Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 329,174 | A→G | Y163C (TAC→TGC) | betT → | high‑affinity choline transport |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 329,174 | 0 | A | G | 99.6% | 886.0 / ‑5.1 | 278 | Y163C (TAC→TGC) | betT | high‑affinity choline transport |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (147/130); total (147/131) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.71e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.50e-01 |
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
AGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACT > NC_000913/329084‑329263 | gCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGGGCTGATGGGCATGGCGTTCGGATGCttt > 1:2944391/1‑93 (MQ=255) gCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCttt > 1:1801828/1‑93 (MQ=255) ccGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTa < 1:2889521/93‑1 (MQ=255) cgcgcgTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAg > 1:5310405/1‑93 (MQ=255) cgcgcgTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAg > 1:5220562/1‑93 (MQ=255) gcgcgTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGc > 2:1242202/1‑93 (MQ=255) gcgcgTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGc > 1:8479632/1‑93 (MQ=255) gcgcgTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGc > 1:1698912/1‑93 (MQ=255) gcgcgTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGc > 1:2709912/1‑93 (MQ=255) cgcgTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCt > 1:3158658/1‑93 (MQ=255) gTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATc < 1:9085774/93‑1 (MQ=255) tCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCg < 2:2082098/93‑1 (MQ=255) tCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCg > 1:1389449/1‑93 (MQ=255) cAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGt < 2:596861/93‑1 (MQ=255) cAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGt < 1:4143638/93‑1 (MQ=255) cAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGt > 2:1706191/1‑93 (MQ=255) cGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTtata < 2:8560888/93‑1 (MQ=255) cGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTtata > 2:4114134/1‑93 (MQ=255) ggTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTATCCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAAttt < 2:2649635/93‑1 (MQ=255) ggTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAAttt > 1:6331225/1‑93 (MQ=255) tGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCg < 1:4676055/93‑1 (MQ=255) ggACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGc > 2:9375938/1‑93 (MQ=255) ggACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGc < 1:2130761/93‑1 (MQ=255) ggACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGc > 2:6820399/1‑93 (MQ=255) gACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCt < 2:3601404/93‑1 (MQ=255) cGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTcc > 2:7545890/1‑92 (MQ=255) cGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCa < 2:4918804/93‑1 (MQ=255) cGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCa < 1:6116432/93‑1 (MQ=255) gCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCAc > 2:7926212/1‑93 (MQ=255) cTGTTTCTCTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCAcc < 2:3327442/93‑1 (MQ=255) cTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCAcc < 2:4270486/93‑1 (MQ=255) cTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCAcc > 1:8061314/1‑93 (MQ=255) tGTTTCGCTACGGCTTACCCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCa < 2:90255/93‑1 (MQ=255) gTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCac > 2:4320401/1‑92 (MQ=255) gTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCAt > 2:6075673/1‑93 (MQ=255) tttCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATc < 2:8618112/93‑1 (MQ=255) tttCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATc < 1:1140623/93‑1 (MQ=255) tttCACTACGGCGTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATc < 1:6383525/93‑1 (MQ=255) ttCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATcc < 1:5278517/93‑1 (MQ=255) ttCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATcc < 2:5089432/93‑1 (MQ=255) tCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCg > 1:5529791/1‑93 (MQ=255) aCTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCt > 1:7727540/1‑93 (MQ=255) aCTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCt > 1:1603796/1‑93 (MQ=255) cTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTc > 2:2029789/1‑93 (MQ=255) cGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGgc < 1:9076089/93‑1 (MQ=255) cGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGgc > 2:9513242/1‑93 (MQ=255) gCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGgcgc < 1:3540228/93‑1 (MQ=255) ttAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTg > 1:2563398/1‑93 (MQ=255) ttAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTg > 1:7015994/1‑93 (MQ=255) aaCCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTa < 2:7484303/93‑1 (MQ=255) aaCCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTa > 2:2346047/1‑93 (MQ=255) aCCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTAc < 1:9229732/93‑1 (MQ=255) aCCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTAc < 1:6547012/93‑1 (MQ=255) ccGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTAcc < 2:9268814/93‑1 (MQ=255) ccGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTAcc < 2:3959483/93‑1 (MQ=255) ccGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTAcc < 2:3774167/93‑1 (MQ=255) ccGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTAcc < 2:2829025/93‑1 (MQ=255) gCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGa < 2:6405138/93‑1 (MQ=255) gCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGa > 1:5659809/1‑93 (MQ=255) ggTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCt > 1:4491507/1‑93 (MQ=255) ggTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCt < 1:7328661/93‑1 (MQ=255) gTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCtt > 2:6509247/1‑93 (MQ=255) gTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCtt < 1:391647/93‑1 (MQ=255) tCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTc > 1:8309334/1‑93 (MQ=255) cGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCg < 1:7966694/93‑1 (MQ=255) aTGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGt > 2:3126895/1‑93 (MQ=255) tGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTa < 1:8749979/93‑1 (MQ=255) tGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTa > 2:9601593/1‑93 (MQ=255) aTGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAAc > 2:4430596/1‑93 (MQ=255) tGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACg > 1:6592662/1‑93 (MQ=255) gcTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGAt > 2:7160837/1‑93 (MQ=255) cTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGAtt > 1:5093871/1‑93 (MQ=255) cTGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGAtt < 2:8074284/93‑1 (MQ=255) tGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTa > 2:8013583/1‑93 (MQ=255) tGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTa > 2:5334118/1‑93 (MQ=255) tGATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTa > 2:5831840/1‑93 (MQ=255) gATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCGCCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTaa < 2:1422228/93‑1 (MQ=255) gATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATTCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTaa > 2:7088516/1‑93 (MQ=255) gATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTaa < 2:1548341/93‑1 (MQ=255) gATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTaa > 1:8846004/1‑93 (MQ=255) gATGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTaa > 2:885373/1‑93 (MQ=255) tGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACg < 2:4741224/93‑1 (MQ=255) tGGGCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACg < 2:9780309/93‑1 (MQ=255) gggCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACgg < 1:9745618/93‑1 (MQ=255) gggCATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACgg < 1:4234170/93‑1 (MQ=255) cATGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGcc > 1:10020176/1‑93 (MQ=255) aTGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCg < 2:2324584/93‑1 (MQ=255) tGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGa > 2:8227062/1‑93 (MQ=255) tGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGa > 1:305969/1‑93 (MQ=255) tGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGa > 1:1454546/1‑93 (MQ=255) tGGCGCTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGa < 1:1074138/93‑1 (MQ=255) gcgcTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATa < 1:7154774/93‑1 (MQ=255) gcTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAgg > 1:5949087/1‑93 (MQ=255) cTCGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTCAACGGATTAACGGGCCGATAGGt > 2:5520347/1‑93 (MQ=255) cGGATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCa < 1:9618624/93‑1 (MQ=255) ggATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCAc > 2:10002950/1‑93 (MQ=255) ggATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCAc > 1:3398484/1‑93 (MQ=255) gATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACt > 2:240576/1‑93 (MQ=255) gATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACt > 1:4791936/1‑93 (MQ=255) gATGCTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACt > 1:3634015/1‑93 (MQ=255) | AGGCCGCGCGTCAGGCGATGGTCTGGACGCTGTTTCACTACGGCTTAACCGGCTGGTCGATGTATGCGCTGATGGGCATGGCGCTCGGATACTTTAGCTATCGTTATAATTTGCCGCTCACCATCCGCTCGGCGCTGTACCCGATCTTCGGTAAACGGATTAACGGGCCGATAGGTCACT > NC_000913/329084‑329263 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |