BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	3,025,603	T→C	G154G (GGT→GGC)	ygfQ →	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	3,025,603	0	T	C	99.7%	900.6 / ‑5.4	283	G154G (GGT→GGC)	ygfQ	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (115/167); total (115/168)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01

Only 100 of 329 total aligned reads displayed.

CGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑CAGTGGCGCTCGGTGC  >  NC_000913/3025513‑3025691

 gTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggtatcggcatc                                                                                        >  2:5979684/1‑93 (MQ=255)

 gTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggtatcggcatc                                                                                        <  2:2950476/93‑1 (MQ=255)

 gTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggtatcggcatc                                                                                        >  2:1726024/1‑93 (MQ=255)

 gTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggtatcggcatc                                                                                        <  1:6433432/93‑1 (MQ=255)

  tCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGgtatcggcatcg                                                                                       <  1:5059162/93‑1 (MQ=255)

    ctCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCggg                                                                                     <  2:8922728/92‑1 (MQ=255)

    aTCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCggg                                                                                     <  1:9709898/93‑1 (MQ=255)

     tCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGc                                                                                    >  2:71056/1‑93 (MQ=255)

     tCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGc                                                                                    >  1:3045706/1‑93 (MQ=255)

      cTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCt                                                                                   >  1:8271157/1‑93 (MQ=255)

       ttCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTg                                                                                  <  1:4903795/93‑1 (MQ=255)

        tCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGt                                                                                 >  2:977925/1‑93 (MQ=255)

          aCCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGttt                                                                               <  1:6061538/93‑1 (MQ=255)

           ccGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTc                                                                              <  2:3498740/93‑1 (MQ=255)

            cGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTct                                                                             >  1:1303730/1‑93 (MQ=255)

              ccATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTctgc                                                                           <  2:2065820/93‑1 (MQ=255)

               cATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTctgct                                                                          <  2:5834431/93‑1 (MQ=255)

                aTTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTctgctg                                                                         >  2:3171784/1‑93 (MQ=255)

                 tttCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTctgctgc                                                                        >  2:3911167/1‑93 (MQ=255)

                    ccGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTGCGTAAGTGGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGa                                                                     <  1:9258927/93‑1 (MQ=255)

                      gTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGAtt                                                                   <  1:939890/93‑1 (MQ=255)

                      gTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGGATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGAtt                                                                   >  2:4666623/1‑93 (MQ=255)

                       tAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATtg                                                                  <  1:6882879/93‑1 (MQ=255)

                       tAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATtg                                                                  >  1:8283898/1‑93 (MQ=255)

                        aaCCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATtgc                                                                 <  2:7664274/93‑1 (MQ=255)

                        aaCCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATtgc                                                                 <  2:7392892/93‑1 (MQ=255)

                        aaCCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATtgc                                                                 <  1:4552025/93‑1 (MQ=255)

                         aCCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATtgct                                                                >  2:8355608/1‑93 (MQ=255)

                           cGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATtgctgc                                                              <  2:9271966/93‑1 (MQ=255)

                            ggTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTgctgct                                                             >  2:7954416/1‑93 (MQ=255)

                            ggTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTgctgct                                                             <  2:8231212/93‑1 (MQ=255)

                             gtgtGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTa                                                            >  1:3473260/1‑93 (MQ=255)

                             gtgtGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCAGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTa                                                            >  2:6189074/1‑93 (MQ=255)

                              tgtgCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTaa                                                           <  2:1382547/93‑1 (MQ=255)

                                 gCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACgg                                                        <  1:4153436/93‑1 (MQ=255)

                                   gTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGgtg                                                      >  2:2658240/1‑93 (MQ=255)

                                    tACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGgtgt                                                     <  2:3577281/93‑1 (MQ=255)

                                    tACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGgtgt                                                     <  2:5109804/93‑1 (MQ=255)

                                    tACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGgtgt                                                     <  1:9350373/93‑1 (MQ=255)

                                     gccTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGtgtg                                                    <  1:8138151/92‑1 (MQ=255)

                                      ccTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTgg                                                   <  1:744862/93‑1 (MQ=255)

                                      ccTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTgg                                                   <  1:8884819/93‑1 (MQ=255)

                                               tACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTa                                          <  1:322091/93‑1 (MQ=255)

                                               tACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTa                                          <  2:2432147/93‑1 (MQ=255)

                                               tACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTa                                          <  1:3823663/93‑1 (MQ=255)

                                               tACGTAAATTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTa                                          >  2:2989566/1‑93 (MQ=255)

                                                aCGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTAt                                         <  1:9559560/93‑1 (MQ=255)

                                                aCGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTAt                                         >  2:2305304/1‑93 (MQ=255)

                                                aCGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTAt                                         <  2:4530339/93‑1 (MQ=255)

                                                 cGTAATTTGCGGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATc                                        <  2:87776/93‑1 (MQ=255)

                                                 cGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATc                                        <  1:9945476/93‑1 (MQ=255)

                                                    aaTTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCaaa                                     >  2:4356002/1‑93 (MQ=255)

                                                       ttGCCGATGGGTATCGCACACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAAc                                  <  1:8986247/93‑1 (MQ=255)

                                                        tGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAAcc                                 <  1:5748493/93‑1 (MQ=255)

                                                        tGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAAcc                                 >  2:5795057/1‑93 (MQ=255)

                                                        tGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAAcc                                 <  1:5366189/93‑1 (MQ=255)

                                                         gCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAAccc                                <  1:9529155/93‑1 (MQ=255)

                                                          ccGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCCAAAACCCg                               >  1:7564285/1‑93 (MQ=255)

                                                           cGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGa                              <  1:2269568/93‑1 (MQ=255)

                                                            gATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGAt                             >  2:6938347/1‑93 (MQ=255)

                                                             aTGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGAtt                            >  2:2503949/1‑93 (MQ=255)

                                                              tGGGTATCGCTCACGGTACAGTTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTg                           >  1:1832314/1‑93 (MQ=255)

                                                              tGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTg                           <  1:5546807/93‑1 (MQ=255)

                                                              tGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGGGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTg                           >  1:2098656/1‑93 (MQ=255)

                                                               gggTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGa                          <  1:5995630/93‑1 (MQ=255)

                                                               gggTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGa                          <  2:8816321/93‑1 (MQ=255)

                                                                ggTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGaa                         >  1:6752111/1‑93 (MQ=255)

                                                                ggTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGaa                         <  1:7769054/93‑1 (MQ=255)

                                                                 gTATCGCTCACGGTACAGTTATCGGCATCGGGCTTTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAAGGGTGTGGTTATGGTTATAAAAAACCCGTTTGAAg                        <  2:1828119/93‑1 (MQ=255)

                                                                   aTCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGc                      >  2:6164517/1‑93 (MQ=255)

                                                                   aTCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGc                      >  1:3677537/1‑93 (MQ=255)

                                                                   aTCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGc                      <  1:8256253/93‑1 (MQ=255)

                                                                    tCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCt                     <  2:7269849/93‑1 (MQ=255)

                                                                    tCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCt                     >  2:2827551/1‑93 (MQ=255)

                                                                    tCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCt                     <  1:2821812/93‑1 (MQ=255)

                                                                     cGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCtt                    <  2:9427298/93‑1 (MQ=255)

                                                                     cGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCtt                    <  2:6633220/93‑1 (MQ=255)

                                                                     cGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCtt                    >  2:2717680/1‑93 (MQ=255)

                                                                      gCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTg                   >  1:7234052/1‑93 (MQ=255)

                                                                      gCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTg                   >  1:174223/1‑93 (MQ=255)

                                                                       cTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑c                 >  1:87190/1‑93 (MQ=255)

                                                                         cACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑cca               <  1:6952355/93‑3 (MQ=255)

                                                                         cACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑cca               <  1:8647672/93‑3 (MQ=255)

                                                                          ccGGTACAGGTCTCGGCGTCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑ccag              <  2:2224374/92‑4 (MQ=255)

                                                                          aCGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑ccag              <  1:1289435/93‑4 (MQ=255)

                                                                           cGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑ccagt             <  1:6280053/93‑5 (MQ=255)

                                                                             gTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTgg            >  2:1231865/1‑93 (MQ=255)

                                                                             gTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTgg            <  1:7129667/93‑1 (MQ=255)

                                                                             gTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTgg            >  1:4442689/1‑93 (MQ=255)

                                                                             gTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTgg            <  1:4397656/93‑1 (MQ=255)

                                                                               aCAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgcg          >  2:5442253/1‑93 (MQ=255)

                                                                               aCAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgcc          >  1:7524531/1‑92 (MQ=255)

                                                                                cAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgcgc         >  2:8286508/1‑93 (MQ=255)

                                                                                 aGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCt        <  2:1638717/93‑1 (MQ=255)

                                                                                  ggtatcggcatcGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTc       <  2:3431864/93‑1 (MQ=255)

                                                                                  ggtatcggcatcGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTc       <  1:2449949/93‑1 (MQ=255)

                                                                                  ggtatcggcatcGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTc       <  1:5660839/93‑1 (MQ=255)

                                                                                  ggtatcggcatcGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTCATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTc       >  1:2698369/1‑93 (MQ=255)

                                                                                   gtatcggcatcgGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCg      <  2:7348626/93‑1 (MQ=255)

                                                                                    tatcggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCgg     <  1:5167146/93‑1 (MQ=255)

CGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑CAGTGGCGCTCGGTGC  >  NC_000913/3025513‑3025691

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 23 ≤` `ATCG/ATCG` `< 30 ≤` `ATCG/ATCG` `< 34 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`