/2555999‑2556177 | ttCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCt > 2:4711649/1‑93 (MQ=255) ttCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCt > 2:9279976/1‑93 (MQ=255) tCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACATCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCtt > 1:5026083/1‑93 (MQ=255) cGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTa < 1:242094/93‑1 (MQ=255) cGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTa > 1:3889070/1‑93 (MQ=255) gATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTaa < 2:1798130/93‑1 (MQ=255) aTCCGGGTTGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGGTGAATTCGTCGATCACGCCATAGATGGTATCTAATACACGGCATAAg > 2:8980022/1‑93 (MQ=255) tCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGt > 1:4184374/1‑93 (MQ=255) cTGGGTGGTGACGTGCGGCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGtt < 2:5251869/93‑1 (MQ=255) cTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAGGtt < 2:2955544/93‑1 (MQ=255) gtggtgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTcc > 1:4708283/1‑93 (MQ=255) tggtgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGATGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTcaa > 2:4419625/1‑91 (MQ=255) tgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAcgt > 1:10033629/1‑93 (MQ=255) tgACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAcgt < 2:9584308/93‑1 (MQ=255) gACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAcgtc > 1:6101471/1‑93 (MQ=255) aCGTGCGCCAGTGCACAGCCCTGAGTTGGGATGTTTAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACGCACGGCTTAAGTTTTCCAcgtcg < 1:3213435/93‑1 (MQ=255) aCGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCAcgtcg > 2:8791753/1‑93 (MQ=255) tGCACCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCgtca < 1:5385848/93‑1 (MQ=255) ccAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGACTTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACTTCgtcagtca > 1:3267760/1‑93 (MQ=255) cAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCAc > 2:3205052/1‑93 (MQ=255) aGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCAcc > 2:3174209/1‑93 (MQ=255) aGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCAcc < 1:5275817/93‑1 (MQ=255) gTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCg < 1:9434194/93‑1 (MQ=255) gTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCg > 1:7153164/1‑93 (MQ=255) aGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTaa > 1:6796060/1‑93 (MQ=255) gCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAAc < 2:9427582/93‑1 (MQ=255) cccTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACg > 1:8738637/1‑93 (MQ=255) ccTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGc < 2:1301707/93‑1 (MQ=255) cTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGcc > 1:4531495/1‑93 (MQ=255) cTGAGTAGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGcc < 1:8982643/93‑1 (MQ=255) tGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCg > 2:5788507/1‑93 (MQ=255) tGAGTTGGGATGTTGAATTTGACGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCg > 1:1633157/1‑93 (MQ=255) gAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGa < 2:6503231/93‑1 (MQ=255) gAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGa > 2:279952/1‑93 (MQ=255) gAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGa < 2:8907832/93‑1 (MQ=255) aGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGAt < 2:5435187/93‑1 (MQ=255) aGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGAt > 1:3045545/1‑93 (MQ=255) tGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCAc > 1:6039769/1‑93 (MQ=255) tGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCAc > 2:7626041/1‑93 (MQ=255) tGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCAc > 1:9833708/1‑93 (MQ=255) gggATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCAcc > 2:1502393/1‑93 (MQ=255) gggATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCAcc > 2:9693688/1‑93 (MQ=255) gATGTTGAATTTGTCGATCACGCGATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGc < 2:5507905/93‑1 (MQ=255) aTGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCa < 1:7633038/93‑1 (MQ=255) tGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCAt < 2:4592251/93‑1 (MQ=255) gTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATc > 2:9065040/1‑93 (MQ=255) gTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATc < 1:8798777/93‑1 (MQ=255) gTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATc > 2:3813782/1‑93 (MQ=255) gTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATc > 2:4229190/1‑93 (MQ=255) ttGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCg > 2:617396/1‑93 (MQ=255) aTTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCa < 1:4326157/93‑1 (MQ=255) tttGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCAc > 2:4102830/1‑93 (MQ=255) tttGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCAc < 2:2471540/93‑1 (MQ=255) ttGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCAcc < 2:5964016/93‑1 (MQ=255) tGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCAccc > 1:5491430/1‑93 (MQ=255) tCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCg > 1:7582137/1‑93 (MQ=255) cGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGa > 2:5566350/1‑93 (MQ=255) gATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGaa < 1:2813040/93‑1 (MQ=255) gATCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGaa > 2:6846063/1‑93 (MQ=255) caTCACGCCATAGATTGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGaa < 2:2240809/92‑1 (MQ=255) aTCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAg > 2:7355877/1‑93 (MQ=255) aTCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAg > 2:8319212/1‑93 (MQ=255) aTCACGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAg > 1:106535/1‑93 (MQ=255) aTCAAGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTGCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAg < 2:8429217/93‑1 (MQ=255) aCGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGaa < 2:6534245/93‑1 (MQ=255) aCGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGaa < 1:5564721/93‑1 (MQ=255) aCGCCATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGaa < 1:5225307/93‑1 (MQ=255) ccATAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGc > 1:9212315/1‑93 (MQ=255) aTAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGccc < 1:7006104/93‑1 (MQ=255) aTAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGccc > 2:706500/1‑93 (MQ=255) aTAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGccc < 1:4838326/93‑1 (MQ=255) aTAGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGccc < 2:5843262/93‑1 (MQ=255) aGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCtt < 1:5867107/93‑1 (MQ=255) aGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCtt < 1:117118/93‑1 (MQ=255) aGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCtt > 2:918413/1‑93 (MQ=255) aGATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCtt > 1:3563507/1‑93 (MQ=255) gATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTc > 2:3853033/1‑93 (MQ=255) gATGGTATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTc < 2:6026559/93‑1 (MQ=255) 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tATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGa > 2:1180580/1‑93 (MQ=255) tATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGa < 2:8549196/93‑1 (MQ=255) tATCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGa > 1:3333919/1‑93 (MQ=255) tCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAtt > 1:2113817/1‑93 (MQ=255) tCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAtt < 1:8856308/93‑1 (MQ=255) tCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAtt > 2:571419/1‑93 (MQ=255) tCCAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAtt > 1:3189919/1‑93 (MQ=255) ccAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAttt > 2:1526989/1‑93 (MQ=255) ccAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGAttt > 2:7883708/1‑93 (MQ=255) cAACACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTg > 2:2946766/1‑93 (MQ=255) aaCACACGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTgc > 2:7268604/1‑93 (MQ=255) acacacGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTgcg > 1:8017896/1‑93 (MQ=255) acacacGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTgcg > 2:4398254/1‑93 (MQ=255) cacaCGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTgcgc < 1:6602278/93‑1 (MQ=255) | GCTTCGATCTGGGTGGTGACGTGCGCCAGTACACAGCCCTGAGTTGGGATGTTGAATTTGTCGATCACGCCATAGATGGTATCCAACACGCGGCTTAAGTTTTCCACGTCGTCAGTCACCGGGTTAACGCCGATCACCGCATCGCCCACCCCGAAGGAAAGCCCTTCGTAGATTTGCGC > NC_000913/2555999‑2556177 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |