BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	2,559,003	G→A	intergenic (+85/‑385)	b2443 → / → b2444	hypothetical protein/hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	2,559,003	0	G	A	100.0%	1293.3 / NA	350	intergenic (+85/‑385)	b2443/b2444	hypothetical protein/hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (163/187); total (163/187)

Only 100 of 359 total aligned reads displayed.

AAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGG  >  NC_000913/2558913‑2559092

aaaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATc                                                                                         <  2:3116960/93‑1 (MQ=255)

aaaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATc                                                                                         >  2:6753652/1‑93 (MQ=255)

 aaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCa                                                                                        <  2:2124183/93‑1 (MQ=255)

 aaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCa                                                                                        >  2:618526/1‑93 (MQ=255)

  aTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCaa                                                                                       <  1:115711/93‑1 (MQ=255)

  aTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGCCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCaa                                                                                       <  2:8830368/93‑1 (MQ=255)

   tAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCaaa                                                                                      <  1:4098053/93‑1 (MQ=255)

   tAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCaaa                                                                                      <  2:4975846/93‑1 (MQ=255)

    aaCGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCaaaa                                                                                     <  1:9511851/93‑1 (MQ=255)

     aCGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCaaaat                                                                                    >  1:9335465/1‑92 (MQ=255)

     aCGGAATCAGGCGGGCAATGTCCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAg                                                                                    <  1:7931996/93‑1 (MQ=255)

      cGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGt                                                                                   <  2:6800801/93‑1 (MQ=255)

      cGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGt                                                                                   <  1:6781312/93‑1 (MQ=255)

       ggAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGtt                                                                                  <  2:1901942/93‑1 (MQ=255)

        gAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTg                                                                                 >  1:2795611/1‑93 (MQ=255)

          aTCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGcc                                                                               <  2:9040466/93‑1 (MQ=255)

            cAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGt                                                                             <  2:2741882/93‑1 (MQ=255)

            cAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGt                                                                             >  1:3245561/1‑93 (MQ=255)

             aGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGtt                                                                            >  2:5198111/1‑93 (MQ=255)

             aGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGtt                                                                            >  1:7108766/1‑93 (MQ=255)

               gCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTaa                                                                          <  1:10044642/93‑1 (MQ=255)

               gCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTaa                                                                          <  1:3522374/93‑1 (MQ=255)

               gCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTaa                                                                          <  1:2704167/93‑1 (MQ=255)

               gCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTaa                                                                          <  2:7472960/93‑1 (MQ=255)

                 gggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAgg                                                                        <  1:8857659/93‑1 (MQ=255)

                 gggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAgg                                                                        <  1:9952538/93‑1 (MQ=255)

                 gggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAgg                                                                        <  1:5310564/93‑1 (MQ=255)

                 gggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAgg                                                                        <  1:2161721/93‑1 (MQ=255)

                  ggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGt                                                                       >  2:7846917/1‑93 (MQ=255)

                   gCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg                                                                      <  1:169034/93‑1 (MQ=255)

                   gCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg                                                                      >  1:7741417/1‑93 (MQ=255)

                    cAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg                                                                     <  2:5685579/93‑1 (MQ=255)

                    cAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg                                                                     <  1:6495604/93‑1 (MQ=255)

                    cAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg                                                                     <  2:2046015/93‑1 (MQ=255)

                     aaTGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg                                                                    <  1:2840718/93‑1 (MQ=255)

                     aaTGTTCCCGCCTTTTCTTTCCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg                                                                    <  1:8671388/93‑1 (MQ=255)

                       tGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTc                                                                  >  2:6282010/1‑93 (MQ=255)

                            ccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg                                                             <  2:3290047/93‑1 (MQ=255)

                            ccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg                                                             <  2:3812517/93‑1 (MQ=255)

                              gCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt                                                           <  2:4880642/93‑1 (MQ=255)

                                cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc                                                         <  1:5761989/93‑1 (MQ=255)

                                 ttttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGcc                                                        >  2:8232642/1‑93 (MQ=255)

                                 ttttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGcc                                                        >  1:1214747/1‑93 (MQ=255)

                                 ttttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGcc                                                        >  2:96630/1‑93 (MQ=255)

                                 ttttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGcc                                                        >  2:972286/1‑93 (MQ=255)

                                   ttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt                                                      >  1:4199342/1‑93 (MQ=255)

                                    tCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt                                                     >  1:6177527/1‑93 (MQ=255)

                                      tttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTaa                                                   <  2:7264902/93‑1 (MQ=255)

                                      tttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTaa                                                   <  2:3573561/93‑1 (MQ=255)

                                       ttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAg                                                  <  2:4477607/93‑1 (MQ=255)

                                       ttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAg                                                  <  1:4708659/93‑1 (MQ=255)

                                       ttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAg                                                  >  1:6899720/1‑93 (MQ=255)

                                        tGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAgg                                                 >  1:2923250/1‑93 (MQ=255)

                                          ccTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg                                               <  1:233253/93‑1 (MQ=255)

                                          ccTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg                                               <  2:10025320/93‑1 (MQ=255)

                                          ccTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg                                               <  2:6090281/93‑1 (MQ=255)

                                           cTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg                                              <  2:4204661/93‑1 (MQ=255)

                                           cTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg                                              >  2:3767067/1‑93 (MQ=255)

                                           cTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg                                              <  1:2417279/93‑1 (MQ=255)

                                           cTTAATGCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg                                              <  1:854177/93‑1 (MQ=255)

                                            ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg                                             >  2:527485/1‑93 (MQ=255)

                                            ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg                                             <  1:10014662/93‑1 (MQ=255)

                                            ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg                                             >  1:5168247/1‑93 (MQ=255)

                                            ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg                                             <  2:4308836/93‑1 (MQ=255)

                                             tAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGt                                            >  1:2997611/1‑93 (MQ=255)

                                               aTTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCa                                          <  2:65825/93‑1 (MQ=255)

                                                ttCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaa                                         >  2:2479405/1‑93 (MQ=255)

                                                  ccATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa                                       <  2:8893459/93‑1 (MQ=255)

                                                  ccATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa                                       <  2:9877923/93‑1 (MQ=255)

                                                   cATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGGGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg                                      >  2:5396229/1‑93 (MQ=255)

                                                     tGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt                                    <  2:3385414/93‑1 (MQ=255)

                                                          tCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGa                               >  2:9375014/1‑93 (MQ=255)

                                                          tCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGa                               <  1:9127060/93‑1 (MQ=255)

                                                           cAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAg                              >  1:3326851/1‑93 (MQ=255)

                                                            aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGt                             <  2:1734868/93‑1 (MQ=255)

                                                             ggTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTa                            <  1:9760168/93‑1 (MQ=255)

                                                              gTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTaa                           <  1:6218303/93‑1 (MQ=255)

                                                               tGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAg                          <  2:1549463/93‑1 (MQ=255)

                                                               tGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAg                          <  1:7301407/93‑1 (MQ=255)

                                                                  gTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAAt                       >  2:8410433/1‑93 (MQ=255)

                                                                    cAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTc                     >  2:9152071/1‑93 (MQ=255)

                                                                      aaaGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTcta                   <  1:4368490/93‑1 (MQ=255)

                                                                      aaaGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTcta                   >  1:8279965/1‑93 (MQ=255)

                                                                      aaaGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTcta                   <  2:8749094/93‑1 (MQ=255)

                                                                       aaGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctac                  >  1:2537937/1‑93 (MQ=255)

                                                                        aGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctact                 <  2:3627965/93‑1 (MQ=255)

                                                                         gTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctacta                <  1:6020989/93‑1 (MQ=255)

                                                                          ttGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTAt               >  2:7076840/1‑93 (MQ=255)

                                                                            gCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTa             <  2:7682684/93‑1 (MQ=255)

                                                                            gCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTa             >  2:405468/1‑93 (MQ=255)

                                                                            gCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTa             <  2:1036313/93‑1 (MQ=255)

                                                                             ccGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTaa            <  1:8087256/93‑1 (MQ=255)

                                                                             ccGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTaa            <  1:5420269/93‑1 (MQ=255)

                                                                               gTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGa          <  1:479353/93‑1 (MQ=255)

                                                                                ttAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGaa         <  1:3172555/93‑1 (MQ=255)

                                                                                ttAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGaa         >  2:4636619/1‑93 (MQ=255)

                                                                                 tAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAAt        >  1:1794831/1‑93 (MQ=255)

                                                                                  aGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAAtt       >  1:7441719/1‑93 (MQ=255)

                                                                                     ggtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa    <  1:1403614/93‑1 (MQ=255)

                                                                                       tggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAgg  <  1:3680964/93‑1 (MQ=255)

AAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGG  >  NC_000913/2558913‑2559092

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 25 ≤` `ATCG/ATCG` `< 31 ≤` `ATCG/ATCG` `< 35 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`