| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,732,197 | T→C | intergenic (‑4/+126) | clpB ← / ← yfiH | ClpB/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,732,197 | 0 | T | C | 99.4% | 992.2 / ‑1.6 | 309 | intergenic (‑4/+126) | clpB/yfiH | ClpB/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base C (159/146); minor base . (2/0); total (162/147) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.62e-01 | |||||||||||
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
GATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAG > NC_000913/2732107‑2732286 | gATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAAcccc < 2:4531168/93‑1 (MQ=255)gATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAAcccc > 1:2922107/1‑93 (MQ=255) aTAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAAcccct > 1:6968134/1‑93 (MQ=255) ttGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCAt > 2:2589592/1‑93 (MQ=255) tGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATa > 2:3329137/1‑93 (MQ=255) ggTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATaa < 2:4272235/93‑1 (MQ=255) ggTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATaa < 1:7636981/93‑1 (MQ=255) ggTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATaa > 2:9262122/1‑93 (MQ=255) gTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAAc > 1:8699846/1‑93 (MQ=255) ttGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACg > 2:4923595/1‑93 (MQ=255) ttGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACg > 1:1871350/1‑93 (MQ=255) ttGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACg > 1:4411376/1‑93 (MQ=255) tGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACgg < 2:4970432/93‑1 (MQ=255) cGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATc < 2:1991043/93‑1 (MQ=255) cGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATc > 1:5666321/1‑93 (MQ=255) gTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCa > 1:4587476/1‑93 (MQ=255) tGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCaa > 2:8105055/1‑93 (MQ=255) tGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCaa < 1:7926608/93‑1 (MQ=255) gCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCaaa < 2:7549060/93‑1 (MQ=255) cccGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAg < 2:59576/93‑1 (MQ=255) cccGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAg < 2:6217257/93‑1 (MQ=255) aGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGc > 1:4651051/1‑93 (MQ=255) aGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGc > 1:507098/1‑93 (MQ=255) aGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGc > 1:5263523/1‑93 (MQ=255) gTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCt > 1:8014278/1‑93 (MQ=255) gTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCt < 1:2314740/93‑1 (MQ=255) tGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTa > 1:2079715/1‑93 (MQ=255) tGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTa > 1:6406143/1‑93 (MQ=255) ccAAGTGATTGGGCATCGTCAAGAGCAATCTGGAATTTATTAGTAATACGATTCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTAc < 1:1295097/92‑1 (MQ=255) aaGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTg > 2:1790352/1‑93 (MQ=255) aaGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTg < 2:1858027/93‑1 (MQ=255) aaGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTg > 1:9689525/1‑93 (MQ=255) gTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGga < 1:4289950/93‑1 (MQ=255) gTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGga < 2:5842698/93‑1 (MQ=255) tGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGgag > 2:3805318/1‑93 (MQ=255) gATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGgaga > 2:7811963/1‑93 (MQ=255) aTTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGAt < 2:773525/93‑1 (MQ=255) ttGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGAtt > 1:9022096/1‑93 (MQ=255) ttGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGAtt < 1:7477730/93‑1 (MQ=255) tGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTa < 2:5456908/93‑1 (MQ=255) gggCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTaa < 1:3066850/93‑1 (MQ=255) ggCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTaaa < 2:543787/93‑1 (MQ=255) cATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATg > 2:2184391/1‑93 (MQ=255) cATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATg < 1:9591671/93‑1 (MQ=255) aTCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGa < 1:9389950/93‑1 (MQ=255) tCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATTCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAg > 1:8438293/1‑93 (MQ=255) tCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAg > 1:6749061/1‑93 (MQ=255) tCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAg > 1:4038384/1‑93 (MQ=255) ggCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGt < 1:2209321/93‑1 (MQ=255) ggCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGt > 1:5713059/1‑93 (MQ=255) gCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTc < 1:9905574/93‑1 (MQ=255) agagCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATc > 2:4778174/1‑93 (MQ=255) agagCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATc > 1:4526140/1‑93 (MQ=255) agagCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATc > 2:4437379/1‑93 (MQ=255) gagCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATcc > 2:6358465/1‑93 (MQ=255) gagCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATcc < 2:7688969/93‑1 (MQ=255) aaGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCa > 2:7110241/1‑93 (MQ=255) gCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAat < 2:5770839/93‑1 (MQ=255) gCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAat > 2:3184544/1‑93 (MQ=255) gCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAat < 2:6803246/93‑1 (MQ=255) gCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAat < 1:383605/93‑1 (MQ=255) cTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAatt < 1:6088092/93‑1 (MQ=255) tGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAatta > 1:3384911/1‑93 (MQ=255) tGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAatta > 1:163517/1‑93 (MQ=255) tGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAatta > 2:9384159/1‑93 (MQ=255) ggAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAattat > 2:9618189/1‑93 (MQ=255) gAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAattatt < 1:1228797/93‑1 (MQ=255) gAATTTATTAGAAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAattatt < 2:4020383/93‑1 (MQ=255) aaTTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTc < 1:3612622/93‑1 (MQ=255) tttATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCaa < 2:5038268/93‑1 (MQ=255) tttATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCaa > 1:355582/1‑93 (MQ=255) ttattaGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAg < 1:5038812/93‑1 (MQ=255) ttattaGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAg < 1:1062941/93‑1 (MQ=255) ttattaGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAg > 1:5454372/1‑93 (MQ=255) ttattaGTAAGACGACCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAg > 2:1299422/1‑93 (MQ=255) attaGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGt > 1:1373103/1‑93 (MQ=255) attaGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGt > 2:8517075/1‑93 (MQ=255) ttaGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGtt > 1:7225342/1‑93 (MQ=255) ttaGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGtt > 1:6924183/1‑93 (MQ=255) aGTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTAt < 1:6621816/93‑1 (MQ=255) gTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTAtt < 1:2618774/93‑1 (MQ=255) gTAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTAtt > 2:1388934/1‑93 (MQ=255) tAAGACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATGACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTg < 1:10026520/93‑1 (MQ=255) aGACGTTCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGGCATCCTTCAATTATACAAGGTTATTGAc > 1:8986471/1‑93 (MQ=255) gACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGAcc > 2:2915704/1‑93 (MQ=255) gACGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGAcc > 2:2289203/1‑93 (MQ=255) aCGATCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCa < 2:3443009/93‑1 (MQ=255) cGATCCAGACGCATAAC‑CCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGa > 1:8382398/1‑93 (MQ=255) aTCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGAt < 1:4083775/93‑1 (MQ=255) tCCAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGAtt > 2:4330989/1‑93 (MQ=255) ccAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTa > 2:2411991/1‑93 (MQ=255) cAGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTaa > 2:9042510/1‑93 (MQ=255) aGACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAt < 2:73272/93‑1 (MQ=255) gACGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAtg < 2:7507906/93‑1 (MQ=255) cGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAtgtg > 1:2985436/1‑93 (MQ=255) cGCATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAAtgtg < 1:5283840/93‑1 (MQ=255) gCATAAACCCTCCCATAACGTATCAAAGATGCTACAGGCGCGTAAACAACAGCGACCCTTAATTATTCAAGGTTATTCGCCAGAATAATGTga > 2:8664924/1‑93 (MQ=255) cATAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaa > 1:5937265/1‑93 (MQ=255) aTAACCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaa < 2:5543395/93‑1 (MQ=255) aaCCCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTgaaaag > 1:8687171/1‑93 (MQ=255) | GATAAATTGGTTGTCGTGCCCGAGTGCAAGTGATTGGGCATCGGCAAGAGCAAGCTGGAATTTATTAGTAAGACGATCCAGACGCATAACTCCTCCCATAACGGATCAAAGTTGCTACTGGAGATTAAATGAGGTCATCCCTCAATTATTCAAGGTTATTGACCAGATTAATGTGAAAAG > NC_000913/2732107‑2732286 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |