BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_000913	3,243,762	T→C	V340A (GTT→GCT)	exuT →	ExuT

Read alignment evidence...
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*	NC_000913	3,243,762	0	T	C	99.7%	955.8 / ‑5.3	301	V340A (GTT→GCT)	exuT	ExuT
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01

Only 100 of 319 total aligned reads displayed.

GGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTA  >  NC_000913/3243672‑3243851

 gATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTc                                                                                        <  2:9602160/93‑1 (MQ=255)

  aTGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTcc                                                                                       >  2:1626167/1‑93 (MQ=255)

  aTGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTcc                                                                                       >  1:8171566/1‑93 (MQ=255)

   tGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTccc                                                                                      >  1:1170872/1‑93 (MQ=255)

   tGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTccc                                                                                      <  2:2968297/93‑1 (MQ=255)

    gCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCg                                                                                     >  1:10024221/1‑93 (MQ=255)

    gCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCg                                                                                     <  2:7684624/93‑1 (MQ=255)

    gCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCg                                                                                     <  2:6699666/93‑1 (MQ=255)

      cGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTa                                                                                   >  2:897580/1‑93 (MQ=255)

       gATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTaa                                                                                  >  2:5437953/1‑93 (MQ=255)

        aTGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAg                                                                                 >  1:9018499/1‑93 (MQ=255)

         tGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGa                                                                                <  2:9469438/93‑1 (MQ=255)

         tGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGa                                                                                <  2:3776204/93‑1 (MQ=255)

         tGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGa                                                                                <  1:3902498/93‑1 (MQ=255)

            tGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATgg                                                                             >  1:9662967/1‑93 (MQ=255)

             gTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGt                                                                            >  1:1028763/1‑93 (MQ=255)

                tGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGt                                                                         >  2:2657167/1‑93 (MQ=255)

                tGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGt                                                                         <  2:2294157/93‑1 (MQ=255)

                tGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTCTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGt                                                                         >  1:5711878/1‑93 (MQ=255)

                 gCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTa                                                                        >  2:5699055/1‑93 (MQ=255)

                 gCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTa                                                                        >  2:2062869/1‑93 (MQ=255)

                  cTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTaa                                                                       <  1:942226/93‑1 (MQ=255)

                  cTGACCGTGGTTGTTTCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGACCCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTaa                                                                       <  1:425217/93‑1 (MQ=255)

                   tgcccTCGGTTGTATGCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAAc                                                                      <  2:6003342/90‑1 (MQ=255)

                   tGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAAc                                                                      <  2:7852836/93‑1 (MQ=255)

                    gACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACg                                                                     >  1:3171703/1‑93 (MQ=255)

                     aCCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGCTCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGc                                                                    >  1:7258646/1‑93 (MQ=255)

                     aCCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGc                                                                    >  1:8039571/1‑93 (MQ=255)

                      ccTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCt                                                                   >  1:3102038/1‑93 (MQ=255)

                        tCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTgg                                                                 <  2:4988920/93‑1 (MQ=255)

                        tCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTgg                                                                 <  1:3416767/93‑1 (MQ=255)

                        tCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTgg                                                                 >  1:6037091/1‑93 (MQ=255)

                         cGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTggg                                                                <  2:5091717/93‑1 (MQ=255)

                         cGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTggg                                                                <  2:7555136/93‑1 (MQ=255)

                          ggTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGt                                                               >  1:168164/1‑93 (MQ=255)

                          ggTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGt                                                               <  1:2088168/93‑1 (MQ=255)

                            ttGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGc                                                             >  2:3424336/1‑93 (MQ=255)

                            ttGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGc                                                             <  1:6906203/93‑1 (MQ=255)

                             tGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCa                                                            <  1:6170343/93‑1 (MQ=255)

                             tGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCa                                                            <  1:1322242/93‑1 (MQ=255)

                             tGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCa                                                            <  1:3631245/93‑1 (MQ=255)

                             tGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCa                                                            <  2:1422209/93‑1 (MQ=255)

                              gTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAg                                                           <  2:7500553/93‑1 (MQ=255)

                              gTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAg                                                           >  1:2629138/1‑93 (MQ=255)

                                 tCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGc                                                        >  2:3054575/1‑93 (MQ=255)

                                 tCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGc                                                        >  2:4619350/1‑93 (MQ=255)

                                   cTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCtg                                                      >  1:6689585/1‑93 (MQ=255)

                                   cTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCtg                                                      >  2:8472922/1‑93 (MQ=255)

                                    tCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCtga                                                     <  1:7891857/93‑1 (MQ=255)

                                     cGGTGTTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCtgat                                                    <  2:8860851/93‑1 (MQ=255)

                                       gtggtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCtgatga                                                  >  1:3961739/1‑93 (MQ=255)

                                       gtggtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCtgatga                                                  <  1:9186944/93‑1 (MQ=255)

                                       gtggtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCtgatga                                                  >  1:8937574/1‑93 (MQ=255)

                                       gtggtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCtgatga                                                  <  1:4357264/93‑1 (MQ=255)

                                         ggtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCTGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGAtt                                                <  2:3378475/93‑1 (MQ=255)

                                         ggtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGAtt                                                >  1:9256547/1‑93 (MQ=255)

                                          gtTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTg                                               <  1:9756803/93‑1 (MQ=255)

                                           ttACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTgg                                              <  2:934936/93‑1 (MQ=255)

                                            tACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGGTTGGTGGGAACCTGATCTCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGGGCAGTGCTGATGATTGGc                                             >  2:8651988/1‑93 (MQ=255)

                                             tccTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGcc                                            <  1:8805614/92‑1 (MQ=255)

                                              ccTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGccc                                           <  2:6853820/93‑1 (MQ=255)

                                               cTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCg                                          <  1:3380794/93‑1 (MQ=255)

                                               cTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCg                                          >  2:9256845/1‑93 (MQ=255)

                                               cTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCg                                          >  2:702843/1‑93 (MQ=255)

                                                ttccgccgCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCgg                                         <  2:1006997/91‑1 (MQ=255)

                                                tGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCgg                                         <  1:1435119/93‑1 (MQ=255)

                                                tGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCgg                                         >  1:739102/1‑93 (MQ=255)

                                                   cgccgcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTa                                      >  1:6401069/1‑93 (MQ=255)

                                                   cgccgcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTa                                      <  1:5906866/93‑1 (MQ=255)

                                                    gccgcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTAt                                     <  1:5338385/93‑1 (MQ=255)

                                                      cgcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGa                                   <  2:5870305/93‑1 (MQ=255)

                                                       gcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGAt                                  <  2:6820764/93‑1 (MQ=255)

                                                       gcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGAt                                  >  2:7425014/1‑93 (MQ=255)

                                                       gcTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGAt                                  >  2:7252735/1‑93 (MQ=255)

                                                         tGTTCCAGTGTGGGTTTGGTGTAAACCTCATCGATTCGCGTAAGATGGTCGTAACGCGCGATGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCg                                <  2:3948925/93‑1 (MQ=255)

                                                         tGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCg                                <  1:4395922/93‑1 (MQ=255)

                                                           ttCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGc                              >  1:3509412/1‑93 (MQ=255)

                                                            tCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGcc                             <  1:7563541/93‑1 (MQ=255)

                                                            tCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGcc                             <  2:6371505/93‑1 (MQ=255)

                                                             ccAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCt                            <  2:5487093/93‑1 (MQ=255)

                                                              cAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTg                           >  1:5655609/1‑93 (MQ=255)

                                                               aGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGt                          <  2:9717972/93‑1 (MQ=255)

                                                               aGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGt                          >  2:9114203/1‑93 (MQ=255)

                                                               aGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGt                          >  2:6351977/1‑93 (MQ=255)

                                                                  gTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAAAGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCa                       >  2:5305109/1‑93 (MQ=255)

                                                                   ttggtttggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCAc                      >  1:2741398/1‑93 (MQ=255)

                                                                   ttggtttggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCAc                      >  1:7081261/1‑93 (MQ=255)

                                                                      gtttggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCaa                   >  1:8238768/1‑93 (MQ=255)

                                                                      gtttggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCaa                   <  2:2442961/93‑1 (MQ=255)

                                                                       tttggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAAc                  <  2:238970/93‑1 (MQ=255)

                                                                         tggtGTGAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAAccc                <  1:4459469/93‑1 (MQ=255)

                                                                              tgAACCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATg           >  1:243102/1‑93 (MQ=255)

                                                                                aaCCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTc         >  1:8565354/1‑93 (MQ=255)

                                                                                aaCCTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTc         >  1:4615849/1‑93 (MQ=255)

                                                                                  ccTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGc       <  1:4873733/93‑1 (MQ=255)

                                                                                   cTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCa      <  2:215845/93‑1 (MQ=255)

                                                                                   cTGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCa      >  2:3548455/1‑93 (MQ=255)

                                                                                    tGATCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCaa     >  1:9541796/1‑93 (MQ=255)

                                                                                      aTCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAAtt   <  1:8485061/93‑1 (MQ=255)

                                                                                      aTCGCTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAAtt   >  2:2546441/1‑93 (MQ=255)

GGATGCCGATGCTGTTTGCTGACCTCGGTTGTATCCTCGGTGGTTACCTGCCGCCGCTGTTCCAGCGTTGGTTTGGTGTGAACCTGATCGTTTCCCGTAAGATGGTCGTAACGCTGGGTGCAGTGCTGATGATTGGCCCGGGTATGATCGGCCTGTTCACCAACCCGTATGTCGCAATTA  >  NC_000913/3243672‑3243851

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 20 ≤` `ATCG/ATCG` `< 29 ≤` `ATCG/ATCG` `< 34 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`