| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,972,637 | 2 bp→GC | coding (430‑431/546 nt) | wecD → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,972,637 | 0 | C | G | 100.0% | 1221.9 / NA | 377 | R144A (CGT→GCT) | wecD | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (163/214); total (163/214) | |||||||||||
| * | NC_000913 | 3,972,638 | 0 | G | C | 99.7% | 1214.4 / NA | 377 | R144A (CGT→GCT) | wecD | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (162/213); minor base T (0/1); total (163/214) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 383 total aligned reads displayed.
AATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAG > NC_000913/3972553‑3972724 || aaTGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGTTCACGGt < 1:2809079/93‑1 (MQ=255) cGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTaaaa > 2:4494388/1‑93 (MQ=255) cAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaacaa < 2:9566160/93‑1 (MQ=255) cAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaacaa > 2:3816470/1‑93 (MQ=255) cAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAaacaa > 2:6176753/1‑93 (MQ=255) gATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACt > 2:5754841/1‑93 (MQ=255) gATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACt > 1:5881282/1‑93 (MQ=255) tGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACttt > 1:8144201/1‑93 (MQ=255) tGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACttt < 2:9246100/93‑1 (MQ=255) cgAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCgg > 1:4085398/1‑93 (MQ=255) gAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCggg < 1:2020143/93‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGt < 1:2307634/93‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGt < 1:8210149/93‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGt > 1:6759537/1‑93 (MQ=255) aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGt < 2:3491068/93‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGt < 2:8601217/93‑1 (MQ=255) aaTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGt < 2:6405935/93‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTg < 2:1555212/93‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGATGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCATGGTAAAACAACTTTGCGGGTg < 2:2032175/93‑1 (MQ=255) ttGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTgg > 1:4314791/1‑93 (MQ=255) atGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTgg < 1:5168411/92‑1 (MQ=255) tGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGc < 1:9458622/93‑1 (MQ=255) gCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGa > 2:501718/1‑93 (MQ=255) tgctgGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGAccc > 1:1099395/1‑93 (MQ=255) tgctgGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGAccc > 2:7202754/1‑93 (MQ=255) gctggctgGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCa > 2:1320859/1‑93 (MQ=255) ctggctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCaa < 1:6042506/93‑1 (MQ=255) tggctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCaaa > 1:7702242/1‑93 (MQ=255) ggctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCaaag > 1:5398729/1‑92 (MQ=255) gctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATg < 2:7376704/93‑1 (MQ=255) ctggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATgg < 1:9983163/93‑1 (MQ=255) tggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATggg < 2:4419372/93‑1 (MQ=255) ggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGc < 1:5594564/93‑1 (MQ=255) ggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGc < 2:7996418/93‑1 (MQ=255) ggACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGc < 2:2510034/93‑1 (MQ=255) gACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCa < 2:8109669/93‑1 (MQ=255) cgcgGTGGAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTTAAGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAac < 1:9629579/93‑1 (MQ=255) cgcgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAac > 1:460208/1‑93 (MQ=255) gcgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAaca < 2:7570696/93‑1 (MQ=255) gcgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAaca < 1:3713221/93‑1 (MQ=255) cgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAacac < 2:7006067/93‑1 (MQ=255) cgGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAacac < 1:1015665/93‑1 (MQ=255) ggTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAcc < 2:1774756/93‑1 (MQ=255) gTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccg > 2:2824743/1‑93 (MQ=255) gTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccg > 2:6771038/1‑93 (MQ=255) tGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgc > 1:9540395/1‑93 (MQ=255) tGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgc > 1:4873163/1‑93 (MQ=255) tGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgc < 1:6527386/93‑1 (MQ=255) tGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgc > 1:8769169/1‑93 (MQ=255) cAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACAccgccg > 1:6899561/1‑93 (MQ=255) aGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACcgccgc > 2:2672946/1‑93 (MQ=255) ggTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCcgcg > 2:2123270/1‑93 (MQ=255) tGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCt > 2:6591719/1‑93 (MQ=255) ctgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTa > 1:3978788/1‑93 (MQ=255) tgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTaa > 2:7470479/1‑93 (MQ=255) tgagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTaa < 1:4500574/93‑1 (MQ=255) gagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCGAAATGGGCAACACGGCCGCGCTTaaa > 1:3118178/1‑93 (MQ=255) gagctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTaaa < 1:5010076/93‑1 (MQ=255) agctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAAc < 1:2249858/93‑1 (MQ=255) gctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAAct > 1:7576833/1‑92 (MQ=255) gctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACg > 2:4588472/1‑93 (MQ=255) gctgaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGCCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACg > 1:1612143/1‑93 (MQ=255) gaTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGata > 2:1885376/1‑93 (MQ=255) aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTCAACGatac > 2:414399/1‑93 (MQ=255) aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac < 1:8015430/93‑1 (MQ=255) aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac > 1:172197/1‑93 (MQ=255) aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac < 1:1692789/93‑1 (MQ=255) aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac < 1:7282756/93‑1 (MQ=255) aTGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatac < 1:7920544/93‑1 (MQ=255) tGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGataca > 2:9356646/1‑93 (MQ=255) tGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGataca < 1:7090865/93‑1 (MQ=255) tGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGataca < 1:914475/93‑1 (MQ=255) cAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacata < 1:7857531/93‑1 (MQ=255) cAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacata > 1:1398637/1‑93 (MQ=255) aaaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacatac < 1:9269690/93‑1 (MQ=255) aaaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGatacatac > 2:5457642/1‑93 (MQ=255) aaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCACCACCGCCGCGCTTCACCGAtacataca > 1:6447446/1‑93 (MQ=255) aaCGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGAtacataca > 1:6320514/1‑93 (MQ=255) cGGCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACaaa < 2:7344369/93‑1 (MQ=255) ggCGCTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAg < 1:8587671/93‑1 (MQ=255) gcgcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgt > 1:9716134/1‑93 (MQ=255) cgcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtg < 2:9855078/93‑1 (MQ=255) gcTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTGAAACAACTTTGGGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGGTACATACAAAgcgg > 2:5893560/1‑93 (MQ=255) cTAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtggt < 2:3391234/93‑1 (MQ=255) tAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAGTGGGCAACACCGCCGTGCTTAAACGATACATACAAAgtggtg < 1:5279465/93‑1 (MQ=255) tAAACTGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAgtggtg > 2:884585/1‑93 (MQ=255) 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tGGGCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAAt < 1:9809958/93‑1 (MQ=255) ggCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGt > 2:4724041/1‑93 (MQ=255) ggCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGt < 1:7456934/93‑1 (MQ=255) ggCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCACTTAAACGATACATACAAAGTGGCGCGTAtct > 2:8433519/1‑91 (MQ=255) gCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTa < 1:5997104/93‑1 (MQ=255) gCGTATGCTCACGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTa < 2:92620/93‑1 (MQ=255) || AATGCGACAGATGCGCGAATTGGCCTGCTGGCTGGACGCGGTGCAGGTGCTGAGCTGATGCAAACGGCGCTAAACTGGGCGTATCGTCGCGGTAAAACAACTTTGCGGGTGGCGACCCAAATGGGCAACACCGCCGCGCTTAAACGATACATACAAAGTGGTGCGAATGTAG > NC_000913/3972553‑3972724 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |