| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 419,492 | T→C | R226R (CGT→CGC) | brnQ → | branched chain amino acid transport system II carrier protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 419,492 | 0 | T | C | 98.4% | 766.0 / 0.4 | 243 | R226R (CGT→CGC) | brnQ | branched chain amino acid transport system II carrier protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/1); new base C (118/121); total (121/122) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.78e-01 | |||||||||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
CATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCT > NC_000913/419402‑419581 | cATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCta < 1:6253525/93‑1 (MQ=255)cATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCta < 2:2065426/93‑1 (MQ=255) aTGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCtat > 1:1650193/1‑93 (MQ=255) tGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCtata > 1:8763580/1‑93 (MQ=255) tGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCtata > 1:6400063/1‑93 (MQ=255) ggATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATAc < 1:4340591/93‑1 (MQ=255) ggATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATAc < 1:2740964/93‑1 (MQ=255) ggATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATAc < 2:7583978/93‑1 (MQ=255) gATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATAcc > 2:7563451/1‑93 (MQ=255) gCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTg > 1:2105823/1‑93 (MQ=255) gCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTg > 2:8157299/1‑93 (MQ=255) gCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTg < 1:4741086/93‑1 (MQ=255) cTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTgg > 1:8606995/1‑93 (MQ=255) cTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTgg < 2:8110606/93‑1 (MQ=255) ggCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCt < 2:1696963/93‑1 (MQ=255) ggCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGC‑GCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTg > 2:4710424/1‑93 (MQ=255) ggCGCAATGGTGTTTAGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCt < 2:5630071/93‑1 (MQ=255) gcgcAATGGTGTTTGGTATCGTTCTTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTAGCGTTACCGAATCGCGTCCGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTg > 2:9740217/1‑93 (MQ=255) gcgcAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTg < 1:4200171/93‑1 (MQ=255) cgcAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTgg < 2:9465090/93‑1 (MQ=255) cAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGcc > 1:7885555/1‑93 (MQ=255) cAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGcc > 2:6137303/1‑93 (MQ=255) cAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGcc < 1:8666461/93‑1 (MQ=255) aaTGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCt > 2:9539704/1‑93 (MQ=255) aTGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTg < 1:343531/93‑1 (MQ=255) aTGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTg > 1:9789821/1‑93 (MQ=255) tGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGa < 1:82583/93‑1 (MQ=255) tGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGa > 1:5025275/1‑93 (MQ=255) tGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGa < 2:442227/93‑1 (MQ=255) tGGTGTTTGGTAACGATATAGTTACCGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCAGCTATAACGTCTGGGCTGGCCTgc < 2:8951284/93‑2 (MQ=255) ggTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGAt < 1:2941583/93‑1 (MQ=255) gtTTGGTAGCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCCGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGc < 2:7303113/93‑1 (MQ=255) tttGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATgggg > 2:7169304/1‑91 (MQ=255) tATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGgtgt > 1:1461764/1‑93 (MQ=255) aTCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGtt < 2:3225525/93‑1 (MQ=255) aTCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGtt > 2:2172120/1‑93 (MQ=255) aTCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGtt < 1:3972819/93‑1 (MQ=255) aTCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGGGtt > 1:8451382/1‑93 (MQ=255) tCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTg < 1:7060590/93‑1 (MQ=255) tCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTg > 1:7479416/1‑93 (MQ=255) ttATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTc < 2:7283005/93‑1 (MQ=255) ttATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTc < 2:4836762/93‑1 (MQ=255) tGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGAc > 1:974616/1‑93 (MQ=255) gTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGAct > 1:8010533/1‑93 (MQ=255) gTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGAct > 1:5379260/1‑93 (MQ=255) ttAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGActc < 1:1791091/93‑1 (MQ=255) ttAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGGGTTGGTCTGActc > 1:6962685/1‑93 (MQ=255) cgcgGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTctgct > 1:1225847/1‑93 (MQ=255) cggcgCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGt > 2:4036463/1‑93 (MQ=255) ggcgCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTa < 2:6753364/93‑1 (MQ=255) cgcgTTCTCGTGGCGTTCCCGGCGCGCGTCTGCTGCCCCGCTCTACCGTCTGGGCTGGCCTGGTGGCGGGTGTTGGTCTGCCTCTGCTGTAcc < 1:7724077/93‑1 (MQ=255) cgcgTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTAcc < 1:2329010/93‑1 (MQ=255) cgcgTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTAcc < 2:7019510/93‑1 (MQ=255) gcgTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCt < 1:338251/93‑1 (MQ=255) gcgTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCt < 1:3181480/93‑1 (MQ=255) cgTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTg > 2:3328705/1‑93 (MQ=255) gTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTgg < 1:654223/93‑1 (MQ=255) gTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTgg > 2:7783927/1‑93 (MQ=255) ttCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGgc < 1:9448024/93‑1 (MQ=255) ttCTCGTGGCGTTACCGAAGCGAGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATTGAGGGAGTTGGGCTGACTCTGCTGTAGCTGgc > 2:1171469/1‑93 (MQ=255) tctcGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGgcc > 1:740322/1‑92 (MQ=255) ctcGTGGCGTTACGGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGgcgc < 1:9037310/93‑1 (MQ=255) tcGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCt < 2:2480282/93‑1 (MQ=255) tcGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGGCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCt > 2:1036678/1‑93 (MQ=255) tcGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGGGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCt > 1:8845850/1‑93 (MQ=255) gTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGt > 2:622752/1‑93 (MQ=255) tGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGtt > 1:5513638/1‑93 (MQ=255) gCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGGTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTcc > 1:5271861/1‑93 (MQ=255) gTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGt < 1:7844544/93‑1 (MQ=255) gTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGGCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGt > 1:1090854/1‑93 (MQ=255) gTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGCGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCgc > 1:1329172/1‑92 (MQ=255) ttcccGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTCTCCCGTCTGGGCTGGCCGGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTc < 2:8509456/90‑1 (MQ=255) ttACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTc < 2:9722159/93‑1 (MQ=255) ttACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTc > 1:6096759/1‑93 (MQ=255) ttACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTc < 1:2304186/93‑1 (MQ=255) tACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATCCCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGCCTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCt < 2:8213532/93‑1 (MQ=255) tACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCt < 2:7831575/93‑1 (MQ=255) aCCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTg < 2:4575434/93‑1 (MQ=255) aCCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTg < 1:3015904/93‑1 (MQ=255) ccGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTgg < 2:5960729/93‑1 (MQ=255) cGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTggg < 1:2500880/93‑1 (MQ=255) cGAAGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTggg > 2:8617514/1‑93 (MQ=255) aaGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGt > 1:7083269/1‑93 (MQ=255) aGCGCGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTc > 1:3655156/1‑93 (MQ=255) gcgcGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCa > 1:6832796/1‑93 (MQ=255) gcgcGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCa < 1:1126307/93‑1 (MQ=255) gcgcGTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCa > 1:9183079/1‑93 (MQ=255) cgTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGAc < 1:9910632/93‑1 (MQ=255) gTCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACa > 2:2681281/1‑93 (MQ=255) gTCTGCTACCCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACa < 2:3683695/93‑1 (MQ=255) tCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAg < 2:6599542/93‑1 (MQ=255) tCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAg > 1:4444827/1‑93 (MQ=255) tCTGCTGACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGGGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAg > 2:6364569/1‑93 (MQ=255) ctgctgACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAgc > 2:202166/1‑93 (MQ=255) ctgctgACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAgc < 1:2910356/93‑1 (MQ=255) ctgctgACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAgc < 2:9840127/93‑1 (MQ=255) tgctgACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAgcg < 2:5084677/93‑1 (MQ=255) ctgACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGcgcg < 1:9303870/93‑1 (MQ=255) gACCCGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTc < 1:5159952/93‑1 (MQ=255) ccGCTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCt < 1:4114459/93‑1 (MQ=255) | CATGGATACGCTGGGCGCAATGGTGTTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCT > NC_000913/419402‑419581 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |