| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,566,875 | A→G | R29R (CGT→CGC) | glgC ← | glucose‑1‑phosphate adenylyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,566,875 | 0 | A | G | 99.7% | 953.3 / ‑5.1 | 309 | R29R (CGT→CGC) | glgC | glucose‑1‑phosphate adenylyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (218/90); total (219/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.39e-01 | |||||||||||
Only 100 of 398 total aligned reads displayed.
GACAGCGCAAAGTCGATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCACGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGAC > NC_000913/3566786‑3566964 | gcgcAAAGTCGATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTAGCGCGtcctc > 1:5514945/1‑93 (MQ=255) gcgcAAAGTCGATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGtcctc > 1:3382840/1‑93 (MQ=255) gcgcAAAGTCGATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGtcctc > 2:7658957/1‑93 (MQ=255) cgcAAAGTCGATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGtcctcc < 1:2460061/93‑1 (MQ=255) cAAAGTCGATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCg > 1:4687389/1‑93 (MQ=255) cAAAGTCGATAATGCGGAACTTACCACC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCg > 1:7983647/1‑93 (MQ=255) aaaGTCGATAATGCGGAACTTCCCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGc < 2:3759634/93‑1 (MQ=255) aaaGTCGATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGc > 1:5809168/1‑93 (MQ=255) aaGTCGATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGcc > 2:7755082/1‑93 (MQ=255) aaGTCGATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGcc > 2:1356409/1‑93 (MQ=255) aaGTCGATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGcc < 1:1040927/93‑1 (MQ=255) aGTCGATAATGGGGACTTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTGCCGCGTCCTCCCGCCa < 2:6178380/93‑1 (MQ=255) gTCGATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAg > 2:1639821/1‑93 (MQ=255) gTCGATAAGGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAACCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAg < 2:2274650/93‑1 (MQ=255) tCGATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGt > 2:4635775/1‑93 (MQ=255) tCGATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGt > 1:8401853/1‑93 (MQ=255) cGATATGGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTa < 2:2589161/93‑1 (MQ=255) gATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTAt > 2:5031843/1‑93 (MQ=255) gATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTAt > 1:3899918/1‑93 (MQ=255) tAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCa > 1:1002440/1‑93 (MQ=255) caaTGCGTACCTCACCGGC‑GAATTGGCCGGCCGTTTTTTCTCGCTTATTGGTTAATTCCTGCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCa < 2:2897330/92‑1 (MQ=255) aaTGCGGAACTTCCCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAg < 2:5428679/93‑1 (MQ=255) aTGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAgg > 2:5243940/1‑93 (MQ=255) aTGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAgg > 2:870182/1‑93 (MQ=255) aTGCGGAA‑TTTCCGCCGGAAGTGTCCGGCGGGTTTTGCTCGTTTATTGGTTAAATCTTGAGGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAgg < 2:63143/93‑1 (MQ=255) ggACCTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCaa < 2:5340811/93‑1 (MQ=255) ggAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCaa < 2:3127180/93‑1 (MQ=255) gAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAAc > 2:419543/1‑93 (MQ=255) gAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGAACCGCGTACTCCCGCCAGTATCAGGTCAAc > 2:2398208/1‑93 (MQ=255) aCTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAg < 1:6231528/93‑1 (MQ=255) tACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGAtt > 2:3838063/1‑93 (MQ=255) tACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGAtt > 2:6500906/1‑93 (MQ=255) cccgcc‑gAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGAttt < 1:2309085/92‑1 (MQ=255) ccgcc‑gAGGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTCCCGCGTCCCCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTc < 1:9902951/93‑1 (MQ=255) ccgcc‑gAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTc > 1:314570/1‑93 (MQ=255) cgcc‑gAGGTTTACGGCCGTTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGTTCCCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCa < 2:3963840/93‑1 (MQ=255) cgcc‑gAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCa < 1:6899119/93‑1 (MQ=255) gcc‑gAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCaa > 2:5650590/1‑93 (MQ=255) gcc‑gAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCaa > 2:5481258/1‑93 (MQ=255) gcc‑gAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCaa > 1:2862305/1‑93 (MQ=255) cc‑gAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAAt > 2:2758233/1‑93 (MQ=255) cc‑gAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAAt < 2:3443099/93‑1 (MQ=255) gAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATgg < 1:6796009/93‑1 (MQ=255) gAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCCTCCTCCCCCCAGTATCAGGGCAACAAATTTCATTgg > 2:8433313/1‑93 (MQ=255) aaGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGc > 1:4992778/1‑93 (MQ=255) aaGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGc > 1:2515710/1‑93 (MQ=255) aaGTGTACGGCCGGTTTTGCCCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGc < 1:5562038/93‑1 (MQ=255) aGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTCCCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCa < 2:8525/93‑1 (MQ=255) aGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCa < 2:1426194/93‑1 (MQ=255) gtgtACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAg > 1:9602021/1‑93 (MQ=255) tgtACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGc > 1:6166742/1‑93 (MQ=255) tgtACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGc > 1:453064/1‑93 (MQ=255) gtACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCt < 2:6749899/93‑1 (MQ=255) tACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTg > 1:6379609/1‑93 (MQ=255) aCGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTgg > 1:9556518/1‑93 (MQ=255) gCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGgtgc > 2:4462585/1‑93 (MQ=255) ggTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGcc > 2:6830820/1‑93 (MQ=255) ggTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGcc > 1:1515913/1‑93 (MQ=255) ggTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGGACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGcc > 2:7352792/1‑93 (MQ=255) ttttGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCaa > 1:7096781/1‑93 (MQ=255) tttGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGGGGGTACCGCGTACTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGCTTTCAATGGCAGCTTGTGCGCCaaa > 2:9947065/1‑92 (MQ=255) ttGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGACATCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACa > 2:3631723/1‑93 (MQ=255) tcgCTCGCTTATTGGTAAAACCTTGCAGGCGGGTCCCGCTTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACa < 2:978016/91‑1 (MQ=255) tGCGCGCGTAGTGTTTAACTCTTTGAGGCGTCTACCGCCTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACAt < 1:1753798/93‑1 (MQ=255) tCGCTTATTGTTTAAATCCTTCAGGCGGGTCCCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTaa < 2:1221648/93‑1 (MQ=255) tCGCTTATTGGTTAAACCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTaa < 2:9305313/93‑1 (MQ=255) ccGCTTATGGGTTAAACCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTaa < 1:2739478/92‑1 (MQ=255) cGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAg > 1:3755546/1‑93 (MQ=255) cTTATTGTTAAAATCCTTCAGGCGGCTCCCGCGCCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTg < 2:7191121/93‑1 (MQ=255) tttttGGTAAAATCCTTCAGGCGGGTCCCGCGTCCCCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGa < 2:8839878/90‑1 (MQ=255) ataggTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGGTGGCGCGCCAACATTAAGTGATc > 1:749543/4‑93 (MQ=255) aTTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATc > 2:2461700/1‑93 (MQ=255) tGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTCCCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGt < 1:5251846/93‑1 (MQ=255) tGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGt > 1:833560/1‑93 (MQ=255) ggTTAAATCCTTCGGGCGGGTACCGCTCCCCCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGtt < 1:7385473/93‑1 (MQ=255) ggTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGtt > 2:1971537/1‑93 (MQ=255) ttAAATCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGttct < 1:1760191/93‑1 (MQ=255) aaTCCTTCAGGGGGGTCCCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTtcttct < 2:5130405/93‑1 (MQ=255) aaTCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGttcttcc > 1:9761930/1‑92 (MQ=255) aaTCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTtcttct > 2:8103297/1‑93 (MQ=255) aTCCTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTtctc > 2:5942437/1‑93 (MQ=255) ccTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTa > 1:8791719/1‑93 (MQ=255) cTTCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTaa > 2:1845693/1‑93 (MQ=255) ttCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTaaa > 1:7806893/1‑93 (MQ=255) tgcgggCGGGTACCGCGTCCCCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTaaa < 2:1396841/89‑1 (MQ=255) tCAGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAAc > 2:7990305/1‑93 (MQ=255) aGGGGGTTACCGCGCCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTa < 1:4331878/93‑1 (MQ=255) aGGCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCGACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTa > 1:8233709/1‑93 (MQ=255) aGGCGGGCCCCGCGCCCCCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTa < 1:1910321/93‑1 (MQ=255) ggCGGGTCCCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTaa < 1:1632988/93‑1 (MQ=255) ggCGGGTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTaa > 2:337381/1‑93 (MQ=255) gggttACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAAcc < 1:7751343/89‑1 (MQ=255) ggggTACCGCGCCCCCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAAcc < 2:1767076/92‑1 (MQ=255) gggTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCa > 1:6495982/1‑93 (MQ=255) gggTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCa > 2:3468957/1‑93 (MQ=255) ggTACTGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCATCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGGTCTTCTCTAAACTAACCAt > 1:8944628/1‑93 (MQ=255) ggTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCAt > 1:2001156/1‑93 (MQ=255) ggTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCAt > 1:1303018/1‑93 (MQ=255) gTACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATg > 2:9069364/1‑93 (MQ=255) tACCGCGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGa > 1:9239512/1‑93 (MQ=255) | GACAGCGCAAAGTCGATAATGCGGAACTTACCGCC‑GAAGTGTACGGCCGGTTTTGCTCGCTTATTGGTTAAATCCTTCAGGCGGGTACCACGTCCTCCCGCCAGTATCAGGGCAACAGATTTCAATGGCAGCTGGCGCGCCAACATTAAGTGATCGTTCTTCTCTAAACTAACCATGAC > NC_000913/3566786‑3566964 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |