| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,754,691 | T→C | V171A (GTT→GCT) | intA → | prophage CP4‑57 integrase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,754,691 | 0 | T | C | 99.7% | 1193.0 / ‑5.1 | 371 | V171A (GTT→GCT) | intA | prophage CP4‑57 integrase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (197/172); total (197/174) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.18e-01 | |||||||||||
Only 100 of 380 total aligned reads displayed.
CAATCGGTGATATCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGTTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAGTGTAAATATCGGAA > NC_000913/2754601‑2754780 | cAATCGGTGATATCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTc < 1:5949860/93‑1 (MQ=255) aTCGGTGATATCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTcgc < 2:7733018/93‑1 (MQ=255) aTCGGTGATATCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTcgc < 2:179719/93‑1 (MQ=255) tCGGTGATATCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTcgcc > 1:5390329/1‑93 (MQ=255) tCGGTGATATCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTcgcc < 1:4703358/93‑1 (MQ=255) ggTGATATCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTcggcgc > 1:2595786/1‑93 (MQ=255) ggTGATATCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTcgccgc > 2:4460225/1‑93 (MQ=255) gTGATATCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCgccgcc > 1:6782129/1‑93 (MQ=255) gTGATATCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCgccgcc > 2:6049934/1‑93 (MQ=255) gATATCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCtt < 1:1776761/93‑1 (MQ=255) atatCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCttt < 1:7298284/93‑1 (MQ=255) atatCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCttt < 2:4035423/93‑1 (MQ=255) atCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGt < 2:6600442/93‑1 (MQ=255) tCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAGAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGATCGCCGCCTTTGTc > 2:3465642/1‑93 (MQ=255) tCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTc > 1:6139912/1‑93 (MQ=255) tCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTc < 2:9219850/93‑1 (MQ=255) acAGTATCGCTGATATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTc < 2:7498634/92‑1 (MQ=255) cAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCa > 2:5514008/1‑93 (MQ=255) aGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAg < 2:9580667/93‑1 (MQ=255) gTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGc > 1:9274108/1‑93 (MQ=255) gTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGc < 2:2068644/93‑1 (MQ=255) tATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCg > 1:2884067/1‑93 (MQ=255) tATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGACAGAGGAGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCg > 2:7216490/1‑93 (MQ=255) tCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTa > 2:1494117/1‑93 (MQ=255) cTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTa > 1:6436915/1‑93 (MQ=255) tGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCTGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTaa < 1:3712991/93‑1 (MQ=255) tGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTaa > 1:4930372/1‑93 (MQ=255) gagaTTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAAc < 1:5467003/93‑1 (MQ=255) gagaTTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAAc < 2:1020287/93‑1 (MQ=255) aTTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGaa > 1:9807080/1‑93 (MQ=255) tAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGt > 1:3275663/1‑93 (MQ=255) tAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGt > 2:8388134/1‑93 (MQ=255) aGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCa < 1:7602105/93‑1 (MQ=255) tCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGAt < 1:9681343/93‑1 (MQ=255) tCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGAt < 2:2821851/93‑1 (MQ=255) tCATACTCTGGTTAAAGCACTTCAGCCGGATCAGGCCACAGGCGCATTAGAGACTGCTCGCCGACTTTGTCAGCGTATTAATCAAGCCATgct > 2:4260525/1‑91 (MQ=255) cATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGAtt > 1:5773049/1‑93 (MQ=255) cATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGAtt < 2:5199227/93‑1 (MQ=255) aTACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGAttt < 2:3862933/93‑1 (MQ=255) aTACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGAttt > 2:3194170/1‑93 (MQ=255) tACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTa < 1:6251431/93‑1 (MQ=255) tACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTa > 1:5700774/1‑93 (MQ=255) tACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTa > 1:10009748/1‑93 (MQ=255) tACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTa < 2:9321893/93‑1 (MQ=255) tACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTa > 1:3766761/1‑93 (MQ=255) tACTCTGGTTAAAGCAGTTAAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTa < 1:9490348/93‑1 (MQ=255) ctctGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTCTg > 2:885799/1‑93 (MQ=255) ctctGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATg < 1:8247664/93‑1 (MQ=255) tctGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATgc < 1:8824530/93‑1 (MQ=255) ggTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCa < 2:4611979/93‑1 (MQ=255) gTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAg > 2:1102369/1‑93 (MQ=255) tAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGaa < 1:3663503/93‑1 (MQ=255) aaaGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAac > 1:8494370/1‑93 (MQ=255) aaaGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGAAGAac > 1:2244288/1‑93 (MQ=255) aaGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAaca < 2:2477452/93‑1 (MQ=255) aGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAacac < 1:5023101/93‑1 (MQ=255) aGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAacac > 1:5305437/1‑93 (MQ=255) gCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAAcaca < 1:5214870/93‑1 (MQ=255) gTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGc < 1:6906220/93‑1 (MQ=255) ttCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGcc < 1:8967793/93‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCt < 1:5627884/93‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCt < 2:2223308/93‑1 (MQ=255) tCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCt < 2:3348116/93‑1 (MQ=255) cAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtg > 1:3544806/1‑93 (MQ=255) gCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtgat < 1:7743826/93‑1 (MQ=255) ccGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtgatt < 1:4749055/93‑1 (MQ=255) ccGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtgatt > 1:9936147/1‑93 (MQ=255) cGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAATGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtgattg < 2:8586977/93‑1 (MQ=255) cGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtgattg > 2:5918133/1‑93 (MQ=255) cGGTTCAGGCAAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtgattg < 1:2916375/93‑1 (MQ=255) ggTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtgattga < 1:1173804/93‑1 (MQ=255) ggTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtgattga < 2:3660880/93‑1 (MQ=255) ggTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtgattga < 1:7915211/93‑1 (MQ=255) ggTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCtgattga < 2:1267819/93‑1 (MQ=255) ttacgCCAGAGGCGCATTAAACACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGACGTCATTATTTAGGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGc > 2:7009400/5‑93 (MQ=255) cAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCt < 1:2429469/93‑1 (MQ=255) cAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCt < 1:907894/93‑1 (MQ=255) aGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTg > 2:6919622/1‑93 (MQ=255) ggCCAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGt < 1:3970353/93‑1 (MQ=255) ccAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTc > 1:2008157/1‑93 (MQ=255) cAGAGGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTcc > 2:2964235/1‑93 (MQ=255) gagGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCGGCGTATTAACGAAGCCATGATTTATGCGCAGAAAACAGGCCTGATTGATGCTCTGCCtg > 2:560845/1‑92 (MQ=255) gagGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTa > 2:9762101/1‑93 (MQ=255) gagGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTa > 1:7121897/1‑93 (MQ=255) agGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAg < 2:1639980/93‑1 (MQ=255) agGTGCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAg > 1:315470/1‑93 (MQ=255) gCATTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAGTGTa > 1:4253620/1‑93 (MQ=255) gCAATAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGAGGTATGCGCAGAACACAGGCCTGAGTGATGCTGGTCCGAGTGTa > 2:8969359/1‑93 (MQ=255) aTTAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAGTGTaaa < 2:9850646/93‑1 (MQ=255) ttAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAGTGTAAat > 2:8216557/1‑93 (MQ=255) ttAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAGTGTAAat > 2:4888039/1‑93 (MQ=255) ttAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAGTGTAAat > 1:1559483/1‑93 (MQ=255) tAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAGTGTAAata < 2:5360168/93‑1 (MQ=255) tAGAGACTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAGTGTAAata < 2:5762326/93‑1 (MQ=255) gagaCTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAGTGTAAATATc < 2:194609/93‑1 (MQ=255) agaCTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAGTGTAAATATCg > 1:3025442/1‑93 (MQ=255) gaCTGCTCGCAGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGAGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTACTAGTGTAAATATCgg > 2:8507749/1‑93 (MQ=255) aCTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAGTGTAAATATCGGa > 1:1665581/1‑93 (MQ=255) cTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAGTGTAAATATCGGaa > 2:648501/1‑93 (MQ=255) cTGCTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAGTGTAAATATCGGaa < 2:5829676/93‑1 (MQ=255) | CAATCGGTGATATCAGTATCACTGAGATTAAGGCTCATACTCTGGTTAAAGCAGTTCAGCCGGTTCAGGCCAGAGGTGCATTAGAGACTGTTCGCCGCCTTTGTCAGCGTATTAACGAAGTCATGATTTATGCGCAGAACACAGGCCTGATTGATGCTGTTCCTAGTGTAAATATCGGAA > NC_000913/2754601‑2754780 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |