| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,353,950 | A→G | T562A (ACC→GCC) | gltB → | glutamate synthase large subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,353,950 | 0 | A | G | 99.6% | 896.3 / ‑5.2 | 279 | T562A (ACC→GCC) | gltB | glutamate synthase large subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base G (137/141); total (137/142) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.65e-01 | |||||||||||
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
ATTATTTACGACTACTTCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCACCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGATTCTGCTCTACTCC > NC_000913/3353860‑3354039 | attattTACGACTACTTCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCgccgcc > 1:9555198/1‑93 (MQ=255) ttattTACGACTACTTCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGccgcca > 2:372717/1‑93 (MQ=255) ttattTACGACTACTCCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGccgcca < 1:3884092/93‑1 (MQ=255) tttACGACTACTTCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTa > 2:3030590/1‑93 (MQ=255) tttACGACTACTTCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTa > 2:7856063/1‑93 (MQ=255) tttACGACTACTTCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTa > 1:6684133/1‑93 (MQ=255) ttACGACTACTTCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTAt > 1:1760839/1‑93 (MQ=255) tccGACTACTTCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGGGACTACCCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATc < 1:6116486/91‑1 (MQ=255) tACGACTACTCCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATc < 1:4507016/93‑1 (MQ=255) cGACTACTTCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCgg > 2:5725930/1‑93 (MQ=255) gACTACTTCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCggg > 1:5008250/1‑92 (MQ=255) gACTACTCCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTCACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGt < 1:9679976/93‑1 (MQ=255) cctactCCCCCCAGCCGTTTGCCCAGGTGACTACCCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTc < 1:3053824/92‑1 (MQ=255) tctTCCGCCAGCAGTTGGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTg < 1:9027810/92‑1 (MQ=255) ctcccGCCAGCAGTTGGCCCAGGTGACTACCCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGa < 2:6299545/90‑1 (MQ=255) ctTCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGa > 1:6281230/1‑93 (MQ=255) ctTCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGa > 1:8009795/1‑93 (MQ=255) tCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTACCCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGaaa < 1:9798264/93‑1 (MQ=255) cGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTACCCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATg < 2:8884122/93‑1 (MQ=255) gCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGa > 2:8631154/1‑93 (MQ=255) ccAGCAGTTTGCCCAGGTGACTACCCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGaa < 1:8819135/93‑1 (MQ=255) cagcagTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAAc < 1:2166750/93‑1 (MQ=255) cattttGCCCAGGTGACTACCCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTc < 1:6212563/90‑1 (MQ=255) cagTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTc > 2:2824497/1‑93 (MQ=255) cagTTTGCCCAGGTGACAAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTc < 1:2664311/93‑1 (MQ=255) gTTTGCCCAGGTGACTACCCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCtt < 2:4947000/93‑1 (MQ=255) tttGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCttt > 1:7856761/1‑93 (MQ=255) ttGCCCAGGTGACTACCCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCtttt < 1:5463938/93‑1 (MQ=255) gCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGc > 1:2895700/1‑93 (MQ=255) cAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAGCGTGTTTTGCGaa > 2:9516669/1‑93 (MQ=255) cAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGaa > 1:9424754/1‑93 (MQ=255) ggTGACTACCCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGc < 2:5304505/93‑1 (MQ=255) gTGACTACCCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCa < 2:4613379/93‑1 (MQ=255) gTGACTACCCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCa < 2:620485/93‑1 (MQ=255) gTGACAACCCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCa < 2:9792544/93‑1 (MQ=255) tGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCag > 1:229247/1‑93 (MQ=255) ggACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCag < 2:3460001/92‑1 (MQ=255) gACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCaga < 1:5755474/93‑1 (MQ=255) aCTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCagag < 2:5866265/93‑1 (MQ=255) aCTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCagag > 2:6785753/1‑93 (MQ=255) aCTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCagag > 1:7649884/1‑93 (MQ=255) cgaccccGCCAATCGACCCGCTGCGTGAGGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGACCGTCTTTTGCGAAGCAGAgg < 1:4848978/89‑1 (MQ=255) accccGCCAATCGACCCGCTGCGTGAGGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGc < 1:8913453/91‑1 (MQ=255) ccccGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATCAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGcc < 2:8853625/92‑1 (MQ=255) aCCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGcc > 1:3535908/1‑93 (MQ=255) cccGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCa < 1:5111590/93‑1 (MQ=255) ccGCCAATCGCCCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAg < 1:4768564/93‑1 (MQ=255) ccGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAg > 2:757258/1‑93 (MQ=255) cGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAgg < 2:4442661/93‑1 (MQ=255) gCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGACATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGgc > 1:1099603/1‑93 (MQ=255) ccAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGgcg > 1:81949/1‑93 (MQ=255) ccAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGgcg > 1:4208646/1‑93 (MQ=255) ccAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGgcg > 2:5150334/1‑93 (MQ=255) cAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGgcgc < 1:7475726/93‑1 (MQ=255) aaTCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCa > 1:2554156/1‑93 (MQ=255) aTCGCCCCGCTGCGAGAAGCGCATGTTATGTCACTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCAc < 2:8472366/93‑1 (MQ=255) aTCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGCGCCAGGCGCAc > 2:7978543/1‑93 (MQ=255) gcccTCTGCGGGAAGCGCATTTTCTGTCCGTCGCCGCCCGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCCCACCGtt < 1:2149606/92‑1 (MQ=255) aCCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGtt < 1:6554751/93‑1 (MQ=255) cccGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGttt < 2:3373349/93‑1 (MQ=255) cccGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAACCAGAGGGCCAGGCGCACCGttt > 1:201068/1‑93 (MQ=255) ccGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTa < 1:1655714/93‑1 (MQ=255) ccGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTa > 1:3347449/1‑93 (MQ=255) ccGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTa < 1:3758342/93‑1 (MQ=255) ccGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTa < 1:7940981/93‑1 (MQ=255) gCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAg > 2:2203769/1‑93 (MQ=255) gCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAg > 2:2743972/1‑93 (MQ=255) gCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAg > 2:3187728/1‑93 (MQ=255) tGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCt < 2:6630752/93‑1 (MQ=255) tGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCt < 1:8476998/93‑1 (MQ=255) gCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCtt > 2:2536034/1‑93 (MQ=255) gTGAAGTGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTa < 1:3968722/93‑1 (MQ=255) tGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTaa > 2:4018023/1‑93 (MQ=255) gAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTaaa < 2:3606727/93‑1 (MQ=255) aaGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAAt < 1:6888810/93‑1 (MQ=255) aGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAACTc > 2:9391730/1‑93 (MQ=255) aGCGCATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATc < 1:6502570/93‑1 (MQ=255) cgcATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGc < 2:1607166/93‑1 (MQ=255) cATGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACATCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCTCCg > 1:1484241/1‑93 (MQ=255) aTGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGa > 2:2017407/1‑93 (MQ=255) tGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGAt > 1:4617509/1‑93 (MQ=255) tGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGAt > 1:8304862/1‑93 (MQ=255) tGTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGAt > 1:5950384/1‑93 (MQ=255) gTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGAtt < 1:8113201/93‑1 (MQ=255) gTTATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGAtt < 1:7284150/93‑1 (MQ=255) ttATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGATTc < 1:1187147/93‑1 (MQ=255) ttATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGATTc < 2:7769575/93‑1 (MQ=255) ttATGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGATTc > 1:9822128/1‑93 (MQ=255) aTGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGATTCTg < 2:6894282/93‑1 (MQ=255) aTGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGATTCTg > 1:4010701/1‑93 (MQ=255) tGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGATTCTGc < 2:7266760/93‑1 (MQ=255) tGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGATTCTGc > 2:1815228/1‑93 (MQ=255) tGTCGCTCGCCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGCTTAAGCTTTAAATCGCCGATTCTGc > 2:133396/1‑93 (MQ=255) tcgctcgcCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGATTCTGctc < 1:3905925/93‑1 (MQ=255) cgctcgcCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGCTTCTGctct > 2:1028366/1‑93 (MQ=255) gctcgcCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGATTCTGCTCTa > 1:1343349/1‑93 (MQ=255) cctcgcCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGATTCTGCTCTa < 2:7703671/92‑1 (MQ=255) ctcgcCGCCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGATTCTGCTCTAc > 2:238690/1‑93 (MQ=255) cgccgcCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGATTCTGCTCTACTc < 2:606530/93‑1 (MQ=255) cgccgcCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGATTCTGCTCTACTc > 1:3438050/1‑93 (MQ=255) | ATTATTTACGACTACTTCCGCCAGCAGTTTGCCCAGGTGACTAACCCGCCAATCGACCCGCTGCGTGAAGCGCATGTTATGTCGCTCGCCACCAGTATCGGTCGTGAAATGAACGTCTTTTGCGAAGCAGAGGGCCAGGCGCACCGTTTAAGCTTTAAATCGCCGATTCTGCTCTACTCC > NC_000913/3353860‑3354039 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |